Изучение двух групп уникальных - ΦKZ-подобных и Т7-подобных бактериофагов Pseudomonas aeruginosa

• Автор: Буркальцева, Мария Владленовна
• Шифр специальности: 03.00.03
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2005
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 116 с. : ил.

Оглавление
ВВЕДЕНИЕ

ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1. i как условный патоген

2. Классификация бактериофагов . i

2.1. Морфология бактериофагов . i.

2.2. Гомология геномов бактериофагов . i

3. Модульная теория и эволюция бактериофагов

3.1. Модульная теория эволюции

3.2. Супергруппы бактериофагов

3.2.1. Фагитранснозоны.

3.2.2. Т4подобныс бактериофаги.
3.2.3. Т7подобныс бактериофаги .
4. Фаготерапия
4.1. Использование бактериофагов . i в фаготерапии
4.2. Проблемы использования живых вирулентных бактериофагов в фаготерапии
4.2.1. Общая и специализированная траисдукция.
4.2.2. Фаговая конверсия
4.2.3. Пссвдолнзогсппя
5. Бактериофаг . i
5.1. Биологические свойства бактериофага фКг
5.2. Структура частицы бактериофага .
5.3. Геном фага .
5.3.1. Основные свойства и организация генома .
5.3.2.рсдполагасмыс промоторы и терминаторы.
5.3.3 Вирускодпрусмыс тРНК.
5.4. Предполагаемые генные продукты бактериофага
5.4.1. Сходство генных продуктов фага с известными белками
5.4.2. Иитроикодирусмыс эндонуклеазы.
5.4.3. Генные продукты, вовлеченные в метаболизм нуклеотидов
Щ 5.4.4. Репликация ДНК.
5.4.5. Белки фага , родственные белкам других бактериофагов
5.4.6. Белки фаговой частицы
5.5. Бактериофаги группы фК2
ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТ
МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ.
1. ФК2П0Д0БПЫЕ БАКТЕРИОФАГИ
1.1. Сравнение биологических свойств фагов
1.1.1. Бактериофаги и их происхождение
1.1.2. Выделение новых фК2подобпых бактериофагов.
1.1.3. Фенотип негативных колонии фагов.
1.1.4. Сравнение морфологии фаговых частиц
1.1.5. Пссвдолизогения
1.1.6. Спектр литнчсской активности.
1.1.7. Способность к общей транслукции
1.1.8. Инактивация сывороткой.
1.2. Сравнение геномов фК2нодобиых фагов.
1.2.1. Сравнение размеров геномов.
1.2.2. Сравнение рестрикционных профилен ДНК
1.2.3. Определение гомологии ДНК
1.3. Сравнение полипептидиого состава зрелых частиц.
1.4. Некоторые особенности предполагаемых генных продуктов фага фК2.
1.5. Обсуждение.
1.5.1.Эволюция группы фКгподобпых бактериофагов
1.5.2. Возможность использования фКгподобпых фагов в фаготерапии.
2. БАКТЕРИОФАГ фКМУ.
2.1. Биологические свойства фага фКМV.
2.1.1. Выделение фага фКМУ и внешние признаки негативных колоний
2.1.2. Морфология фаговых частиц
2.1.3. Спектр литнчсской активности.
2.1.4. Рост и развитие фага
2.2.1 зучспис генома фага фКМУ.
2.2.1. Размер и вСсостав генома
2.2.2. Рестрикционный анализ ДНК
2.2.3. Характеристика генома фКМУ, полученная на основе анализа полной
последовательности ДК.
2.3. фКМУнодобиые бактериофаги.
2.3.1. Выделение новых фКМУподобных бактериофагов
2.3.2. Морфология фаговых частиц
2.3.3. Изучение генома новых фКМУподобиых бактериофагов
2.3.4. Спектр литической активности.
2.3.5. Феномен взаимодействия фКМУнодобных и некоторых фнодобпых фагов.
2.4. Обсуждение.
2.4.1. Эволюция фКМУподобиых фагов.
2.4.2. Возможное практическое применение фагов вида фКМУ
ВЫВОДЫ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ


