Молекулярно-генетические особенности семейного аденоматозного полипоза

• Автор: Музаффарова, Татьяна Александровна
• Шифр специальности: 03.00.15
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2005
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 120 с. : 13 ил.

СОДЕРЖАНИЕ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ.

ВВЕДЕНИЕ

ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.

1. Семейный аденоматозный полипоз САП

2. Структура гена АРС

3. Функции гена АРС

3.1 Тен АРС супрессор опухолевого роста.

3.2. Функция гена АРС в

3.3.Влияние белка АРС на клеточную миграцию и адгезию

3.4.Мутации в гене АРС и хромосомная нестабильность

4. Структура белка АРС.
5. Герминальные мутации в гене АРС.
5.1 .Номенклатура мутаций.
5.2. Спектр герминальных мутаций в гене АРС.
5.3.Происхождение мутаций в гене АРС
6. Анализ гаплотипов гена АРС
7. Связь генотипа с фенотипическими проявлениями САП
8. САП без мутаций в гене АРС
9. АРС миссенсварианты
МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ.
1. Пациенты.
2. Анализ первичной структуры гена АРС и гена МУН.
2.1. Выделение ДНК
2.2. ПЦР полимеразная цепная реакция
2.3. Оценка ка чества ПЦР.
2.4. Образование гетеродуплексных фрагментов ДНК
2.5. Электрофорез.
2.6. Окраска геля.
2.7. Секвенирование.
2.8. Анализ гаплотипов гена АРС.
3. Статистическая обработка результатов.
РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ.
1. Выявление особенностей первичной
структуры ДНК в гене АРС
2. Спектр и характеристики мутаций в гене АРС при САП.
2.1. Типы мутаций в гене АРС
2.2. Распределение мутаций по гену АРС
2.3. Новые мутации в гене АРС.
2.4. Повторяющиеся мутации в гене АРС.
2.5. Миссенсмутации в гене АРС.
3. Генетическая и фенотипическая гетерогенность САП.
4. Однонуклеотидные полиморфизмы ОНИ в гене АРС.
4.1.I в гене в контрольной выборке.
4.2.0НП в гене А при повторяющихся мутациях
5 и 5.
4.3. ОНИ в гене АР С при САП с отсутствием мутаций в этом гене.
5. Исследование вариантов гена у пациентов с САП
без мутаций в гене АРС.
6. ДНКдиагностика САП
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ


Мутации данного гена приводят почти к 0 риску возникновения заболевания. За прошедший после выделения гена период накоплена значительная информация о наследуемых мутациях в гене АРС. Известно, в частности, что мутации распределены по всему гену. Рис. Структура заболеваемости населения России злокачественными новообразованиями в году . Аксель Е. М., Давыдов М. Определение спектра мутаций в различных популяциях важно как с точки зрения фундаментальных знаний об особенностях мутационного процесса в разных популяциях, так и для решения практических задач медицинской генетики. Изучение характеристик мутаций на выборках из разных популяций позволит получить фундаментальную информацию по возникновению и распространению мутаций, их связи с клиническими проявлениями в составе разных генотипов. Требуют исследования характеристики и молекулярные механизмы происхождения так называемых новых мутаций, в значительном числе обнаруживаемых в различных популяциях. САП и РТК не исследована. ОНП при повторяющихся мутациях в гене АРС не дают возможности для прояснения роли эффекта основателя в их распространении. В рассматриваемом направлении необходимы дальнейшие исследования, расширяющие объем данных и охватывающие больший круг различных популяций. САП в некоторых семьях не сцеплен с локусом 5. Недавно было обнаружено, что часть заболеваний САП обусловлена мутациями в гене . Однако к настоящему времени имеется мало данных об особенностях вариаций первичной структуры в данном гене при САП и РТК. Их расширение, особенно для разных популяций,необходимо. С учетом склонности семейного аденоматоза к развитию рака толстой кишки, чрезвычайно важна ранняя диагностика заболевания у пациентов и членов их семей, позволяющая вести за больными регулярное динамическое наблюдение и предпринимать лечебные мероприятия до возникновения озлокачествления полипов Кузьминов и др. Запоздалая клиническая диагностика во многих случаях этого онкологического заболевания обусловливает существенное сокращение продолжительности жизни, несмотря на лечение. Выявление мутаций в генах АРС и обеспечивает объективный критерий для формирования групп риска САП с целью его профилактики и своевременной диагностики в случае возникновения заболевания. В связи со сказанным, целью настоящей работы было исследование молекулярногенетических особенностей семейного аденоматозного полипоза, основанное на анализе изменений первичной структуры генов ЛРС и . среди больных САП при отсутствии мутаций в гене АРС. Научнопрактическая значимость работы. Научнопрактическая значимость результатов настоящей работы обусловлена выявлением спектра и характеристик мутаций в генах АРС и при семейном аденоматозном полипозе на российской выборке больных. Выявленная доля около двух мутаций в спектре имеет существенное значение для практической ДНКдиагностики САП. Разработан оптимизированный способ обнаружения мутаций в гене АРС. Способ был применен для выявления мутаций в семьях с САП. Новизна полученных результатов. Впервые выявлен спектр мутаций в генах АРС и на выборке больных САП в России. Показано, что частота мутаций 5, 5 составляет около трети в спектре мутаций в гене АРС. Преимущественная связь этих мутаций с определенным гаплотипом указывает на возможную роль эффекта основателя в их распространении. Обнаружено новых мутаций в гене АРС и одна в гене . Впервые выявлены структурные особенности новых делеций в гене АРС, которые, как показано в работе, присущи выборкам больных из ряда популяций. Среди больных САП без мутаций в гене АРС по генетическим признакам выделены две подгруппы. Показано фенотипическое и генотипическое различие указанных подгрупп. При анализе ОНП в гене АРС без мутаций в данном гене выявлены варианты этого гена, ассоциированные с САП. Положения, выносимые на защиту. Выявлены спектр и характеристики мутаций в гене АРС при САП. Новые мутации составили около половины от всех мутаций. Р 0,. Показана статистически значимая ассоциация повторяющихся мутаций