Исследование генетических особенностей вируса крымской-конго геморрагической лихорадки, циркулирующего на Юге России

• Автор: Петрова, Ирина Дмитриевна
• Шифр специальности: 03.00.06
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2003
• Место защиты: Кольцово
• Количество страниц: 126 с. : ил

ОГЛАВЛЕНИЕ

Список сокращений.

ВВЕДЕНИЕ.

Глава I. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.

1.1. Открытие и эпидемиология ККГЛ исторический аспект.

1.2. Эпидемиологическая ситуация по ККГЛ в России в настоящее время .

1.3. Таксономия найровирусов

1.4. Молекулярнобиологическое исследование вируса ККГЛ.

1.5. Бсегмент геномной РНК и нуклеокапсидный белок.

1.6. Мсегмент геномной РНК и оболочечные гликопротеины.

Глава 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ.

2.1. Материал для исследований
2.2. Обратная транскрипция полимеразная цепная реакция
2.3. Секвенирование и филогенетический анализ.
Глава 3. СОСТОЯНИЕ ПРИРОДНОГО ОЧАГА ККГЛ НА ЮГЕ
РОССИИ.
3.1. Вирусофорность клещей
3.2. Результаты ИФА клинических образцов
Глава 4. СТРУКТУРА ГЕНОМА ВИРУСА.
4.1. Структура 8РНК вируса ККГЛ.
4.1.1. Структура участка 09 Бсегмента генома вируса ККГЛ
4.1.2. Структура 5 участка Бсегмента генома вируса ККГЛ
4.1.3. Полная структура 5сегмента генома вируса ККГЛ.
4.2. Структура Мсегмента генома вируса ККГЛ
4.2.1. Структура среднего участка Мсегмента генома вируса ККГЛ
4.2.2. Структура 5концевого участка Мсегмента генома вируса ККГЛ . .
4.2.3. Структура Зконцевого участка Мсегмента генома вируса ККГЛ . .
Глава 5. ДИЗАЙН ПРАЙМЕРОВ ДЛЯ ДИАГНОСТИЧЕСКОЙ
НЦРТЕСТСИСТЕМЫ НА РНК ВИРУСА ККГЛ В ОБРАЗЦАХ . .
ВЫВОДЫ.
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ


Впервые исследована генетическая вариабельность вируса ККГЛ, циркулирующего на территории южных регионов России на основании изучения частичных нуклеотидных последовательности и М сегментов генома. Определена полная нуклеотидная последовательность сегмента трех коллекционных штаммов вируса ККГЛ IV 3 Ст. Ставропольского края, IV 4 Рос. Н.i из Ростовской области и IV 5 Уз. Н. ii из Узбекистана. Впервые показано, что на территории России циркулируют генетически близкие варианты вируса ККГЛ, существенно отличающиеся по нуклеотидной последовательносги и М сегментов генома от штаммов из других регионов мира. ПЦРсистемы для индикации вируса ККГЛ в клинических образцах. На основе созданного нами набора праймеров и отработанных условий индикации РНК вируса с помощью ОТПЦР выпущена экспериментальная серия диагностических наборов для выявления РНК вируса ККГЛ в клинических образцах. РНК вируса ККГЛ приоритет от , решение о выдаче патента от . .. Петрова И. Д., 3 Тюнников Г. И., 4 Серегин С. В., 5 Яшина Л. Н., 6 Кузина И. По результатам работы в базе данных зарегистрированы нуклеотидные последовательности. Популяция вируса ККГЛ, циркулирующего на территории юга Росси в представлена доминирующим генотипом вируса, имеющим значительные отличия в нуклеотидной структуре от зарубежных аналогов. Популяция вируса ККГЛ, циркулирующего на территории России, стабильна. Вирусы ККГЛ, циркулирующие на территории России разделяются географически на ВолгоградскоРостовскую и АстраханскоСтавропольскую подгруппы. Выражаю глубокую признательность моему научному руководителю кандидату биологических наук Петрову Владимиру Семеновичу за постоянное внимание и заботу при выполнении данной работы. Работа выполнена при финансовой поддержке фанта МНТЦ . Глава История ККГЛ восходит к началу июня года, когда в северозападной части Крымского полуострова стали возникать случаи опасного эпидемического заболевания с выраженным геморрагическим синдромом. В гг. Чумаков М. П. и др. Последующие клиникоэпидемиологические исследования существенно расширили представления об ареале ККГЛ. Так, в Таджикистане с по год было выявлено случаев заболевания, из них . Пак Т. П. в Чимкентской области Казахстана случай, из них . Теримбеков Ж. М. и др. Болгарии 5 случаев, из них 8 . Василенко С. М. и др. Ростовской области 4 случая, из них . Лебедев А. Д. и др. Отмечены также заболевания в Краснодарском крае на Таманском полуострове Ковальский Г. Н. и др. Ставропольском крае Яровой Л. В. и др. Астраханской области Возжаева А. П. и др. В Узбекистане Ходукин Н. И.и др. Мелиев А. Туркмении Пак Т. П. и др. Киргизии Карась Ф. Р. и др. Армении Карапетян . . и др. В ходе дальнейших исследований удалось выделить фильтрующийся этиологический агент из крови больных и перезимовавших голодных клещей Чумаков М. П. и др. Чумаков М. П. и др. Совместными исследованиями советских Чумаков М. П. и др. . Конго, впервые выделенного в году в Заире из крови больного ребенка i . .. Юг России Калмыкия, Дагестан, Краснодарский и Ставропольский края, Астраханская, Волгоградская и Ростовская области . Чумаков М. П. и др. Мирзоева Н. М., , . I. . i . После года присутствие вируса ККГЛ было подтверждено в южной Африке . . . ОАЭ vi . i . . . Кувейте i . Ираке i . . . iii . . . Иране . Пакистане i , . Индии i . Греции ii . ЮАР . . . . Либерии v . Верхней Вольте . . . Китае . ., . Мавритании i . . . . Мадагаскаре i . . . Судане i . . . Омане i . . . Саудовской Аравии . Намибии . . . Косово . Албании . . Из этих данных видно, что вирус ККГЛ имеет достаточно широкий ареал распространения i, . . .