Генетическая информативность 3'UTR (TC→CA)- и del425- полиморфизмов гена c-fms человека

• Автор: Кузнецова, Татьяна Николаевна
• Шифр специальности: 03.00.15
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2004
• Место защиты: Новосибирск
• Количество страниц: 138 с. : ил.

ОГЛАВЛЕНИЕ
Введсннс

Список сокращений

Обзор литературы

Глава 1. Некоторые молекулярногенетические подходы к анализу

сложных признаков.

Глава 2. Молекулярная биология МСБР и его рецептора.

2.1. Макрофаг колоннссти.мулнрующнй фактор МСБР.

2.2. Экспрессия и структура МСБР.

2.3. Рецептор МСЗИ структура и молекулярные механизмы его функционирования.

2.3.1. Ш класс семейства ЛТКклеточноповерхлостных белков.

2.3.2. Структура РМБ и его кртоворот в клетке.
2.4. Трансформирующий потенциал стз протоонкогена.
2.5. Передача сигназа МСБРЯ в ответ на действие МСБР.
а МСБРиндуцированный пролиферативный ответ клеток и выживание.
б МСБРиндуцированная дифференциация моноцнтарных фагоцитов.
2.6. Структура гена ст, регуляция его экспреснн.
Заключение к главе 2.
Глава 3. Влияние ионизирующего облучения на генофонд популяций.
3.1. Генетические последствия облучения самцов млекопитающих.
3.2. Генетические последствия облучения самок млекопитающих.
3.3. Генетические последствия облучения самок и самцов млекопитающих.
3.4. Генетические последствия облучения человека.
3.5.1. Характеристика радиоактивного загрязнения Алтайского края со стороны Семипалатинского полигона. Состояние здоровья населения в некоторых районах Атгайского края.
3.5.2. Характеристика радиоактивного загрязнения территории Уратьского региона со стороны ПО Маяк. Состояние здоровья населения, подвергшегося радиационному воздействию.
Материалы и методы
Результаты
ф 1.1. Поиск и обнаружение полиморфных сайтов в интронс и 3нстранслируе.мой
области гена снг.
1.2. Популяционные различия в распространении разных аллелей, генотипов и галлотипов исследуемых полиморфизмов генасуиз.
а Определение частот аллелей и генотипов по полиморфным сайтам 1 и 2 гена ст в некоторых этнических группах России и популяции канадских эскимосов.
б Анализ распространенности апелей и генотипов делеционного полиморфизма в ом нитроне гена стх полиморфный сайт 3, бс человека с использованием модифицированного метода аглельспецифической ПЦР.
в Оценка частот галлотипов по ЗЧЛШ и се5 полиморфизмам гена суяз в некоторых этнических группах Евразии и популяции канадских эскимосов.
с Распределение апелей и генотипов по полиморфизмам 1е и ЗЦТЯ ТССА генаст в различных возрастных группах некоторых популяций России.
1.3. Контекстный анализ нуклеотидных последовательностей ДНК в местах нахождения полиморфных сайтов в гене спи.
1.4. Изучение ассоциаций апельных вариантов гена ст5 с различными фенотипическими признаками женщин и патологиями различной этиологии.
1.5. а Оценка возможных изменений в распределении вариантов аллелей и генотипов, экспрессирующихся в макрофагах генов слз, СС2, СС5 в генофонде немцев Алтайского края в ответ на воздействие радиации.
б Частоты апелей и генотипов по полиморфизмам 1е и ЗЦТК ТССА гена спи в популяции русских, проживающих по течению р.Тсча Челябинская обл., подвергшихся радиационному воздействию со стороны ПО Маяк.
Обсуждение
1.1. Оценка степени информативности выбранных для молекулярноэпидемиологического анализа полиморфных сайтов в гене суяз человека.
1.2. Полиморфизмы ЗЦТЯ и бе5 гена спз являются информативными генетическими маркерами для оценки последствий воздействия радиации на популяции
человека
Выводы
Синеок литературы
Введение
Актуальность


