Изучение геномного полиморфизма представителей подсемейства Bovinae

• Автор: Васильев, Василий Александрович
• Шифр специальности: 03.00.26
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2000
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 123 с. : ил.

Мы использовали как стандартные, ранее описанные мультилокусные маркеры, так и получили ряд новых маркеров. Для выяснения характера наследования маркеров разных типов и установления особенностей внутри и межпопуляционной изменчивости нами изучены разные виды Быков, разводимые в неволе на территории России и Украины. Помимо пород домашней коровы, стад зубра и бизона, мы исследовали отдельных представителей других видов Быков, распространенных в юговосточной Азии и Африке, а также несколько межвидовых межродовых гибридов. Этот материал послужил источником для установления филогенетических связей среди Быков. Быков мини и микросателлитн ые. А Рмаркеры. Быков семейном, внутри и межпородном, межвидовом. Полиморфизм ДНК может быть определен различными способами. Чаше всего используют обработку ДНК рестрицируюшими эндонуклеазами с последующим электрофоретическим разделением полученной смеси и определением длин рестрикционных фрагментов. В основе этого подхода лежит тог факт, что разные аллели одного локуса у разных индивидуумов различаются по нуклеотидному составу. В результате этого происходит изменение сайтов узнавания для той или другой ристр и пирующей эндонуклеазы и, соответственно, расстояний между ними сайтами, что приводит к получению смесей продуктов рестрикции, в которых длина гомологичных фрагментов у разных индивидуумов будет различаться. ДНК будет тестироваться как полиморфизм длин рестрикционных фрагментов ПДРФ. ПДРФ можно относительно просто тестировать одновременно у большого числа индивидуумов, что позволяет проводить широкомасштабные популяционные, генеалогические и эволюционные исследования i , , , , Сулимова и др . Основной причиной, приводящей к возникновению полиморфизма ДНК. Для сравнительно небольших геномов митохондриальные и хлорол. ДНК, геномы низших эукариот различия в длинах рестрикционных фрагментов ДНК можно тестировать сразу после их электрофоретического разделения. Однако для образцов ДНК высших эукариот невозможно получить четкие различия в распределении длин фрагментов, так как большое число разнообразных продуктов рестрикции приводит, как правило, к образованию шмера. Ноэтомч фрагменты ДНК переносят из геля на твердую подложку, такую, как нитроцеллю. ДНК. Гибридизационные зонды необходимы для выявления тех фрагментов, которые относятся к определенному интересующему исследователя участку хромосомы или локусу гену. Д.Ьогетейн с соавторами впервые высказали гипотезу о том, что любые анонимные последовательности ДНК сами по себе могут служи гь многочисленными маркерами полиморфизма и использоваться для генетического анализа. Эти авторы совместно с Р. Вайтом сформулировали универсальный принцип генетического маркирования с помощью случайных ДНКзондов. Было показано, что варианты ПДРФ наследуются обычно как простые менделевские признаки. Поскольку они используются как нейтральные маркеры, любой генетический признак, сегрегирующий в поколениях, в принципе, может быть маркирован определенным вариантом ДРФ. ДНК i . ПДРФ. Однако ценность любого маркера, в гом числе и ПДРФ. Считается, что полиморфный маркер достаточно информативен и ценен, если число его аллельных вариантов 6 i. В связи с этим актуальной стала проблема поиска более информативных ДНКмаркеров, способных выявлять области генома повышенной вариабельности, для которых была бы характерна многоаллельность и, соответственно. Известно, что геном всех эукариот, включает в себя не только уникальные, но и повторяющиеся в разной степени последовательности ДНК. Выло отмечено, что тандем но организованные повторяющиеся последовательности ДНК. Подобный полиморфизм отмстили Хамада с соавт. ДНК. Такая НК представляла собой протяженные участки пуринпиримидинового динуклеотида ТС, разбросанные по геному и варьирующие по длине I . А. Виман и Р. Вайтом в году был открыт так называемый гипервариабельный мультиаллельный локус в геноме человека, который по структуре представлял собой повторяющиеся олигонуклеотидные звенья . Позднее подобные локусы были обнаружены в других участках человеческого генома в инсулиновом гене .