Анализ повторяющихся последовательностей ДНК в эволюционно- и популяционно-генетических исследованиях кровососущих комаров семейства Culicidae

• Автор: Брагинец, Ольга Петровна
• Шифр специальности: 03.00.15
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2003
• Место защиты: Томск
• Количество страниц: 120 с. : ил

ОГЛАВЛЕНИЕ
ВВЕДЕНИЕ.

Глава 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1. Размер и организация генома комаров семейства Си1Шс1ае

1.2. Общая характеристика и типы повторяющихся последовательностей ДНК.

1.3. Локализация на хромосомах повторяющихся последовательностей ДНК.

1.4. Повторяющиеся последовательности ДНК и эволюционный процесс.

1.5. Тандемные повторы как генетические маркеры.

1.6. Изучение повторяющихся последовательностей ДНК

методом таксонопринта.

Глава 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ.

2.1. Материалы
2.2. Выделение ДНК
2.3. Идентификация видов
2.4. Метод таксонопринта
2.5. Клонирование и анализ видоспецифичной фракции повторяющихся последовательностей ДНК.
2.6. Микросателлитное генотипирование.
2.7. Секвенирование фрагмента гена мтДНК
2.8. Приготовление лактоацетоорсеиновых препаратов
Глава 3. РЕЗУЛЬТАТЫ.
3.1. Сравнение спектров повторяющихся последовательностей ДНК у представителей семейства СиПс1с1ае методом таксонопринта.
3.2. Межпопуляциониые различия в картинах распределения повторов у вида Ае. v
3.3. Анализ видоспецифической фракции комара .
3.4. Полиморфизм микросателлитных локусов у малярийных комаров группы . .
3.5. Микросателлитные маркеры в исследовании внутривидового разнообразия и генетической структуры природных популяций . i
3.6. Анализ последовательности фрагмента гена митохондриальной ДНК в популяциях .
3.7. Анализ инверсионного полиморфизма . в Кении Глава 4. ОБСУЖДЕНИЕ.
4.1. Организация повторяющихся последовательностей ДНК в геноме комаров семейства ii
4.2. Повторяющиеся последовательности ДНК в исследованиях таксономии и эволюции кровососущих комаров
4.3. Использование микросателлитных локусов в изучении популяционногенетической структуры у комаров.
4.4. Популяционногенетическая структура малярийного комара
. в Кении
ВЫВОДЫ
ЛИТЕРАТУРА


Они могут являться руководством для выбора сходных или видоспецифичных фракций при дальнейших исследованиях повторяющихся последовательностей ДНК у различных групп кровососущих комаров. Кроме того, различия в картинах распределения повторов можно использовать для целей видовой диагностики и в разрешении некоторых спорных вопросов систематики и филогении. Структура и генетическое разнообразие популяций комаров одни из важнейших факторов, которые необходимо учитывать как при использовании уже имеющихся методов контроля за численностью переносчиков малярии, так и при разработке новых методов, в том числе генетических. Изучение популяционной структуры малярийных комаров приобретает также особое значение в связи с быстрым распространением устойчивости к инсектицидам. Таким образом, результаты анализа популяционной структуры Ап. Ш, одного из главных переносчиков малярии в афротропическом регионе, имеют непосредственное практическое значение для контроля малярии. Апробация результатов. Результаты исследований были представлены на XIII Всероссийском симпозиуме Структура и функции клеточного ядра, СанктПетербург на II Съезде Вавиловского общества генетиков и селекционеров, СанктПетербург на I Международной конференции Биоразнообразие и динамика экосистем Северной Евразии, Новосибирск на I и II Международной конференции Проблема вида и видообразование, Томск , на , , ом ежегодном собрании Американского Общества Тропической Медицины и Гигиены, Хьюстон , Атланта , Денвер на I Международной Школесеминаре Кровососущие насекомые переносчики трансмиссивных заболеваний и проблемы генетической безопасности, Москва . Публикации. По теме диссертации опубликовано работ. Благодарности. В.Н. Стегнию за общее руководство и помощь на всех этапах работы над диссертацией. Я искренне признательна Г. Яну за проявленный интерес к моей работе, понимание и поддержку исследований по теме диссертации во время моего пребывания в Баффало. Особая благодарность М. В. Шараховой за постоянную поддержку, творческие идеи и ценные советы при написании диссертациии. Хочу поблагодарить А. .. Малахову за участие в проведении экспериментов по таксонопринтному анализу видов , И. В. Шарахова за помощь и советы при проведении некоторых экспериментов, О. Г. Грушко за ценные комментарии к работе, а также А. К. Сибатаева, Э. М. Баричсву, А. П. Брагинсц за методическую и организационную помощь. Большое спасибо моим коллегам Т. И. Панковой, Р. ii, . ivii, . i, . . , а также . i, . . , . . i и их сотрудникам за помощь в сборе и определении комаров, и предоставление фиксированного материала. В заключение хочу выразить свою признательность М. И. Гордееву, а также коллегам из лаборатории эволюционной цитогенетики НИИ ББ, и сектора молекулярной нейрогенетики дрозофилы ИЦиГ за участие и моральную поддержку. Глава 1. Семейство ii включает в себя более чем видов комаров, многие из которых, главным образом представители родов , x и , являются переносчиками арбовирусов, малярии и филяриоза, в сумме представляющих основную причину заболеваемости и смертности в мире , i, , специальный выпуск журнала i за 4 октября г. Это семейство, объединяющее рода, подразделяется на три подсемейства i, xii, ii i, , vi, , причем видов относятся к ii. Считается, что семейство ii имеет монофилетическое происхождение , , , и ведет свое начало от Юрского периода , i, цит по i, , , а к концу четвертичного периода формирование основной композиции семейства ii уже завершилось i, , цит по i, , . Филогенетические исследования на основе нуклеотидных последовательностей рДНК i , i , и гена i , , свидетельствуют в пользу того, что дивергенция подсемейства i произошла раньше, чем xii и ii.