Методы определения силы сцепления на основе популяционно-генеалогических данных и их применение к картированию генов крупного рогатого скота

• Автор: Никифоров, Виталий Сергеевич
• Шифр специальности: 03.00.15
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 1984
• Место защиты: Сыктывкар
• Количество страниц: 164 c. : ил

1.Картирующая функция . . . 4 . . 2.Оценка вероятности рекомбинаций между парой генов
ГЛАВА 2. ПОЛУЧЕНИЕ ОЦЕНОК ВЕРОЯТНОСТИ РЕКОМБИНАЦИИ МЕВДУ ПАРОЙ ЛОКУСОВ НА ОС НОВЕ ПОПУЛЯЦИОННОГЕНЕАЛОГИЧЕСКИХ ДАННЫХ, СОДЕРЖАЩИХ ОПРЕДЕЛЕННЫЙ ПРОЦЕНТ ОШИБОЧНЫХ СВЕДЕНИЙ О РОДСТВЕННЫХ СВЯЗЯХ ВКЛЮЧАЕМЫХ В АНАЛИЗ

1.Априорная вероятность семьи, при установлении состава которой могли

2.Применение формулы Байеса для получения интервальной оценки вероятности рекомбинации меящу заданной парой локусов по результатам вычислений априорных вероятностей наблюдаемых семей.

быть допущены ошибки

ГЛАВА 3. ОЦЕНКА ЗНАЧЕНИЙ ПАРАМЕТРОВ, ИСХОД

НЫХ ДЛЯ РАСЧЕТОВ АПРИОРНОЙ ВЕРОЯТНОСТИ ФОРМАЛЬНОЙ СЕМЬИ, УСТАНОВЛЕННОЙ ПО ДАННЫМ ЗООТЕХНИЧЕСКОГО УЧЕТА

1. Генотипы истинных родителей члена

формальной семьи.

2. Сравнительная жизнеспособность

различных генотипов .

3. Использование данных о фенотипах установленных по данным зоотехнического учета детей с.х. животного для оценки вероятности принадлежности его к тому
или иному генотипу
ГЛАВА 4. ПРИМЕНЕНИЕ ЭВМ ДЯЯ ПОЛУЧЕНИЯ ОЦЕНОК
ВЕРОЯТНОСТИ РЕКОМБИНАЦИИ ГЕНОВ МЕТОДОМ АНАЛИЗА ПОПУЛЯЦИОННОГЕНЕАЛОГИЧЕСКИХ ДАННЫХ. ИССЛЕДОВАНИЕ ИНФОРМАТИВНОСТИ
ЭТОГО МЕТОДА.
1. Комплексы программ для вычисления
оценок вероятности рекомбинации мевду
парой двухаллельных кодоминантных генов .
2. Исследование с помощью генетикостохастических экспериментов эффективности и точности методов оценки вероятностей рекомбинаций на основе популяционногенеалогических данных.
ГЛАВА 5. ИССЛЕДОВАНИЕ СЦЕПЛЕНИЯ МЕВДУ ГЕНАМИ
КРУПНОГО РОГАТОГО СКОТА
1. Отношение сцепления между генами, контролирующими структуру белков в крови и в молоке крупного рогатого
скота обзор литературы
2. Материалы и методики
3. Результаты и обсуящение .
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
ЛИТЕРАТУРА
ПРИЛОЖЕНИЕ. БЛОКСХЕМЫ ПРОГРАММ ДЛЯ ОПРЕДЕЛЕНИЯ ОЦЕНОК ВЕРОЯТНОСТИ РЕКОМБИНАЦИИ ГЕНОВ МЕТОДОМ АНАЛИЗА ПОПУЛЯЦИОННОГЕНЕАЛОГИЧЕСКИХ ДАННЫХ И ДЛЯ ИССЛЕДОВАНИЯ ЭТОГО МЕТОДА
ВВЕДЕНИЕ
Актуальность


