Исследование ассоциации ряда генов системы гемостаза с ишемической болезнью сердца

• Автор: Чудакова, Дарья Александровна
• Шифр специальности: 03.00.03
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2005
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 145 с. : ил.

1.1. Полиморфные маркеры

1.1.1. Типы полиморфизмов и методы их исследования

1.1.2. Использование полиморфных маркеров в исследовании

генетики многофакторных заболеваний.

1.2. Ишемическая болезнь сердца.

1.2.1. Основные аспекты этиологии и патогенеза ишемической

болезни сердца

1.2.2. Генетические факторы риска развития

ишемической болезни сердца

1.2.3. Инфаркт миокарда.

1.3. Система гемостаза

1.4. Характеристика исследованных в работе генов и
полиморфных маркеров
1.4.1. Ингибитор активатора нлазминогена типа 1. Ген РЬАМН1. Полиморфные маркеры гена и их ассоциация с ИБС и ИМ.
1.4.2. Фактор свертывания крови V. Ген Р5. Полиморфные маркеры
гена и их ассоциация с ИБС и ИМ.
1.4.3. Интсгрин ПЬрЗ. Ген 7Т. Полиморфные маркеры гена, и их ассоциация с ИБС и ИМ.
1.4.4. Ген ЮАЗВ. Полиморфные маркеры гена и их ассоциация с ИБС
1.4.5. Фактор свертывания крови VII. Ген Р7. Полиморфные маркеры гена и их ассоциация с ИБС и ИМ.
1.4.6. Протеин С. Ген РКОС. Полиморфные маркеры гена
и их ассоциация с ИБС и ИМ
1.4.7. Тромбомодулин. Ген ТИВО. Полиморфные маркеры гена
и их ассоциация с ИБС и ИМ
1.4.8. Фибриноген. Ген ГС. Полиморфные маркеры гена
и их ассоциация с ИБС и ИМ
2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ.
2.1. Реактивы и ферменты
2.2. Буферные растворы
2.3. Формирование групп больных и здоровых индивидов
2.4. Выделение геномной ДНК.
2.5. Амплификация ДНК.
2.6. Расщепление продуктов амплификации рестриктазами.
2.7. Электрофоретическое разделение ДНК.
2.8. Определение уровня фибриногена в крови.
2.9. Статистическая обработка результатов.
2.9.1. Сравнение выборок по частотам аллелей и генотипов.
Точный критерий Фишера
2.9.2. Оценка отношения шансов. Доверительный интервал
2.9.3. Построение кривых КапланаМейера.
2.9.4. Компьютерный анализ нуклеотидных последовательностей
I 3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ИХ ОБСУЖДЕНИЕ
3.1.1. Исследование ассоциации полиморфного маркера 4СС
гена Р1АШ1 с ИБС и ИМ.
3.1.2. Исследование ассоциации полиморфных маркеров Абап, Аг6Ткг и С6Т гена Г5 с ИБС и ИМ.
3.1.3. Исследование ассоциации полиморфного маркера А1А2 гена 1ТвВЗ с ИБС и ИМ
3.1.4. Исследование ассоциации полиморфного маркера НРАЗаЗЬ
гена 1ТСА2В с ИБС и ИМ
3.1.5. Исследование ассоциации полиморфных маркеров Аг3Ып
и аЗА гена Г7 с ИБС и ИМ
3.1.6. Исследование ассоциации полиморфных маркеров СТ и
4 гена с ИБС и ИМ
3.1.7. Исследование ассоциации полиморфного маркера 5V
гена с ИБС и ИМ
3.1.8. Исследование ассоциации полиморфного маркера
гена с ИБС и ИМ.
3.2. Исследование ассоциации полиморфных маркеров ряда геновкандидатов с неблагоприятным исходом ИБС
3.2.1. Изучение ассоциации полиморфного маркера СТгена с неблагоприятным исходом ИБС
3.2.2. Изучение ассоциации полиморфного маркера 5 гена
с неблагоприятным исходом ИБС
4. ВЫВОДЫ
5. СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ.
ВВЕДЕНИЕ


