Молекулярно-эпидемиологическое исследование норовирусной инфекции у детей раннего возраста Новосибирска

• Автор: Боднев, Сергей Александрович
• Шифр специальности: 03.00.06
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2009
• Место защиты: Кольцово
• Количество страниц: 125 с. : 8 ил.

ВВЕДЕНИЕ.

1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.

1.1. Норонирусная инфекция

1.1.1. Истории открытия норовирусов.

1.1.2. Патогенез норовирусной инфекции.

1.1.3. Клиническая картина норовирусной инфекции.

1.1.4. Осложнения норовирусной инфекции

1.1.5. Лечение норовирусной инфекции.

1.2. Структурная организации норовирусов.

1.2.1. Морфология вприонов норовирусов.

1.2.2. Организация генома норовирусов

1.2.3. Свойства и функции неструктурных белков норовирусов.
1.2.4. Структу ра и вариабельность главного белка каиенда
1.3. Классификация калицивирусов.
1.4. Эпидемиология норовирусной инфекции.
1.4.1. Методы и подходы для детекции норовирусов.
1.4.2. Генотнпирование норовирусов.
1.4.3. Преобладающие генетические варианты норовирусов.
1.4.4. Пути и механизмы передачи норовирусов.
1.4.5. Распространенность норовирусной инфекции
1.4.6. Вспышечная к спорадическая заболеваемость.
1.4.7. Норовирусы как антропозоонозная инфекция
1.4.8. Сезонность норовирусной инфекции
1.4.9. Возрастные особенности норовирусной инфекции
1.4 Исследование норовирусов в РФ
2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
2.1. Общая характеристика исследования.
2.2. Материалы.
2.3. Методы
2.3.1 Формирование базы данных.
2.3.2. Забор материала.
2.3.3. Получение осветленного экстракта фекалий
2.3.5. Синтез комплементарной ДНК
2.3.7. Электрофоретический анализ образцов.
2.3.8. Элюцня фрагментов ДНК из агарозного геля
2.3.9. Определение нуклеотидных последовательностей
2.3. Филогенетический анализ.
3. РЕЗУЛЬТАТЫ
3.1. Оценка встречаемости норовирусной инфекции у детей в Новосибирске.
3.2. Норовирусная инфекция у детей раннего возраста Новосибирска с по ггбО
3.2.1. Организация исследования
3.2.2. Значимость норовирусов в этнологической структуре ОКИ.
3.2.3 Встречаемость норовирусов в сочетании с другими патогенами.
3.2.4. Исследование сезонности норовирусной инфекции.
3.2.5. Анализ возрастных особенностей норовирусной инфекции
3.2.6. Клинические особенности норовирусной инфекции.
3.2.7 Генотнпирование и филогенетический анализ нзолятов норовирусов.
ЗАКЛЮЧЕНИЕ

Список используемых сокращений
а.о. аминокислотный остаток
ВОЗ Всемирная организация здравоохранения
кДНК комплементарная ДНК
дНТФ дезоксинуклеотидтрифосфат
ИФА иммуноферментный анализ
ЬСИНЭ кишечная инфекция неустановленной этиологии
МУЗ ДГКБ Муниципальное учреждение здравоохранения
Детская городская клиническая больница ОРТ открытая рамка трансляции
ОКИ острая кишечная инфекция
ОТП1Р обратная транскрипция полимеразная цепная реакция
п.н. пара нуклеотидов
ЦР полимеразная цепная реакция
i i vi
Центры по Контролю и Профилактике Заболеваний
ВВЕДЕНИЕ


Диссертационная работа была выполнена в лаборатории разработки средств экстренной профилактики ФГУН ГНЦ ВБ Вектор Роспотребнадзора в рамках выполнения проекта МНТЦ. Выделение препаратов РЫКДНК и комплексная ПЦРдиагностика вирусных ротавирусьт, астровирусы и бактериальных . Е.В. Жираковской, АЛО. Тику новым и Т. Э. Юн. ПЦРдиагностика норовирусной инфекции проводилась лично автором. Бактериологический посев на . МУЗ ДГКБ 3. Эпидемиологический анализ норовирусной инфекции у детей раннего возраста, а также генотипирование выявленных изолятов норовирусов выполнено автором лично. Секвснирование фрагментов генов норовирусов проводилось автором совместно с к. Е.В. Жираковской. Филогенетический анализ генетической вариабельности изолятов норовирусов проводился автором лично. Структура и объм диссертации. Диссертация выполнена на 3 страницах машинописного текста и состоит из введения, обзора литературы, главы Материалы и методы, главы Результаты и обсуждение, заключения, выводов и списка литературы. Работа иллюстрирована рисунками, включает 8 таблиц и 2 приложения. Библиография включает 0 работ отечественных авторов и 9 зарубежных. I Торовирусная инфекция это острое инфекционное заболевание, вызываемое норовирусами, входящими в семейство iivii, и характеризующееся поражением желудочнокишечного тракта по типу гастроэнтерита. Источником инфекции является человек в активной фазе заболевания с бессимптомным или хроническим течением заболевания. Случаи норовирусиого гастроэнтерита регистрируются в течение всего года, при этом наибольшее количество заболевших, как правило, фиксируется в холодное время года . Эпидемические гастроэнтериты с высоким уровнем повторной заболеваемости впервые были описаны в США в году и получили название i Vii i, или болезнь зимней рвоты . Характерными признаками заболевания являлись выраженная сезонность с пиком заболеваемости в зимний период, преобладание в клинической картине рвоты и, в меньшей степени, диареи, короткий инкубационный период, а также частые повторные случаи заболевания после перенесенной инфекции. Бактериологические исследования, проводимые в течение последующих нескольких десятилетий, помогли выявить патогенные бактерии только в малом проценте случаев инфекций с описанным синдромом, этиология большей их части оставалась неизвестной. Исследования с привлечением добровольцев, проведенные в США и Японии в х годах, показали, что ультрафильтраты, полученные из фекалий больных при вспышке кишечной инфекции небактериальной этиологии, были способны вызвать заболевание, что явно указывало на присутствие неизвестного вируса, который проникал через поры фильтров, задерживающих бактерии . Впервые патоген, вызывающий небактериальные гастроэнтериты, был обнаружен в фекалиях пациентов в г. Образцы фекалий были получены от больных во время вспышки кишечной инфекции в г. Норфолк, Огайо, США. Эта вспышка была зафиксирована в г. Вторая волна заболевания началась после контакта инфицированных внутри семей, где уровень инфицирования достиг инкубационный период составил приблизительно часов. Несмотря на то, что у многих пациентов была диарея, преобладающими клиническими проявлениями являлись тошнота и рвота . Данные симптомы были сходны с описанной ранее i Vii i. Следует отметить, что до этого времени не были описаны вирусные частицы, способные вызвать ОКИ у человека. Таким образом, вирусные частицы округлой формы, впоследствии названные по месту их обнаружения vi, явились первыми вирусными патогенами, выявленными у пациентов с ОКИ. Позднее были обнаружены и изучены другие вирусы, имеющие сходные с Норфолквирусами свойства и названные по месту их открытия например, ii vi и vi, а также другие, неродственные вирусы ротавирусы, астровирусы, аденовирусы, пикронавирусы, также являющиеся этиологической причиной небактсриатьных гастроэнтеритов М. Впоследствии на основании биологических свойств и данных о нуклеотидных последовательностях, мелкие округлые вирусы, имеющие РНКгеном положительной полярности и сходную организацию рамок трансляции, были объединены в семейство iivii.