Я. Автор также благодарен руководителям программы Семипалатинский полигон Шойхету Я. Н. и Киселеву В. И. за предоставленную возможность сбора эпидемиологического материала в районах Алтайского края, а также директору Уральского центра радиационной медицины Аклееву за биологический материал от лиц, проживающих в Уральском регионе. Исследования были выполнены при финансовой поддержке гранта комплексного проекта Семипалатинский полигон гг. Интеграционных грантов СО РАН в течение гг. ТМ трансмс. Некоторые молекулярногенетические подходы к анализу сложных признаков. Наличие наследуемой компоненты при патологиях, которые прослеживаются при семейном анализе, представляется в настоящее время очевидным. Известно, что мендслевский характер наследования доказан только для небольшого числа заболеваний, для большинства заболеваний характер наследования неизвестен или до конца не ясен по материалам обзора Вабапо с1 а1. Многие исследователи полагают, что возникновение этих мультифакториальных заболеваний обусловлено суммарным вкладом множества генов, а по мнению других развитие таких патологий может быть связано с нарушением отсутствия генетического контроля со стороны главного гена. Согласно обеим моделям предполагается фенотипическое проявление генетической компоненты предрасположенности к возникновению заболеваний, которая может проявляться при наличии провоцирующего фактора внешней среды. Концептуально, основная задача исследований сводится к нахождению генов, структурные изменения в которых могут быть причинно связаны с развитием заболеваний сложной природы. Однако, методическое решение задачи осложнено следующими обстоятельствами несмотря на существенную роботизацию современной техники анализа нуклеотидных последовательностей и структурных вариаций в них, идентификация простым перебором десятков тысяч локусов генома небольшой группы генов, причинно связанной с возникновением конкретной патологии, представляется невероятно трудоемкой задачей. Кроме того, большинство генов характеризуются наличием значительного числа полиморфных сайтов особенно в некодирующих участках, которые могут обуславливать разные функциональные проявления гена, в том числе патологические. Из тотального анализа структуры ДНК человека следует, что структурная вариабельность в виде одно нуклеотидных полиморфизмов ОШ1 представляет собой наиболее распространенный тип генетической изменчивости в геноме. Существенно меньше обнаружено делений ннссрций разной протяженности. Наибольший вклад в этот тип изменчивости вносят повторяющиеся ДНК микро и минисателлиты, различающиеся в аллельных вариантах не только числом, но и строением мономеров. Гетерохроматиновые участки ДНК, не транскрибируемые в онтогенезе как правило, Сгетерохроматнн могут значительно различаться содержанием сателлитной ДНК разного размера, ЫЕ, ЫЫЕб и пссвдогснами. Ii i , . Как было показано при парном сравнении хромосомных последовательностей, ОНП встречаются в среднем каждые тыс. ОНП имеют низкую скорость обратных мутаций, что позволяет использовать их в виде стабильных индикаторов истории развития человеческого генома. К тому же ОНП относительно легко выявлять. К настоящему моменту составлена карта распределения около 1. ОНП в геноме человека i . Таблица 1. Из данных следует, что большинство идентифицированных ОНП сосредоточены в нскодирующих областях генов. Постоянно выявляемые ОНП систематизируются и заносятся в существующие сетевые базы данных . Обычно используются следующие методики для идентификации нуклеотидного полиморфизма НП i . ДНКчипы . Таблица 1. Типология ОНП и представленность в геноме из статьи i . Тип Описание Число и тыс. Одним из подходов к выявлению генов, вовлеченных в развитие патологического процесса, является анализ ассоциаций v . Примером исследования ассоциаций является семейный анализ методы i iv i и ii iiii Лксенович Т. Н. . Другим способом изучения ассоциаций между болезнью и маркером является сравнение частот аллелей и генотипов маркерного локуса в группах больных и здоровых индивидуумов .