Минск и на спецсеминаре Института цитологии и генетики СО АН СССР г. Новосибирск. Материалы. В основу диссертации положены результаты, полученные автором в период с по гг. Института биологии Коми филиала АН СССР. Для апробации методических разработок использованы популяционногенеалогические данные, характеризующие стада крупного рогатого скота ряда племенных хозяйств Коми АССР, а также Архангельской и Ленинградской областей. Эти материалы были любезно предоставлены в распоряжение автора сотрудником лаборатории экологии и генетики животных Коми филиала АН СССР В. С.Матюковым и сотрудниками лаборатории селекции молочного скота по белковомолочности Всесоюзного научноисследовательского института разведения и генетики животных А. А.Сноповой, 3. П.Любимовой и Л. Ф.Тарасевич, за что он выражает им здесь свою глубокую признательность. ГЛАВА . Методологическим основанием для построения генетических карт служат ядернохромосомная теория наследственности и принцип линейного расположения генов в хромосоме. Гипотеза о ядерной локализации детерминантов наследственных свойств клетки возникла, повидимому, уже в х годах минувшего столетия, т. Менделя , с. Предположение о том, что носителями наследственности в ядре являются хромосомы и что в хромосомах структуры, соответствующие единицам наследственности, расположены линейно, впервые было вьщвинуто в г. Вильгельмом Ру и послужило основой для опубликованной в г. Вейсмана. Первые экспериментальные доказательства причастности хромосом к процессу передачи наследственной информации получены в г. Бовери , показавшим также индивидуальность и дифференциальную роль хромосом в этом процессе. В г. Сэттон 1, развивая идею о связи между хромосомами и генами аллеломорфами, по его терминологии, дал физическое обосног ,вание явлению сцепления генов. В г. Морган 7 , опираясь на концепцию хиазмотипии Янсена и несколько конкретизировав принцип линейного размещения генов в хромосоме, объяснил в рамках гипотезы СэттонаБовери неполное сцепление генов, наблюдавшееся им у дрозофилы. Наконец, в г, исходя из принципа линейности в формулировке Моргана, Стертевант 0 построил первую генетическую карту. Конечно, успех Стертеванта, как совершенно справедливо отмечают, например, Шульт и Дезбороу 3 , не доказывает, что гены расположены на хромосоме линейно. Но дальнейшие исследования Моргана и его сотрудников см. Это обстоятельство существенно повысило правдоподобность соответствующих предположений. В результате они завоевали всеобщее признание, и теперь, в свете современных данных, основанных на достижениях молекулярной генетики, биохимии и электронной микроскопии, самым универсальным принципом генетической организации всех живых существ. Признание принципа линейности позволяет определять расстояние между генами как функцию от вероятности рекомбинации мезду ними во всех тех случаях, когда для определения порядка размещения генов на хромосоме может быть принят критерий Стертеванта 0 , см. Действительно, признание принципа линейности позволяет с достаточной для прикладных целей корректностью рассматривать совокупность расположенных в одной хромосоме генов как линейно упорядоченное одномерное многообразие как одномерное топологическое пространство 6, кн. З , в котором гену соответствует точка или при большей детализации интервал. В этом легко убедиться, сопоставив свойства точек такого многообразия пространства 6, кн. Конечно, нет никаких гарантий соблюдения этого условия в каждом конкретном случае. Но, хотя проблема приемлемости критерия Стертеванта и обсуждается 2 очевидно, что наблюдаемое соответствие между генетическими и цитологическими картами хромосом см. Л многообразия. Здесь и далее символ Ч означает бинарное отношение предшествовать . А этот случай как раз и имеет место всегда, когда приемлем критерий Стертеванта. ЦКХ 4 0,5. Такая формулировка условий применимости критерия Стертеванта для определения порядка генов на хромосоме представляется нам полезной при решении вопроса о соблюдении этих условий. Но, к сожалению, в литературе нам обнаружить ее не удалось.