Молекулярная филогеография коренного населения Северной Азии по данным об изменчивости митохондриальной ДНК

• Автор: Деренко, Мирослава Васильевна
• Шифр специальности: 03.00.15
• Научная степень: Докторская
• Год защиты: 2009
• Место защиты: Магадан
• Количество страниц: 423 с. : ил.

ВВЕДЕНИЕ.

1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.

1.1. Структурнофункциональная организация митохондриального генома человека

1.1.1. Общая характеристика мтДНК человека

1.1.2. Главная некодирующая область мтДНК или контрольный регион

1.2. Изменчивость мтДНК и эволюция человека.

1.2.1. Изменчивость и механизмы эволюции мтДНК

1.2.2. Скорость накопления мутаций в мтДНК

1.2.3. Ранние этапы эволюции человека по данным об изменчивости мтДНК

1.2.4. Заселение Евразии по данным об изменчивости мтДНК

1.3. Классификация и филогеография мтДНК человека.

1.3.1. Изменчивость мтДНК в Африке
1.3.2. Изменчивость мтДНК вне Африки
1.3.3. Заселение Америки по данным об изменчивости мтДНК
1.3.4. Исследования изменчивости мтДНК в популяциях Северной Азии.
1.4. Этническая история коренного населения Северной Азии.
1.4.1. Заселение Северной Азии по данным археологии и палеоантропологии .
1.4.2. Этногенез эвенков
1.4.3. Этногенез эвенов.
1.4.4. Этногенез шорцев.
1.4.5. Этногенез хакасов
1.4.6. Этногенез тувинцев.
1.4.7. Этногенез тофаларов
1.4.8. Этногенез сойотов
1.4.9. Этногенез якутов.
1.4 Этногенез бурят.
1.4 Этногенез баргутов
1.4 Этногенез хамниган.
1.4 Этногенез калмыков.
1.4 Этногенез алтайцев.
1.4 Этногенез алтайских казахов
1.4 Этногенез коряков
1.4 Этногенез чукчей.
2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ
2.1. Материалы
2.2. Методы исследования.
2.2.1. Выделение и очистка ДНК
2.2.2. Полимеразная цепная реакция и определение нуклеотидных последовательностей ГВС1 и ГВС2 мтДНК.
2.2.3. Рестрикционный анализ мтДНК.
2.2.4. Определение нуклеотидных последовательностей целых молекул ,
мтДНК.8
2.2.5. Статистический и филогенетический анализ данных об изменчивости мтДНК.
3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ.
3.1. Структура и разнообразие митохондриальных генофондов этнических групп Северной Евразии
3.1.1. Структура митохондриальных генофондов этнических групп Западной, Центральной, Восточной и Северной Азии
3.1.2. Структура митохондриального генофонда русского населения европейской части России
3.1.3. Разнообразие митохондриальных генофондов этнических групп Западной, Центральной, Восточной и Северной Азии
3.1.4. Генетическая дифференциация этнических групп Северной Азии.
3.1.5. Генетические взаимоотношения между этническими группами Северной Азии.
3.2. Филогеография линий мтДНК генофондов этнических групп Северной Азии.
3.2.1. Идентификация западноевразийских линий генофондов этнических групп Северной Азии по данным об изменчивости контрольного региона мтДНК
3.2.2. Идентификация западноевразийских линий генофондов этнических
групп Северной Азии по данным об изменчивости целых молекул мтДНК .
3.2.2.1. Филогения линий мтДНК гаплогруппы Х2е
3.2.2.2. Филогения линий мтДНК гаплогруппы 1.
3.2.2.3. Филогения линий мтДНК гаплогруппы ЛЬ.
3.2.2.4. Филогения линий мтДНК гаплогруппы Л4.
3.2.2.5. Филогения линий мтДНК гаплогруппы НУ
3.2.3. Идентификация восточноевразийских линий генофондов этнических
групп Северной Азии по данным об изменчивости целых молекул мтДНК
3.2.3.1. Филогения линий мтДНК гаплогруппы А.
3.2.3.2. Филогения линий мтДНК гаплогруппы У.
3.2.3.3. Филогения линий мтДНК гаплогруппы М9.
3.2.3.4. Филогения линий мтДНК гаплогруппы М7.
3.2.3.5. Филогения линий мтДНК гаплогруппы О.
3.2.3.6. Филогения линий мтДНК гаплогруппы С.
3.2.3.7. Филогения линий мтДНК гаплогруппы Э.
3.3. Характер распределения несинонимичных и синонимичных замен в группах мтДНК у населения Северной Азии
4. ЗАКЛЮЧЕНИЕ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ ПРИЛОЖЕНИЕ
ВВЕДЕНИЕ


