Идентификация генетических маркеров, ассоциированных с предрасположенностью к сахарному диабету тиа 1, на хромосомах 1,2,5 и 16

• Автор: Чернышева Ана
• Шифр специальности: 03.00.03
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2007
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 125 с. : ил.

1. Обзор литературы

1.1 Общая характеристика СД типа

1.2 Концентрация СД типа 1 в семьях больных

1.3 Вклад генетических и негенетических факторов в развитие СД типа

1.4 Полиморфные участки ДНК

1.4.1 Т ипы полиморфизма

1.4.2 Методы выявления полиморфизма ДНК

1.5 Стратегии изучения мультифакторных заболеваний

1.5.1 Тест на неравновесную передачу аллелей

1.6 Молекулярногенетические маркеры СД типа

1.7 Молекулярные механизмы возникновения аутоиммунной реакции при СД типа

1.8 Характеристика исследуемых в работе локусов и генов
1.8.1 Локус 7д на хромосоме 1 и ген ТАР5Ь
1.8.2 Локус ЮОМ7 на хромосоме 2
1.8.3 Локус ЮОМ на хромосоме
1.8.4 Локус ЮОШ8 и ген ИВ
1.8.5 Локус Заключение
2. Материалы и методы
2.1 Реактивы и ферменты
2.2 Буферные растворы
2.3 Формирование группы пациентов
2.4 Выделение геномной ДНК человека методом фенол хлороформной экстракции
2.5 Амплификация ДНК
2.6 Расщепление продуктов амплификации рестриктазами
2.7 Электрофоретическое разделение ДНК
2.8 Компьютерный анализ нуклеотидных последовательностей
2.9 Статистическая обработка результатов
2.9.1 Проверка на подчинение равновесию ХардиВайнберга и неравновесие по сцеплению
2.9.2 Методы анализа сцепления генетического маркера с заболеванием
2.9.3 Поправка Бонферрони
3. Результаты и обсуждение
3.1 Изучение сцепления полиморфных маркеров в хромосомной области 1д с СД типа
3.1.1 Выбор полиморфных маркеров в области
3.1.2 Идентификация аллелей полиморфных микросателлитных маркеров в хромосомной области
3.1.3 Изучение сцепления полиморфных маркеров в области 7 с СД типа
3.1.4 Изучение ассоциации аллелей полиморфных маркеров в области 7 с СД типа
3.1.5 Выбор генакандидата, продукт экспрессии которого может быть задействован в механизме развития СД типа 1 в области 1д у русских
3.1.6 Выбор точечных полиморфных маркеров для изучения сцепления в хромосомной области 7 с СД типа
3.1.7 Изучение сцепления аллелей нуклеотидных полиморфных маркеров в хромосомной области 7 с СД типа 1 у русских
3.2 Изучение сцепления полиморфных маркеров в хромосомной
области с СД типа
5.2.7 Выбор полиморфных маркеров в области 7б
3.2.2 Идентификация аллелей полиморфных микросателлитных маркеров хромосомной области
3.2.3 Изучение сцепления полиморфных маркеров в области с СД типа
3.2.4 Изучение ассоциации аллелей полиморфных маркеров в области с СД типа
3.3 Изучение сцепления полиморфных маркеров в хромосомной области 2ЗЗЗ с СД типа
5.5.7 Выбор полиморфных маркеров в области
3.3.2 Идентификация аллелей полиморфных микросателлитных маркеров хромосомной области 2ЗIЗЗ
3.3.3 Изучение сцепления полиморфных маркеров в области 2 с СД типа
3.3.4 Изучение ассоциации аллелей полиморфных маркеров в области 2 с СД типа
3.4 Изучение сцепления полиморфных маркеров в хромосомной области 2 с СД типа
3.4.1 Выбор полиморфных маркеров в области
3.4.2 Идентификация аллелей полиморфных микросателлитных маркеров в хромосомной области
3.4.3 Изучение сцепления полиморфных маркеров в области 2 с СД типа
3.4.4 Изучение ассоциации аллелей полиморфных маркеров в области 2 с СД типа
3.5 Изучение сцепления полиморфных маркеров в хромосомной области 5.7.
3.5.1 Выбор полиморфных маркеров в области 5.7.
3.5.2 Идентификация аллелей полиморфных микросателлитных
маркеров в хромосомной области 5дЛдЗЗЛ
3.5.3 Изучение сцепления полиморфных маркеров в области 5дЛд.1 сСДтипа
3.5.4 Изучение ассоциации аллелей полиморфных маркеров в области 5.7.7 с СД типа
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
ВВЕДЕНИЕ