i ii при кистозном фиброзе. В стационарах подобным образом . Клетки . . ., . Основными факторами вирулентности . v С. К. . Поскольку . i . Перечень антибиотиков, к которым чувствительна эта псевдомонада, невелик. К ним относят амииогликозиды тобрампцин, амикацип, цсфалоснорипы III цсфоперазон, цефспим и IV цефспим поколений, а также один из представителей фторхниолоной группы ципрофлоксацпи Яковлев С, Яковлева В. П., . Вместе с тем, даже они не всегда способны купировать ссптпцсмнчсскис состояния. Ограниченные возможности аитибпотнкотсрапип, отсутствие падежных препаратов специфической и исспецифическон профилактики инфекций, вызываемых бактериями Р. Классификации бактериофагов Р. В природных условиях фаги встречаются там же, где размножаются их хозяева бактерии соответствующих видов н штаммов. Частоты встречаемости фагов у разных видов бактерий в природных условиях существенно различаются. Фаговые потенциалы количество разных видов фагов и разнообразие отдельных фагов в пределах их вида также существенно различаются по величине для бактерий разных видов, даже в пределах родственных групп. Среди иссвдомаиад наибольшим фаговым потенциалом обладает Р. v V. . , , но даже и в этом случае многие виды фагов представлены единичным фагом Шарнбжаиова Т. О. и др. Расширение коллекции фагов и последующая их классификация до вида являются не только важной частью фундаментальных исследований. Они должны стать центральными аспектами фаготерапии, предваряющими выбор бактериофагов особенно при терапии живыми природными фагами Крылов В. Н., . Морфологии бактериофагов . Фаги различаются по морфотипу вирусной частицы, типу нуклеиновой кислоты, несущей наследственную информацию, размеру генома и характеру его репликации. Имеется определенная корреляция морфотипа и тина нуклеиновой кислоты, используемой фагом в качестве генома. ДНК, нитевидные фаги кольцевую одионитсвую ДНК Крылов В. Н., . . Группа семейств фагов с двунитсвой ДНК в качестве генома. Хвостатые фаги vii, vii, vii. Бесхвостые фаги ivii, ivii, vii, группа V1, iixivii. Б. Группа семейств агов с однойитевой ДНК в качестве генома ivii, Ivii Ivi, Ivii Ivi. . Семейство фагов с двупптсвой РНК в качестве генома vii. Г. Семейство фагов с одиоинтсвой РНК vivii. Типичные для бактерий хвостатые фаги не описаны среди вирусов эукариот. Особенности морфотнпа хвостатых фагов обусловлены активным способом введения в клетку генетического материала адсорбция па специфических бактериальных рецепторах с использованием специфических белков хвоста, иногда прокол наружных клеточных покровов после их предварительного разрыхления ферментами, иногда использование тех или иных пор в покровах бактерии. По классификации Международного комитета по таксономии вирусов iii Vi, , , II. ,, . , , все бактериофаги . Морфология Вирусные частицы состоят из головки капенда, хвостового отростка и фиксированных органелл. Головка изометрическая или вытянутая, в форме икосаэдра или производной от него. Изометрические головки 0 нм в диаметре, вытянутые до 0 нм в длину. Хвостовые отростки могут быть сократимыми или несократимыми, спиральными, длинными или короткими. Они могут иметь базальные пластинки, шипы или нити. Физикохимические свойства 0 х 6 , может быть больше. Плавучая плотность 1. Инфекционная активность устойчива к эфиру и хлороформу. Чувствительность к детергентам варьирует. Нуклеиновая кислота Одна молекула линейной двухцепочечиой ДИК. состав обычно близок к составу хозяина. Гены со связанными функциями часто объединены в одни кластер. Белки Вирусные частицы содержат много различных полипептидов. Лизоцим локализован в конце хвостового отростка. Могут присутствовать другие ферменты. Но структуре хвостового отростка фаги разделяют на три семейства.