Таксономическое изучение дрожжей Williopsis, Zygowilliopsis и Saccharomyces, выделенных из природных источников на Дальнем Востоке

• Автор: Газдиев, Денис Олегович
• Шифр специальности: 03.00.07
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2005
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 132 с. : ил.

СОДЕРЖАНИЕ

ВВЕДЕНИЕ ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

ГЛАВА 1. СИСТЕМАТИКА ИЗУЧАЕМЫХ РОДОВ ДРОЖЖЕЙ

1.1.

1.2. iii, iii и ГЛАВА 2. РАСПРОСТРАНЕНИЕ И ЭКОЛОГИЯ ДРОЖЖЕЙ

АСКОМИЦЕТОВ В ДАЛЬНЕВОСТОЧНОЙ АЗИИ

2.1. Дальний Восток России

2.2. Япония ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ И ОБСУЖДЕНИЕ ГЛАВА 3. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ

3.1. Объекты исследования, методы выделения и идентификации дрожжей

3.2. Генетический анализ

3.3. ПЦРанализ

3.4. Методы генной инженерии
ГЛАВА 4. ИДЕНТИФИКАЦИЯ ДРОЖЖЕЙ РОДА ДАЛЬНЕГО ВОСТОКА
4.1. Фенотипическая характеристика штаммов
4.2. Молекулярная дифференциация штаммов
4.3. Генетическая идентификация штаммов ГЛАВА 5. МОЛЕКУЛЯРНАЯ ДИФФЕРЕНЦИАЦИЯ ДРОЖЖЕЙ
III, III И
5.1. Рестриюгазный анализ амплифицированных 5.8I фрагментов типовых штаммов
5.2. Использование ПЦР с неспецифичными праймерами для дифференциации дрожжей комплекса iii i
5.3. Молекулярный анализ музейных штаммов и новых изолятов
5.4. Определение нуклеотидной последовательности вну тренних транскрибируемых спенсеров I1 и I2 у штаммов, имеющих уникальные ПЦРпрофили с праймером М
ГЛАВА 6. МОЛЕКУЛЯРНОГЕНЕТИЧЕСКИЙ ПОЛИМОРФИЗМ
ДРОЖЖЕЙ III II
6.1. Рестриктазный анализ амплифицированных Iфрагментов
6.2. Анализ последовательностей внутренних транскрибируемых спейсеров I1,12 и домена 1
рДНК у штаммов первой группы
6.3. Анализ последовательностей I15.8I2 и домена 12 рДНК штаммов I , I , I , I и 1 1
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ


Изучение генетических и молекулярнобиохимических свойств дрожжей привело к новому пересмотру систематики рода . Была показана мутационная изменчивость биохимических признаков и необъективность видовой дифференциации, основанной на их использовании. В результате в следующем определителе дрожжей , все виды i были отнесены к синонимам . Однако позднее, с помощью гибридологического анализа и ДНКДНК рсассоциации было установлено, что некоторые синонимы . Гибридологический анализ основан на изучении 1 жизнеспособности полового потомства аскоспор гибридов с тестштаммами различных биологических видов и 2 возможности обмена генами рекомбинации контрольных ауксотрофных маркеров Наумов, 6 Наумов и др. v, , . Для гибридологического анализа используются только родительские штаммы с высокой выживаемостью аскоспор. Фертильность гибридов и нормальное расщепление контрольных маркеров свидетельствуют о принадлежности штаммов к одному биологическому виду, а стерильность гибридов или очень низкая жизнеспособность аскоспор указывают на разные виды. Данные генетического анализа таких родов как , ii и v позволили сформулировать генетическую концепцию рода у дрожжей как группы скрещивающихся видов, гибриды которых размножаются вегетативно Наумов, . Еще в году i, , было предложено использовать способность к скрещиванию и выживаемость продуктов мейоза аскоспор гибридов для разграничения видов . Однако в скрещиваниях были использованы исходные природные или производственные штаммы, а не специально полученные от них инбредные линии, характеризующиеся высокой выживаемостью спор Наумов и др. Известно, что природные и производственные штаммы часто обладают пониженной выживаемостью аскоспор , Наумов, , ii, , , , которая определяется многими генетическими факторами, в частности нечетной полиплоидией, анеуилоидией, наличием в гетерозиготном состоянии рецессивных деталей и полулегален, делений, инверсий. В этих случаях родительские споры генетически разнокачественны и их суммарная выборка не можег харакгеризовагь споры, взятые в скрещивание. Для получения высокофертильных родительских культур у гомоталличных дрожжей достаточно провести последовательные клонирования от одной споры, у гетероталличных необходимы внутритетрадные скрещивания. С помощью таких операций элиминируются факторы летальности и повышается выживаемость аскоспор ИнгеВечтомов, Наумов, . По фертильности гибриды сравнивают с инбредными родительскими линиями. Использование генетических методов в классификации дрожжей комплекса i позволило выявить синонимы биологического вида . Наумов и др. В году на материале ряда штаммов были описаны дрожжи . , . Эти дрожжи отличались от штаммов . Наумов, 6. В соответствии с биологической концепцией вида Майр, было высказано предположение о том, что почвенные сахаромицеты и дрожжи . Было предложено возобновить почвенный таксон как самостоятельный вид . . v Наумов, . Позднее, на основании гибридологического анализа музейных культур и природных изолятов было установлено, что такие таксономические виды как . i Бачинская, , . i x . . i . v Наумов, принадлежат к одному биологическому виду . Наумов, . Экспериментальные данные свидетельствуют о принадлежности дрожжей рода , выделяемых из природы сокотечений дуба, насекомых, почвы, в основном к самостоятельному биологическому виду . i. Позднее были обнаружены редкие природные популяции дрожжей биологического вида . Сибири, Японии и II Наумов, Никоненко, а, б Наумов, Наумова, v . Дикие дрожжи . . vii . В свое время были обнаружены штаммы 9 и I i, , i . . vii, определяемой по ДНКДНК реассоциации. Позднее обнаружены еще два штамма 0, 5, отличающихся по ДНКДНК реассоциации от . ДНК ii .