Состав и организация ДНК гетерохроматина половых хромосом у обыкновенных полевок рода Microtus группы arvalis

• Автор: Козлова, Светлана Викторовна
• Шифр специальности: 03.00.15
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2001
• Место защиты: Новосибирск
• Количество страниц: 108 с.

Оглавление
ВЕДЕНИЕ.

1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.

. ГЕТЕРОХРОМАТИН.

1.2. ПОВТОРЫ В ГЕНОМЕ МЛЕКОПИТАЮЩИХ

1.2.1. Тандемно организованные последовательности ДНК

1.2.2. Рассеянные повторы

1.2.2.1. Ретровирусы и ретротранспозоны

2.2.3. I
1.2.2.2. I.

1.2.3. Мобильные элементы, геном, гетерохроматин.

1.3. ГЕТЕРОХРОМАТИН ХРОМОСОМЫ МЛЕКОПИТАЮЩИХ
1.4. ПОВТОРЫ ГЕТЕРОХРОМАТИНА ПОЛОВЫХ ХРОМОСОМ СЕРЫХ 1ЮЛБВОК ГОД .
2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
2.. ОБЪЕКТ ИССЛЕДОВАНИЯ.
2.2. МИКРОБИОЛОГИЧЕСКИЕ МЕТОДЫ РАБОТЫ
2.3. Скрининг геномных фаговых библиотек.
2.4. МЕТОДЫ ВЫДЕЛЕНИЯ ДНК
2.5. Методики работы с рекомбинантной ДНК
2.6. ПОЛИМЕРАЗНАЯ ЦЕПНАЯ РЕАКЦИЯ.
2.7. Саузпрн блотгибридизация.
2.8. Определение копийности повторов.
2.9. Гибридизация i i.
2 Определение нуклеотидной последовательности ДНК
2 Контекстный анализ последовательности ДНК
2 1 i У Л ЬСЭ ЛЕ КТРОФОРЕЗ
3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ.
3.1. Копийность ПОВТОРОВ 3 И 4.
3.2.1 АНАЛИЗ геномных клонов, СОДЕРЖАЩИХ .V14, ИЗ ГЕТЕРОХРОМАТИНА ХХРОМОСОМЫ ПОЛЕВКИ
М. IIII.
3.2.2. АНАЛИЗ ГЕНОМНЫХ КЛОНОВ, СОДЕРЖАЩИХ 4, ИЗ ЭУХРОМАТИНА ХХРОМОСОМЫ ПОЛЕВКИ М. VI
3.3.1. Структура последовательности 7
3.3.2. Саузерн блотанализ 7.
3.3.3. ЛОКАЛИЗАЦИЯ 7 НА МЕТАФАЗНЫХ ХРОМОСОМАХ ОБЫКНОВЕННЫХ ПОЛЕВОК.
3.3.4. КОПИЙНОСТЬ 7
3.4. ПЦРАНАЛИЗ ГЕНОМНЫХ ДНК ПОЛЕВОК.
3.5. ПУЛЬСГЕЛЬЭЛЕКТРОФОРЕЗ.
4. ЗАКЛЮЧЕНИЕ ОСОБЕННОСТИ ОРГАНИЗАЦИИ ПОВТОРОВ В ГЕТЕРОХРОМАТИНЕ ПОЛОВЫХ ХРОМОСОМ ОБЫКНОВЕННЫХ ПОЛЕВОК
ВЫВОДЫ.
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ


А. Елисафенко, А. И. Шевченко, С. В. Павловой, С . Я. Слободянюку и Т. Б. Нестеровой за помощь, поддержку и советы по работе 1 I. . Мазурок, Н. .. Н.В. Рубцовой за наращивание культур клеток полевок С. С. Богачеву за советы по проведению пульсэлектрофореза Т. Б. Нестеровой за предоставление г еномных библиотек полевок. Автор выражает глубокую благодарность рецензентам Елене Сергеевне Беляевой, Александру Васильевичу Вершинину и Аиде Герасимовне Ромащенко, а также Николаю Александровичу Колчанову за замечания при прочтении рукописи. Структура и объем работы. Диссертация содержит следующие разделы введение, обзор литературы, материалы и методы, результаты и обсуждение, заключение, выводы, список литературы 9 ссылок. Работа изложена на 9 страницах, включая рисунков и таблиц. Большинство эукариотических геномов содержит эухроматические и гетерохроматические районы. К гетерохроматину относят районы, сохраняющие конденсированное состояние в течение всего клеточного цикла. Термин гетерохроматин ввел Гейтц в г. i, , цит. Бельговская, . Для гетерохроматина в целом характерны следующие черты конденсированное состояние в течение всего клеточного цикла, поздняя репликация, Сокрашивание, генетическая инертность, повторяющиеся последовательности ДИК, его составляющие, пониженный уровень рекомбинации, увеличенный статус метилирования у тех организмов, у которых есть метилирование . ПрокофьеваБельговская, iv, , . Гейтц i, же ввел разделение на альфа и бетагетерохроматин. Под альфагетерохроматином подразумеваются районы более плотного окрашивания околоцентромерного гетерохроматина политенных хромосом насекомых. По сравнению с альфа, бетагетерохроматин выглядит более рыхлым и формирует переход между цеитромерным неполитенизированным альфагетерохроматином, и политенизированным эухроматином , i, i, , . ДНК альфагетерохроматина состоит из тандемно организованных последовательностей сателлитов. Бегагетерохроматин имеет смешанну ю структуру повторов, в его состав входят сателлиты и мобильные элементы. Первоначально описанное для политенных хромосом, разделение на альфа и бетаформы переносится некоторыми авторами на гетерохроматин млекопитающих под альфа имеется ввиду центромерные участки аутосом, под бета хромосома и интеркалярный гетерохроматин. Холмквист с соавторами i . Классический мейотический кроссинговер подавлен в районах гетерохроматина. Этот запрет препятствует рекомбинации по гомологичным повторам в гетерохроматине. Гвоздев, . Присутствие в геномах всех эукариот весьма существенного количества генетически инертного хроматина количество гетерохроматина может достигать у некоторых видов всей ДНК не может не влиять на функционирование всего генома. Определение положения хромосом в ядре, обеспечение целостности хромосом за счет теломерного гетерохроматина, участие в правильном расхождении хромосом в мейозе, перестройки генома по гетерохроматиновым районам, обеспечение механизма разделения полов, и другие аспекты являются результатами существования и функционирования гетерохроматина в геноме эукариот ПрокофьеваБелы овская, . ДНК гетерохроматина в основном состоит из повторов различной организации. Возможно, повторенная Д1К является генетической основой гетерохроматина. За все время исследований гетерохроматина было получено и охарактеризовано множество повторов, входящих в его состав. Количественное и качественное разнообразие повторов, образующих гетерохроматин, очень велико. Длина мономерных единиц тандемных повторов может быть от нескольких нуклеотидов до сотси тысяч пар оснований. Рассеянные повторы также различаются по длине и по копийности. В разных случаях соотношение по массе и взаиморасположение тандемных и диспергированных повторов сильно отличается. Повторы прицентромерного гетерохроматина как у растений, так и у дрозофилы и млекопитающих имеют сходные характеристики это сателлиты с длиной мономера 00 или около 0 п.