Определить частоты аллелей и генотипов полиморфных маркеров генов, кодирующих фактор свертывания крови V 1Р5, фактор свертывания крови VII Р7, Рцепь фибриногена СВ, рЗсубъединицу интегрина аИЬрЗ 3, аЬсубъединицу интегрина аНЬрЗ 1ЮА2В, ингибитор активатора плазминогена типа 1 РЬАМШ, протеин С РЯОС и тромбомодулин ТНВЦ в группах больных ишемической болезнью сердца и инфарктом миокарда, а так же в группе здоровых индивидов среди русских г. Москвы. Провести сравнительный анализ распределения аллелей и генотипов полиморфных маркеров данных геновкандидатов в исследованных выборках больных и здоровых индивидов для выявления ассоциации изученных маркеров с развитием болезни и определения вклада данных генов в наследственную предрасположенность к патологии. Полиморфные маркеры. Типы полиморфизмов и методы их исследования. В связи с расширением технических возможностей молекулярной биологии и достижениями в изучении генома человека расшифровка протяженных нуклеотидных последовательностей, картирование генов, изучение их структуры, полиморфизма, регуляции экспрессии и т. Широко применяются в современной молекулярной генетике заболеваний полиморфные маркеры т. Поиск полиморфных маркеров заболевания это перспективный подход к оценке генетической предрасположенности к мультифакторным генетическим заболеваниям. Полиморфизм представляет собой наличие нескольких аллельных вариантов гена или участка ДНК. В настоящее время полиморфизм найден в митохондриальной и ядерной ДНК, в кодирующей и не кодирующей частях последней, в ее уникальных и повторяющихся последовательностях Алтухов, . Однонуклеотидные полиморфизмы i i i. Полиморфизм типа вставкаотсутствие вставки I iii. Повторяющиеся последовательности ДНК делятся на высокоповторяющиеся свыше 0 тыс. Первые два типа объединяют в группу так называемых рассеяных последовательностей классов I и I, разбросанных по всему геному в виде единичных мотивов. Последовательности класса I состоят из рассеянных элементов длиной менее 0 п. I входят мотивы размером свыше 0 п. Примером последних могут служить повторы типа варьирующие по длине от 0. Другой большой группой повторяющихся последовательностей являются тандемные повторы. Они составляют в среднем около генома человека и состоят из следующих друг за другом повторяющихся нуклеотидных звеньев с некоторой общей последовательностью. Микро и минисателлитные последовательности состоят из тандемно повторенных копий так называемых коровых от английского последовательностей длиной от двух до нескольких тысяч пар оснований. Микросателлиты это класс нуклеотидных повторов, включающих от двух до пяти звеньев с размером повторяющегося участка мотива нуклеотидов i, . Размер повторяющихся единиц в минисателлитных последовательностях может меняться от 9 до 0 нуклеотидов , . Отличительной особенностью микро и минисателлитов является наличие среди них большого количества участков, вариабельных по числу копий в кластере варьирующие по числу тандемные повторы V, vi . Индивидуальные аллели таких локусов отличаются друг от друга числом тандемно повторяющихся копий. Количество высокоизменчивых микро и минисателлитных последовательностей в геноме человека, повидимому, превышает
несколько десятков тысяч они достаточно плотно и равномерно расположены в каждой из хромосом i, . Микросателлиты, обозначаемые так же или i , также обладают высоким уровнем полиморфизма, исходя из числа коровых единиц. В зависимости от длины повторяющегося звена разделяются на МОНО, ди, три, тетра и пентануклеотидные микросателлиты. Подавляющее большинство ди и более нуклеотидных микросателлитов полиморфны. Повторяющиеся мотивы САП являются самыми распространенными среди ди нуклеотидных повторов в геноме млекопитающих ii, . В ДНК человека предположительно насчитывается от до 0 тыс. САП, содержащих от до звеньев, т. Функции повторов САП не известны, но предполагается, что они являются горячими точками рекомбинации и содержат энханссрныс участки, усиливающие экспрессию генов. Ди, тстра и пентануклеотидные микросателлиты отмечены только в некодирующих участках генов и в межгенных областях ДНКВ экзонах обнаружены лишь тримерные тандемные повторы. Тетрануклеотидные мотивы типа АААТ или , обогащенные остатками аденозина, часто встречаются в виде полиморфных трактов в составе повторов ,. По приблизительной оценке, в геноме человека содержится до тыс.