Анализ ассоциаций полиморфных вариантов митохондриального генома и гена митохондриальной гамма ДНК-полимеразы с фенотипами сердечно-сосудистого кантинуума

• Автор: Буйкин, Степан Вячеславович
• Шифр специальности: 03.00.15
• Научная степень: Кандидатская
• Количество страниц: 214 с.

ОГЛАВЛЕНИЕ

Список сокращений

Введение

Глава 1. Обзор литературы

1.1. Общие положения митохондриальной генетики

1.1.1. История изучения митохондрий и мтДНК

1.1.2. Структурнофункциональная характеристика митохондриального генома

1.1.3. Полиморфизм мтДНК в.популяциях человека

1.1.4. Взаимодействие мтДНК и ядерных генов

1.2. Митохондриальная ДНК и фенотипы норма и патология

1.2.1. Митохондриальная ДНК и вариации нормы

1.2.2. Митохондриальные болезни
1.2.3. Митохондриальная ДНК и мультифакториальная патология Глава 2. Материал и методы
2.1. Характеристика обследованных групп населения
2.2. Характеристика методов исследования .
2.2.1. Клиниколабораторные методы
2.2.2. Молекулярногенетические методы
2.2.3. Биометрические методы
Глава 3. Результаты и обсуждение
3.1. Популяционный полиморфизм гена и мтДНК
3.2. Анализ фенотипической изменчивости количественных признаков в группах алтайцев, якутов, тувинцев, русских и больных эссенциальной гипертензией
3.2.1. Фенотипическая изменчивость количественных признаков и зависимость от пола и возраста
3.2.2. Комплексный анализ фенотипической изменчивости
количественных признаков
3.3. Ассоциация эндофенотипов сердечнососудистой системы с молекулярногенетическими маркерами
3.3.1. Анализ ассоциаций у алтайцев
3.3.2. Анализ ассоциаций у якутов
3.3.3. Анализ ассоциаций у тувинцев
3.3.4. Анализ ассоциаций у русских г. Томска
3.3.5. Анализ ассоциаций у больных эссенциальной гипертонией
3.4. Оценка этнической специфики влияния митохондриального генома 6 на фенотип
Заключение
Выводы
Литература


Считается, что праймеры для начала синтеза ДНК генерируются путем расщепления транскрипта цепи с помощью митохондриальной процессинговой РНКазы , которая расщепляет РНК в позиции между II и III . ., . экзонуклсазы . ., . ., . связывается с петлей на всем ее протяжении, через каждые п. I, но не с II и III. Предполагают, что играет важную роль в переходе от РНК к синтезу ДНК ivii . . . Инициация репликации тяжелой цепи проходит при участии полимеразы гамма . Это единственный вид полимеразы у позвоночных, участвующей в процессе синтеза мтДНК i Р. . . . Репликация Нцепи начинается в Оц и идет с вытеснением исходной Нцепи. После прохождения двух третей генома, репликационная вилка доходит до сайта начала репликации цепи. Тогда инициируется процесс репликации цепн с помощью специфической праймазы, содержащей цитозольную рРНК . . . цепи по смещенной матрице Нцепи. Регулирующим моментом в поддержании гомеостаза необходимого количества мтДНК является . Уровень синтеза зависит от количества мтДНК в клетке . ., С. Т., МЛ. В течение репликации мтДНК создает трех цепочечную структуру, называемую петлей рис. З. Инициирование транскрипции в промоторе цепи приводит к синтезу РНК, которая остается точно ассоциированной с ДНК в области высоко консервативных блоков. Смещающаяся в результате этого цепь ДНК формирует так называемую петлю. петля формируется, когда начинает синтезироваться Нцепь и происходит преодоление тормозящей последовательности . , . Физиологическая роль петли не до конца понятна. Однако известно, что токсин, вызывающий экспериментальную модель болезни Паркинсона у мышей, ингибирует репликацию мтДНК за счет дестабилизации петли . Рис. Схема инициации транскрипционного комплекса мтДНК. Наиболее ранние работы , . . . . ДНК у приматов и человека, а также среди представителей различных рас, показали высокую информативность мтДНК в решении ряда проблем эволюционной и популяционной генетики. ДНК i . . . ДНК в ряду поколений, в связи с отсутствием рекомбинации меньший эффективный размер популяции по сравнению с любым ядерным маркером наличие эффекта гетероплазмии, как в одной митохондрии, так и во всем организме, что в результате сегрегации может быть причиной перехода к новому мтДНК генотипу за одно поколение. ДНК отличается от универсального В. i М. i . ., . ., . Расшифровка в году Андерсоном . ДНК человека позволило исследователям получить универсальный стандарт для изучения разнообразия митохондриального генофонда народонаселения. Существует два наиболее распространенных подхода к описанию полиморфизма мтДНК в популяциях мирового народонаселения. Первый использование рестрикционного анализа всей мтДНК и определение хмитотипов гаплотипов для выделения популяционноспецифических типов мтДЫК i . , . На основе данных рестрикционного анализа типы мтДНК объединяются в континент специфические группы, или гаплогруппы, которые могт описывать до 0 общего разнообразия мтДНК населения отдельных регионов i . Второй это исследование полиморфизма главной некодирующей области петли мтДНК, с помощью методов рестрикционного анализа или секвенирования первичной нуклеотидной последовательности ДИК Чсмерис . . и др. Наиболее полиморфным участком в контрольном регионе является домен, расположенный между позициями 4 п. VI Vii . Полиморфизм главной некодирующей области, а именно ее первого гипервариабельного сегмента VI может на данный момент считаться наиболее изученным в популяционном плане Бермншева М. А. и др. Несмотря на большое разнообразие индивидуальных линий мтДНК, показано, что эти гаплотипы могут быть объединены в группы по результатам филогенетического анализа. Так, для населения Европы и Ближнего Востока выявлено пять таких гаплогрупп, объединяющих близкородственные гаплогипы на основе наиболее устойчивых ассоциаций нуклеотидных замен i . i М.