Полиморфизм С/Т-13910 регуляторного участка гена лактазы LCT, ассоциированного с первичной гиполактазией у человека, в популяциях Евразии

• Автор: Соколова, Мария Викторовна
• Шифр специальности: 03.00.15, 03.00.03
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2008
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 117 с. : ил.

Оглавление

Список использованных сокращений.

Введение.

Актуальность проблемы

Цели и задачи исследования.

Научная новизна

Практическая значимость

1. Обзор литературы

1Л. Генетическая детерминация расщепления молочного сахара у

человека.

1Л Л. Лактаза и лактоза

1Л .2. Гиполактазия
1Л .3. Возрастные изменения уровня синтеза лактазы.
1Л .4. Генетические полиморфизмы, ассоциированные с гиполактазией.
1.2. Эволюционные аспекты гиполактазии.
1.3. Географическое распределение частот гиполактазии
1.4. Медицинские аспекты гиполактазии .
1.5. Методы диагностики первичной гиполактазии.
1.5.1. Клинические методы
1.5.2. Молекулярные методы диагностики гиполактазии
2. Материалы и методы
2.1. Материалы.
2.2. Методы
2.2Л. Оценка активности лактазы у испытуемых.
2.2.2. Выделение ДНК из цельной крови
2.2.3. Элюция продукта ДНКамплификации из агарозных гелей.
2.2.4. Электрофоретический анализ ДНК в горизонтальном агарозном
2. 2. 5. Методы генотипирования
2.2.6. Статистический анализ данных
3. Результаты и обсуждение.
3.1. Разработка и характеристика методов генотипирования полиморфизма ЬСТСТ0
3.1.1. Секвснированис
3.1.2. ПЦРПДРФ.
3.1.3. ЫЖТаяМап.
3.1.4. Аллсльспсцифичная амплификация в режиме реального
времени.
3.2. Исследование ассоциации генотипа СС по полиморфизму ЬС7СГТ
0 и фенотипом гиполактазии в выборке добровольцев
3.3. Определите частот аллелей С и Т и генотипов по полиморфизму ЬСТСТ0 в выборках, представляющих популяции России и сопредельных стран.
3.4. Сопоставление частот генотипа СС по полиморфизму ЬС7СТ
с частотой гиполактазии в соответствующих популяциях.
3.5. Корреляция частот генотипа СС по полиморфизму ЛСРСТ1. и
фенотипа гиполактазии в популяциях Евразии.
Заключение
Выводы.
Благодарности
Список использованной литературы


Большее распространение получили косвенные нагрузочные пробы Аго1а, . Среди последних наиболее распространены нагрузочные пробы определение изменений содержания глюкозы в крови или галактозы в моче, а также содержания водорода в выдыхаемом воздухе после латегозной нагрузки. Эти методы обладают рядом недостатков, ограничивающих возможности их применения. Специфичность их варьирует от до , а чувствительность от до 0. Недостатками нагрузочных проб являются опасность ухудшения состояния у чувствительных пациентов и высокий уровень ложнопозитивных результатов при обследовании детей до Козлов, . Поэтому разработка систем молекулярной диагностики гиполактазии весьма актуальна. Выше точки начала транскрипции этого гена выявлен полиморфизм СТ 0 гз5, ассоциированный с гиполактазией. Для генотипа СС по полиморфизму ЕпаПаЬ с Объектом исследования в диссертации явились выборки, представляющие этнорегиоиальные группы России и сопредельных стран русские разных регионов Костромы, Ростова, Курска, Башкирии. Чукотки, украинцы Восточная Украина, белорусы различные регионы Беларуси, саамы Кольский пов, марийцы горные Мари Эл, удмурты Игринский район Удмуртии, комипермяки, казахи АлмаАта, уйгуры АлмаАтинский район, буряты Улан Удэ и московские студенты уроженцы Бурятии, чукчи Анадырский район. Были изучены также две небольшие выборки, представляющие популяции Ближнего Востока московский студенты уроженцы Ирана персы, луры, гилянцы, курды, турки и арабы разных стран Сирии, Ливана, Палестины, Иордании, Йемена, Израиля, Египта. В диссертационной работе разработаны методы генотинирования полиморфизма Исследовано распределение аллелей и генотипов по полиморфизму 1СГСТ0 в российских популяциях и установлены частоты генотипа СС, ассоциированного с гиполактазией. Частоты этого генотипа сопоставлены с опубликованными данными по частоте клиникобиохимически диагностированной гиполактазии для тех же популяций. Целью диссертационной работы является выявление географического распределения частот аллелей и генотипов по полиморфизму СТ0 в регуляторном участке гена лактазы в популяциях Евразии выявление степени ассоциации генотипа СС по данному полиморфизму с первичной гиполактазией в населении РФ оценка генетической гетерогенности первичной гиполактазии в населении Евразии разработка и оптимизация методов молекулярной диагностики первичной гиполактазии. Разработать и подобрать оптимальные методы для детекции аллелей и генотипов полиморфизма СГ СТ0. Определить ассоциацию полиморфизма 70 с фенотипом гиполактазииперсистенции лактазы в российской выборке. В выборках, представляющих популяции народов Евразии, определить генотипы индивидов по полиморфизму 770, установить частоты аллелей и охарактеризовать географическое распределение частот аллелей и генотипов. СС полиморфизма ЬСТСТ0 и установленную ранее фенотипически частоту гиполактазии в тех же популяциях. Показана ассоциация генотипа СС полиморфизма ЬСТСТ0 в регуляторном участке гена лактазы с фенотипом первичной гиполактазии в выборке жителей европейской части России. Подобран оптимальный метод для генотипирования полиморфизма СГСТ0. Определены частоты аллелей и генотипов полиморфизма ЬСТСГТ0 в популяциях, представляющих этнических групп России и сопредельных стран. Показано, что частоты генотипа СС в большинстве изученных популяциях близки к опубликованным частотам гиполактазии, установленным в клиникобиохимических исследованиях. СС является основным генетическим детерминантом развития первичной гиполактазии в популяциях европейской части России. Практическая значимость данной работы определяется необходимостью разработай средств молекулярногенетической диагностики гиполактазии и высокой частотой гиполактазии в российских популяциях от в различных популяциях русских до и болсс в популяциях коренных народов Сибири и Дальнего Востока. Разработанные методы могут использоваться для ДНК диагностики первичной гиполактазии в населении европейской части России.