Исследование ассоциации ряда генов-кандидатов с хроническим гломерулонефритом

• Автор: Шестаков, Алексей Евгеньевич
• Шифр специальности: 03.00.03
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2006
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 95 с. : ил.

ОГЛАВЛЕНИЕ
Введение

1.Обзор литературы

1.1 .Полиморфные маркеры

1.1.1.Типы полиморфизмов и методы их исследования

1.1.2. Использование полиморфных маркеров в исследовании

генетики многофакторных заболеваний

1.2. Характеристика хронического гломерулонефрита

1.2.1 .Классификация хронического гломерулонефрита

1.2.2. Иммунные механизмы развития гломерулонефрита

1.2.3. Генетические факторы риска развития хронического гломерулонефрита

. Характеристика исследованных в работе генов и полиморфных
маркеров
1.3.1. Ген подоцина
1.3.2. Г ен нефрина
1.3.3. Ген антагониста рецептора интерлейкина1
1.3.4. Гены 1Ь4 и 1ЫЗ
1.3.5. Г ены НЬА О области
1.3.6. Г ен поверхностного антигена цитотоксических Тлимфоцитов
1.3.7. Ген белка супрессора опухолей
1.3.8. Ген белка ингибитора Р
1.3.9. Ген полиАГРрибозилполимеразы 1
2.Материалы и методы
2.1 .Реактивы и ферменты
2.2.Буферные растворы
2.3. Буферы для рестрикции
2.4. Формирование групп больных и здоровых индивидов
2.5. Выделение геномной ДНК человека методом фенолхлороформной экстракции
2.6.Амплификация ДНК 4
2.7. Расщепление продуктов амплификации рестриктазами
2.8. Электрофоретическое разделение ДНК
2.9.Статистическая обработка результатов
2.9.1. Сравнение выборок по частотам аллелей и генотипов. Точный критерийФишера. Поправка Бонферрони
2.9.2. Оценка относительного риска. i. Доверительный интервал 5
З.Результаты и их обсуждения
3.1. Изучение ассоциации полиморфных маркеров ряда геновкандидатов с хроническимгломерулонефритом
3.2. Изучение ассоциации полиморфных маркеров 1 и 9 гена 2 с ХГН. 5
3.3. Изучение ассоциации полиморфного маркера 7 гена 1 с ХГН 5
3.4. Изучение ассоциации полиморфного минисателлита во втором интроне гена. I1 с ХГН 6
3.5. Изучение ассоциации полиморфных маркеров С0Тгена I4 и генаГЗ с ХГН.
3.6. Изучение ассоциации полиморфных микросателлитов 6 и 6 локализованных рядом с генами с ХГН
3.7. Изучение ассоциации полиморфного маркера 7 гена 4 с ХГН 6
3.8. Изучение ассоциации полиморфного маркера гена ТР с ХГН
3.9. Изучение ассоциации полиморфного маркера 9 гена 2 с ХГН 6
3 Изучение ассоциации полиморфных маркеров V2 и гена 1 с ХГН
Выводы 7
Список литературы


Сравнение выборок по частотам аллелей и генотипов. Точный критерийФишера. Оценка относительного риска. i. Изучение ассоциации полиморфных маркеров 1 и 9 гена 2 с ХГН. Изучение ассоциации полиморфного минисателлита во втором интроне гена. Изучение ассоциации полиморфных маркеров С0Тгена I4 и генаГЗ с ХГН. В общей сложности, по данным крупных европейских медицинских центров, наследственные гломерулопатии занимают от 6,5 до среди патологий, ведущей к хронической почечной недостаточности ХПН. Связь той или иной патологии почек с генетическими дефектами может помочь выработать тактику терапии этих заболеваний. Роль генетики в развитии нефрологии состоит не только в выявлении генетической компоненты заболевания, но и в изменении представлений о так называемых приобретенных заболеваниях, появлении новых концепций механизмов развития болезни, дополнении информации о предохраняющих и предрасполагающих факторах в развитии заболеваний, а также формировании гипотезы о совокупности экзогенных и эндогенных факторов, приводящих к болезни. Для многофакторных заболеваний характерен сложный механизм формирования фенотипа, в основе которого лежит взаимодействие генетических факторов с факторами внешней среды. Однако для каждого конкретного заболевания можно выделить группу, так называемых геновкандидатов, продукты которых могут быть прямо или косвенно вовлечены в развитие данной патологии. Одним из наиболее перспективных направлений в современной молекулярной генетике заболеваний является поиск полиморфных маркеров в генахкандидатах и выявление их ассоциации с наследственными заболеваниями. Установление ассоциации гена с заболеванием и последующая оценка индивидуального генетического риска имеют важное значение для разработки дифференцированного подхода к профилактике и лечению данной патологии и ее осложнений в зависимости от наследственной предрасположенности конкретного больного. Цель и задачи работы. Целью данной работы явилось изучение ассоциации ряда полиморфных маркеров геновкандидатов с развитием хронического гломерулонефрита. Этими маркерами были полиморфные маркеры внутри генов кодирующих подоцин 2, нефрин 1, антагонист рецептора интерлейкина 1 I1, интерлейкин 4 I4, интерлейкин I, поверхностный антиген цитотоксических Тлимфоцитов 4, супрессор опухолей ТР, главный регулятор супрессора опухолей 2 и полиАГРрибозилполимеразу 1 1. Кроме того, использовались микросателлитные маркеры 6 и 6, расположенные рядом с генами класса II. Определить частоты аллелей и генотипов полиморфных маркеров генов 2, 1, I1, I4, I, 4, ТР, 2 и 1, а также, полиморфных микросателлитов 6 и 6 в группе больных ХГН и в группе здоровых доноров. Провести сравнительный анализ распределения аллелей и генотипов полиморфных маркеров, расположенных в вышеуказанных генахкандидатах, и двух микросателлитов в исследованных выборках для выявления их ассоциации с развитием ХГН и определения вклада данных генов в наследственную предрасположенность к патологии. Научная новизна работы. И4, СА гена 1ЫЗ, А1аТИг гена СТЬА4, РгоАг гена ТР, О9Т гена МОМ2, УаА1а и 1еиРке гена АОРКТ ХГН, проживающих в г. Москве. Практическая ценность работы. Выявление аллельных вариантов полиморфных маркеров различных геновкандидатов, обуславливающих повышенный генетический риск развития хронического гломерулонефрита, создает базу для разработки диагностических методов прогнозирования течения заболевания.