Эволюционный анализ длинных концевых повторов эндогенных ретровирусов генома человека

• Автор: Артамонова, Ирена Игоревна
• Шифр специальности: 03.00.03
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2002
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 94 с. : ил

Это непосредственно экспрессия вирусных генов, геномные перестройки, являющиеся результатом интеграции V, и участие целого ряда регуляторных элементов, входящих в состав последовательности ретровируса, в экспрессии генов клеткихозяина vv. В настоящее время изучению биологической активности эндогенных ретровирусов посвящено немало работ, однако мы все еще далеки от полного понимания всех функций V в геноме. Основные регуляторные элементы V, такие как промотор, энхансер, сигнал полиаденилирования, последовательности, связывающие ядерные рецепторы гормонов и т. Кроме того, зачатую гомологичная рекомбинация между 3 и 5 приводит к делеции структурных вирусных генов и образованию в геноме одиночных , в результате чего количество последних, как правило, сильно превышает количество полных провирусов в геноме. Поэтому одиночные эндогенных ретровирусов человека заслуживают отдельного внимания. Среди известных семейств эндогенных ретровирусов всего их более двадцати изучаемое нами семейство V 2 привлекает к себе внимание по нескольким причинам. Это семейство относительно обширно в гаплоидном геноме присутствуют около полноразмерных элементов некоторые его представители транскрипционно активны и содержат хорошо сохранившиеся в процессе эволюции открытые рамки считывания i вирусных белков. В отличие от представителей большинства других семейств V, VК кодируют функциональные ферменты, вирусные частицы и аутоантигены, что указывает на сохранение у некоторых из них свойств ретровирусов . Вирусные частицы V. Таким образом, семейство V 2 можно считать одним из наиболее биологически активных семейств V и мы остановимся на описании его характеристик несколько подробнее. История изучения ретровирусов берет свое начало в году, когда Эллерман и Бенг обнаружили, что лейкоз кур передается бескпеточными фильтратами, что и стало доказательством вирусной природы инфекционного агента. В году Раус открыл вирус, вызывающий злокачественные опухоли у кур. В середине х годов был найден первый ретровирус млекопитающих вирус, ассоциированный с раком молочных желз мышей Vi V. Около двадцати лет спустя было показано существование V, родственных экзогенным, сначала для мышей, а затем для цыплят. После независимого открытия в году Теминым и Балтимором фермента обратной транскриптазы в составе вирусов, возросла интенсивность поисков человеческих ретровирусов. В году Ахонг вместе с коллегами выделил первый vi. Исходно эти вирусы были обнаружены как инфекционные загрязнения первичных клеточных культур. Спумавирусы могут вызывать острые или персистентные инфекции i vi, но связи этих вирусов с какимито патологическими процессами в организме хозяина не установлено ii, . В начале х годов были открыты вирус Тклеточной лейкемии i Vi V i . Iii Vi IV Ваггеii . К этому же времени относятся и первые описания V i . V i . К настоящему времени открыто более двадцати семейств V приматов и человека i i, . Представители некоторых из них распространены не только среди приматов, но и в других отрядах млекопитающих i . Семейство V 2, напротив, распространено в основном среди приматов Старого Света, хотя недавно V были обнаружены и у приматов Нового Света i . Первый представитель семейства V был обнаружен в геноме человека при гибридизации с зондом гена цитоплазматических вирусоподобных частиц Ii i I сирийского хомячка. Для него также было показано наличие значительного сходства с V . В настоящее время V продолжают оставаться предметом интенсивного разностороннего изучения, а исследование эволюционного и регуляторного взаимодействия генома ретровируса с геномом человека составляет один из разделов геномики. Несмотря на разнообразие видовхозяев и вызываемых заболеваний, все ретровирусы имеют сходную структуру вириона, геномную организацию и репликативный цикл. Круглый вирион ретровируса имеет диаметр около 0 нм и состоит из нуклеокапсида окружнного липидной оболочкой. Последняя образуется из плазматической мембраны клеткихозяина, с присоединнным к ней изнутри матриксным белком ix i МА, продуктом гена ii i, трансмембранным белком i ТМ и связанным с ним поверхностным белком i , которые, в свою очередь, являются продуктами гена v v.