Изучение сцепления полиморфных маркеров в хромосомной области 5. Выбор полиморфных маркеров в области 5. Изучение сцепления полиморфных маркеров в области 5дЛд. Изучение ассоциации аллелей полиморфных маркеров в области 5. Сахарный диабет СД типа 1 является распространенным и тяжелым наследственным заболеванием человека. Нарушение метаболизма глюкозы при СД типа 1 возникает изза аутоиммунного разрушения бетаклеток поджелудочной железы, вследствие чего они теряют способность вырабатывать инсулин. Пути развития заболевания к настоящему времени изучены неполностью, но известно, что СД типа 1 формируется при взаимодействии нескольких генетических компонент и факторов внешней среды. Как правило, при наличии генетической предрасположенности, СД типа 1 развивается в раннем возрасте и вызывает поражения кровеносных сосудов, почечную недостаточность, слепоту, гангрены и другие тяжелые осложнения. С помощью своевременной профилактики заболевания у пациентов с повышенным генетическим риском можно значительно отсрочить появление симптомов СД и снизить опасность развития осложнений. Поэтому в настоящее время главным является разработка стратегии ранней диагностики, прогнозирования и превентивной терапии заболевания с использованием генетических маркеров. Полигенная природа СД типа 1 доказана последними работами по поиску локусов предрасположенности к заболеванию с использованием мультилокусного анализа сцепления. Удалось обнаружить более локусов предрасположенности к СД типа 1. К сожалению, результаты оказались противоречивыми и сильно зависели от этнотерриториальной принадлежности использованных выборок. Только для двух локусов существуют четкие доказательства их связи с СД типа 1. Это главный комплекс гистосовместимости МНС и полиморфный повтор в гене инсулина I. Каждая из таких работ вносит свой вклад в понимание процессов, приводящих к СД типа 1. К настоящему времени усилиями зарубежных исследовательских групп с использованием семей с сибсами, больными СД типа 1, проведено генетическое картирование и анализ сцепления этих локусов с СД типа 1 в этнических группах Европы, Северной Америки и Азии. Показано, что значимыми локусами по вкладу в семейный риск развития заболевания являются, ЮйМ 2д, ЮВМ . ЮГМ7 , а также хромосомные области и . Однако для популяций России подобные исследования ранее не проводились. Установление сцепления полиморфных маркеров с СД типа 1 поможет разработать дифференцированный подход к профилактике и лечению данной патологии. Целью данной работы являлся поиск полиморфных маркеров, сцепленных с СД типа 1, в хромосомных областях 1д, 2дд, 2д, 5д. Провести анализ сцепления и ассоциации с сахарным диабетом типа 1 группы полиморфных маркеров в хромосомной области с использованием семей с наличием заболевания у сибсов. Провести анализ сцепления и ассоциации с сахарным диабетом типа 1 группы микросателлитных полиморфных маркеров в хромосомной области ч. Провести анализ сцепления и ассоциации с сахарным диабетом типа 1 группы микросателлитных полиморфных маркеров в хромосомных областях 2 и 2. Провести анализ сцепления и ассоциации с сахарным диабетом типа 1 однонуклеотидного полиморфного маркера в гене 1Ы2В в хромосомной области 5. При наличии ассоциации проанализировать функции генов в областях и я, определить гены, которые по своим функциям могут быть задействованы в развитии СД типа 1. В данной работе впервые была изучена ассоциация полиморфных маркеров в хромосомных областях Ц, 2я, 2у 5я. России. Обнаружена статистически достоверная ассоциация с СД типа 1 в областях Ц и 2.