В частности, сравнительные данные об изменчивости нуклеотидных последовательностей пяти генов хромосомы у представителей пяти континентов показали что наиболее древними генетическими вариантами характеризуются все те же койсаны Южной Африки, а возраст общего предка человека составляет около тыс. Монофилетическое происхождение i, показанное в работе Сапп . II был замещен без смешения появившимися из Африки более прогрессивными формами Я i. Аналогичная в своем роде история, повидимому, повторилась тыс. Европе. Археологические и палеоантропологические данные свидетельствуют о том, что Европа была заселена анатомически современными формами Я. Сог ласно двум существующим моделям, происхождение европейцев было связано либо с преобразованиями в Я. Я. . Европу протокроманьонцами II. Переднюю Азию уже 0 тыс. V, . Согласно археологическим данным в Европе и Передней Азии неандертальцы исчезли примерно тыс. Тем не менее, неандертальцы были современниками . Европы в период тыс. Однако результаты анализа изменчивости мтДНК в европейских популяциях показали, что генофонд европейцев не включает в свой состав настолько отличающиеся последовательности мтДНК, которые могли бы претендовать на роль неандертальских i . Можно считать, что окончательно эта проблема была разрешена после секвенирования ГВС1 и ГВС2 мтДНК у пятнадцати и двух неандертальцев, соответственно i . ДНК из костных останков хорватского неандертальца возрастом около тыс. Различия между нуклеотидными последовательностями мтДНК неандертальцев и современных людей оказались настолько существенными, что они полностью сняли вопрос о смешении по материнской линии между людьми и неандертальцами. Кроме того, полученные данные свидетельствуют о том, что дивергенция между людьми и неандертальцами произошла 0 0 тыс. Крайне интересным результатом палеогенетических исследований является расширение ареала неандертальцев на восток . Анализ мтДНК. ТешикТаш в Узбекистане и в пещере Окладникова на Алтае показал, что эти кости принадлежали неандертальцам. Кроме того, мтДНК азиатских и европейских неандертальцев оказалась весьма сходной, что свидетельствует об относительно недавней колонизации неандертальцами Центральной Азии и Южной Сибири . Рисунок 2. Ареал неандертальцев по . Ареал по данным палеоантропологии затемнен темносерым цветом. Ареал, основанный на данных об изменчивости мтДНК, отмечен светлосерым цветом. Кружками указаны места находок неандертальцев, для которых получены данные об изменчивости мтДНК. После подтверждения гипотезы африканского происхождения человека были предложены различные сценарии выхода населения из Африки и последующего расселения на территориях Евразии. Они различаются как количеством постулируемых выходов из Африки, так и предполагаемыми маршрутами продвижения по Евразии рис. СевероВосточной Африки примерно тыс. Синайский полуостров и Левант i , . По другой гипотезе предлагается более раннее примерно тыс. Евразии из Восточной Африки по южному береговому пути через южную часть Аравийского полуострова вдоль побережья Индийского океана до ЮгоВосточной Азии, Австралии и Океании vi . Так называемая модель пинцета i предполагает, что заселение Евразии произошло двумя путями, как южным, так и северным. Сначала произошло заселение. Австралии носителями культуры среднего палеолита приблизительно от до тыс. Позднее, примерно тыс. Северной Африки северным путем по территории Евразии. Поскольку после достижения ЮгоЗападной Азии имелось два потенциальных пути для колонизации остальной территории континента относительно горной системы Гималаевсеверный и южный, то для заселения Восточной Азии предлагается модель северного азиатского пути, согласно которой маршрут мигрантов пролегал через Центральную Азию и Южную Сибирь . Если верна модель двух путей заселения, то в генофондах народов Центральной и Северной Азии должны присутствовать архаичные линии мтДНК, т. ДНК, обнаруживаемых в Южной и ЮгоВосточной Азии. Рисунок 3. Заселение человеком Евразии по модели северного бореального пути А, пинцета В и южного берегового пути С. Стрелками обозначены возможные пути миграций.