Выявление ротавирусов КРС группы А с помощью ПЦР и их характеристика на основе анализа генома

• Автор: Чупин, Сергей Александрович
• Шифр специальности: 03.00.06
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2003
• Место защиты: Владимир
• Количество страниц: 126 с. : ил

ОГЛАВЛЕНИЕ

1. ВВЕДЕНИЕ.

2. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.

2.1. Краткая характеристика семейства vii

2.2. Основные свойства ротавирусов.

2.2.1. Строение вириона.

2.2.2. Физикохимические свойства.

2.2.3. Структура генома.

2.2.4. Гены и протеины

2.2.5. Репликация.

2.2.6. Антигенные свойства

2.3. Эпизоотология ротавирусной инфекции.
2.4. Патогенез ротавирусной инфекции телят.
2.5. Выявление ротавирусов.
2.6. Заключение по обзору литературы.
3. СОБСТВЕННЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ
3.1. Материалы и методы
3.1.1. Материалы
3.1.2. Методы.
3.2. РЕЗУЛЬТАТЫ СОБСТВЕННЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ
И ИХ ОБСУЖДЕНИЕ
3.2.1. Характеристика изолятов РВ КРС на основе анализа гена Р7.
3.2.2. Характеристика изолятов РВ КРС на основе анализа гена УРА
3.2.3. Комбинации О и Ртипов российских изолятов РВ КРС.
3.2.4. Анализ частоты реассортации геномных сегментов ротавирусов КРС в естественных условиях.
3.2.5. Особенности структуры ротавирусной популяции.
3.2.6. Изменение генов УР7 и Р4 изолятов РВ в процессе адаптации к культуре клеток.
4. ЗАКЛЮЧЕНИЕ
5. ВЫВОДЫ
6. ПРАКТИЧЕСКИЕ ПРЕДЛОЖЕНИЯ
7. СПИСОК ИСПОЛЬЗОВАННОЙ ЛИТЕРАТУРЫ
ПРИЛОЖЕНИЯ.
1. ВВЕДЕНИЕ
Актуальность


V сходен с реовирусами по морфологическим признакам, но отличается от них по антигенным свойствам. В году Международным комитетом по таксономии вирусов ротавирус был выделен в самостоятельный род семейства vii . Ротавирусы являются представителями рода vi, который входит в состав семества vii. Представители этого семейства обладают а фрагментарным геномом, состоящим из сегментов двухцепочечной РНК дцРНК с молекулярной массой 0,33 МД, причем все фрагменты входят в состав одной вирусной частицы б квазисферическим капсидом диаметром нм с икосаэдрической симметрией 6. Семейство vii одно из наиболее сложных в вирусологии. Оно состоит из 9 родов, которые включают вирусы млекопитающих, птиц, рептилий, амфибий, рыб, беспозвоночных и растений. Первая часть названия семейства 7ео является сокращением от английского i i респираторнокишечная сирота, поскольку впервые члены семейства были обнаружены в органах дыхательной системы и кишечном тракте человека и животных как сироты, то есть не вызывали никакого заболевания. Теперь эти вирусы являются членами рода vi 8. Члены рода vi распространены повсеместно. Их выделяют от человека, обезьян, крупного рогатого скота, овец, свиней, летучих мышей и птиц. Ортореовирусы вызывают диарею, поражают органы дыхательной и нервной системы. Род vi включает вирусы млекопитающих 3 типов и вирусы птиц типов. Распространение членов рода ivi типично для арбовирусов. Распространение каждого конкретного вируса ограничено ареалом обитания его переносчика. Однако разнообразие этих переносчиков довольно большое. Сюда относятся различные виды комаров, мух и клещей. Наиболее важные члены этого рода вирус синего языка овец и вирус африканской чумы лошадей причиняют большой экономический ущерб. Род ivi разделен на подгрупп. Эти подгруппы включают вирусы блутанга 1, вирусы африканской чумы лошадей 19, вирус эпизоотической геморрагической болезни оленей, вирус Ибараки, вирусы энцефалоза лошадей 1 и 2 и др. Род ivi содержит небольшое число членов. Сюда относится вирус колорадской клещевой лихорадки. Колтивирусы были выделены в США, Индонезии и Китае. Род vi содержит большое число вирусов, выделенных от морских и пресноводных рыб, а также от моллюсков. Патогенность многих из этих вирусов еще недостаточно изучена. Кроме того, в семейство vii входят роды vi, iivi, vi и vi 0. Представители рода vi распространены очень широко. Они обнаружены у всех видов домашних животных и в большинстве случаев вызызают диарею у новорожденных. Учитывая, что ротавирусы поражают как животных, так и человека, и что диарея при этом часто протекает в более тяжелой форме, чем диарея, вызываемая другими вирусными агентами, можно сказать, что ротавирусная диарея является одной из наиболее значимых болезней в мире. Она является причиной смерти миллионов детей в развивающихся странах и наносит огромный экономический ущерб животноводству. Интактные ротавирусные частицы имеют сферическую форму. При исследовании в электронной микроскопии они напоминают колесо с широкой ступицей, отходящими от него короткими спицами и четко очерченным гладким ободом. Название рода было предложено на основании этого сходства от лат. При исследовании препаратов ротавируса в электронной микроскопии различают 3 типа частиц. Интактные инфекционные частицы исторически называются двухоболочечными частицами, хотя новые данные по структуре вириона показывают, что они имеют 3 слоя . Поскольку эти частицы имеют ровную поверхность, их часто называют гладкими частицами. Двухслойные частицы ранее называвшиеся однооболочечными частицами, потерявшие внешнюю оболочку внешний капсид, также описызают как шероховатые частицы, поскольку по периферии видны выступающие тримерные субъединицы второго слоя внутреннего капсида. Однослойные частицы сердцевины наблюдают менее часто они обычно теряют геномную РНК и агрегированы .