Катаболизм ароматических соединений родококками

• Автор: Дуган, Ирина Николаевна
• Шифр специальности: 03.00.07
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 1984
• Место защиты: Пущино
• Количество страниц: 153 c. : ил

Введениестр. I

Обзор литературы

Глава I. Экологофизиологические особенности коринеформ

1.1. Распространение в природе .

1.2. Физикохимические условия существования коринеформ .

1.3. Азотное и витаминное питание.II

1.4. Использование источников углерода

1.5. Олиготрофия.

Глава 2. Катаболизм ароматических соединений коринеформами . .

2.1. Ароматические соединения в качестве единственного источника углерода для коринеформ

2.2. Трансформация ароматических соединений коринеформами

2.3. Подготовка ароматических соединений к разрыву кольца
2.3.1. Дигидроксилирование кольца .
2.3.2. Модификация заместителей водорода в кольце
2.4. Расщепление ароматического кольца и последующие реакции
2.4.1. Путь 3кетоадипината.
2.4.2. Метапуть подготовительного метаболизма пирокатехинов
2.4.3. Расщепление колец гентизиновых кислот
2.4.4. Особенности метаболизма ароматических соединений коринеформами .
Глава 3. Регуляция синтеза ключевых ферментов катаболизма
ароматических субстратов .
3.1. Регуляция синтеза ферментов орто и метапути у псевдомонад
3.2. Регуляция синтеза ферментов ортопути у коринеформ
3.3. Ключевые проблемы регуляции
ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ
Глава I. Материалы и методы исследования. .
1.1. Микроорганизмы и методы их культивирования.
1.2. Изучение регуляции биосинтеза ферментов .
1.3.Определение активности ферментов
1.4. Аналитические методы .
РЕЗУЛЬТАТЫ И ИХ ОБСУВДНИЕ
Глава 2. Ароматические соединения как источники углерода для
родококков.
2.1. Ауксанографический анализ коллекционных штаммов . .
2.2. Таксономическое положение активных штаммов родококков 5с
2.3. Особенности роста родококков в жидких средах с ароматическими субстратами
2.4. Потребности родококков в макроэлементах питания . . Глава 3. Ключевые ферменты катаболизма ароматических субстратов
у родококков
3.1. Ключевые оксигеназы пути 3кетоадипината
3.2. Метапирокатехаза
3.3. Гентизинат1,2диоксигеназа .
3.4. Диоксигеназы гомогентизината и гомопротокатехоата . Глава 4. Регуляция синтеза диоксигеназ ароматических субстратов у родококков
4.1. Индукция синтеза пирокатехазы .
4.2. Индукция синтеза протокатехоат3,4диоксигеназы . .
4.3. Индукция синтеза металирокатехазы.
4.4. Регуляция синтеза гентизинат и гомогентизинатдиоксигеназ
Глава 5. Функционирование диоксигеназ ароматических субстратов у родококков в экспериментальных условиях, близких к естественным
5.1. Синтез диоксигеназ орто и метапути при лимитировании родококков по макроэлементам
5.2. Функционирование диоксигеназ ортопути при длительном голодании родококков
5.3. Синтез и активность диоксигеназ ароматических субстратов в присутствии дополнительных субстратов неароматической природыИЗ
ЗАКЛЮЧЕНИЕ.
ЛИТЕРА1УРА.
ВВЕДЕНИЕ
Актуальность


К этому же роду относится группа сапрофитных видов С. С . Многие представители последней группы используются в промышленном синтезе аминокислот и нуклеотидов ,,0. Среди коринеформ обнаружено также множество видов, патогенных для растений, которые рассматриваются как группа П рода СогупеЪасiш . Однако, рядом авторов показано, что эти микроорганизмы существенно отличаются от коринебактерий и образуют отдельный род СшоЪасегХит, который включает и сапрофитные виды, но все они тесно связаны с растительными объектами и выделяются из тех же местообитаний, что и коринеформы рода Сеи1отопав 9 . Представители всех остальных родов коринеформ АзгЫггоЪаег, ВгеуХЪаегХит, Юигососсив и др. Так, сапрофитные коринеподобные бактерии повсеместно распространены в почвах различных климатических зон земного шара 4,5 . Однако, ввиду отсутствия адекватных методов учета, достоверных данных об их численности практически нет. Метод микроскопического контроля всех микроорганизмов, вырастающих на богатых средах и на средах для выделения олиготрофов пока является единственным методом учета, но он дает весьма неточные оценки. По данным, полученным этим методом, численность коринеформ во многих почвах столь высока, что позволяет считать эту группу прежде всего артробактеров преобладающей среди других бактерий почвы. Так, артробактеры составляют до в песчаных пахотных и до в глинистых почвах Нидерландов 4 , около от всей микрофлоры почв Франции 5,2 . Аналогичные дан
ные получены для антарктических торфов , для почв сосновых лесов Англии, где артробактеры вместе с кокками составляли более всех гетеротрофов 8 . Кроме того, показано, что прямой счет микроорганизмов в почвах значительно превышает численность, определенную при высевах на чашки, т. Эти бактерии после выделения и идентификации оказались близкими к коринформам организмами . Родококки и кислотоустойчивые микобактерии также выделяются из подавляющего большинства почв, но численность их значительно меньше, чем артробактеров 6 . По данным советских исследователей, в почвах Украинской ССР среди родококков, выделяемых методом накопительных культур с углеводородами, преобладают i и . В черноземных и темнокаштановых почвах степи видовой состав родококков разнообразнее . Численность нокардий включая родококков , составляет до от общей сапрофитной микрофлоры . Коринеподобные бактерии, кроме широкого распространения в почвах, являются обычными представителями микрофлоры пресной и морской воды 9 . Так, родококки видов . Рыбинского водохранилища , . По некоторым данным, коринеформы доминируют в микрофлоре пресноводного и морского бентоса 4 , однако, количественные оценки их практически отсутствуют, как и исследования по экологии водных коринеформ. Исключением является лишь одна работа по экологии i 5 ,организма,
связанного с навозом животных и потому служащего индикатором фекального заражения водоемов. О широком распространении коринеформ в природе свидетельствуют сообщения о выделении этих бактерий из пластовых вод нефтяных и газовых месторождений 7 , из различных сточных вод 5 , из активного ила 3 , из горных пород 2 , из торфа и разлагающегося растительного материала, из кишечника птиц, из мяса, со скорлупы яиц 2 . Представители рода vii обычно обитают в молочных продуктах и сырах , . Кромбахом описана группа неоранжевых сырных коринеформ, которые были отнесены к созданному этим автором роду . Этот род существенно отличается от настоящих бревибактерий и, вероятно, занимает промежуточное положение между родами коринебактерий и родококков. Физикохимические условия существования коринеформ. Коринеподобные бактерии могут существовать в широком диапазоне физикохимических условий. Так, по отношению к кислороду, родококки и артробактеры . В отношении температуры большинство сапрофитных коринеформ являются мезофилами, однако, имеется много сообщений о психрофилии у представителей этих микроорганизмов. Так, согласно работам советских исследователей, в северных и тундровых почвах СССР обычны облигатные психрофильные коринеформы, не растущие при С .