Секвенирование и анализ генома вируса оспы обезьян

• Автор: Уварова, Елена Александровна
• Шифр специальности: 03.00.03
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2004
• Место защиты: Кольцово
• Количество страниц: 189 с. : ил.

1. Обзор литературы.

1.1. История открытия вируса оспы обезьян

1.2. Оспа обезьян у животных

1.3. Оспа обезьян у человека

1.3.1. Вспышки оспы обезьян у человека

1.3.2. Клинические проявления оспы обезьян у человека.

1.3.3. Эпидемиология и экология ВОО.

1.4. Биологические свойства вируса оспы обезьян.

2. Материалы и методы.

2.1. Материалы

2.2 Методы.
3. Результаты и обсуждение
3.1. Создание клонотеки рекомбинантных плазмид, содержащих фрагменты геномной ДНК штамма II вируса оспы обезьян.
3.2. Создание клонотеки рекомбинантных плазмид, содержащих фрагменты геномной ДНК штамма 8 вируса оспы обезьян.
3.3. Расшифровка нуклеотидных последовательностей генома ВОО
3.4 Анализ организации генома вируса оспы обезьян
3.4.1. Сравнительный анализ нуклеотидных последовательностей генома двух штаммов ВОО
3.4.2. Сравнительный анализ последовательностей из генома ВОО с гомологичными последовательностями из геномов других ортопоксвирусов
4. Заключение
5. Выводы
6. Приложение 1

7. Приложение 2.
8. Список литературы

Список сокращений
I А ii
I А ii i i
Сгш модулятор действия цитокинов i i ii гены гены круга хозяев
I интерферон интерлейкин
неповторяющиеся последовательности i

I ингибиторы сериновых протеаз i Iii
I концевые инвертированные повторы i Iv
фактор некроза опухоли i
V вирусный комплементсвязывающий белок Vi ii i
V вирусный фактор Vi
дцРНК дву цепочечная РНК
ТК тимидинкиназа
ВВО вирус ветряной оспы
ВНО вирус натуральной оспы
ВНО, штамм
I ВНО, штамм Ii
ВОВ вирус осповакцины
ВОВСОР ВОВ, штамм
ВОВ, штамм
ВОВБ вирус оспы верблюдов
ВОК вирус оспы коров
I ВОК, штамм I
ВОО вирус оспы обезьян
вирус оспы обезьян, штамм
I вирус оспы обезьян, штамм II
ВОЗ Всемирная Организация Здравоохранения
ДРК Демократическая Республика Конго ранее Заир
ИПТГ ИзопропилРОтиогалактозид
X 5бром4хлорЗиндолилр0галактопиранозид
,, тетраметилзтилендиамид
кДа килодальтон
ОРТ открытая рамка трансляции
ао аминокислотный остаток
е.а. единицы активности
п.н. пара нуклеотидов
т.п.н. тысяч пар нуклеотидов
ПЦР полимеразная цепная реакция
АГА антигемап лютинация
РТГА реакция торможения гемагтл юти нации
ИФА иммуноферментный анализ
ХАО хориоаллантоисная оболочка
Памяти Рязанкиной О.И. и Петрова НЛ. посвящается
ВВЕДЕНИЕ


Масаса , макака яванская , макака лалундер Масаса i. МайИюнь г. США Луговая собачка . Северная Америка Около дней. Однако при исследовании более сывороток от обезьян из Индии, Индонезии, исследовании более сывороток от обезьян из Индии, Индонезии, Японии и Малайзии антител к ортопоксвирусам выявлено не было i . После сообщения в начале х годов XX века о первых случаях выявления оспы обезьян у людей были исследованы сыворотки обезьян и других животных в Заире и других странах Центральной Африки. Антитела специфичные к ВОО, были обнаружены у представителей семи видов обезьян и двух видов беток Маренникова и др. Повидимому, обезьяны из Азии в описанных ранее случаях были заражены при совместной перевозке с животными из Африки . После г. Вспышка оспы обезьян у животных в неволе в США в году. В мае года у людей в США были выявлены случаи заболевания оспой обезьян , . Установлено, что большая часть заболевших контактировала с грызунами рода . США в качестве домашних животных. Эти грызуны оказались крайне чувствительными к ВОО. Было установлено, что у дилера, поставляющего животных в зоомагазины, 0 луговых собачек содержались совместно с хлопковыми крысами грызун, широко распространенный в Африке. В США хлопковые крысы были привезены в составе партии из приблизительно 0 мелких грызунов 9 видов, поставленной дилеру в Техасе из Ганы 9 апреля. Затем апреля крысы были проданы в Иллинойс. Именно у этого продавца хлопковые крысы содержались совместно с луговыми собачками. В таблице 2 приведены сведения о грызунах, ввезенных в США в данной партии. Оспа обезьян у лабораторных животных. ВОО. Кроме того, ВОО вызывает заболевание у большинства приматов. При этом патогенность вируса для представителей разных видов существенно различается , i . Клиника и патогенез инфекции у животных. Впервые клинические проявления оспы обезьян были описаны у японского макака М. Дании в г. Первым признаком заболевания была сыпь, которая появлялась в виде отдельных папул на теле, хвосте, морде и конечностях, а также в большом количестве на пальцах и подошвах. Со временем папулы превращались в везикулы, затем везикулы в пустулы. Корки сохранялись 7 дней. На месте пустул впоследствии остались маленькие шрамы. Некоторые различия в течении заболевания наблюдали для представителей различных видов животных во время вспышки в Роттердамском зоопарке i , . Клинические проявления заболевания при экспериментальном его воспроизведении у обезьян мало отличались от, наблюдавшихся при вспышках инфекции в питомниках и зоопарках, однако удалось более подробно изучить клиник , . Эксперименты по заражению проводили в основном на М. Инкубационный период длился от трех до десяти дней. Заболевание начиналось с вялости, потери аппетита и кашля. В течение недели развивалась генерализованная лимфоаденопатия, которая сохранялась до конца третьей недели кожные высыпания в виде макулопапулезной сыпи появлялись на 7 день болезни по всему телу. Особенно обильными они были на ладонях и подошвах. Поражения возникали также на слизистой ротовой полости и глотки. Эволюция сыпи папулы везикулы пустулы корки протекала достаточно быстро. Элементы энантемы исчезали через дня. Инфекция сопровождалась формированием АГА антигемагглютинина и вируснейтратизующих антител. У макак резус заболевание протекало в более мягкой форме инкубационный период был длиннее, период эволюции кожных поражений короче. У других видов приматов наблюдали следующие особенности орангутанги i оказались подвержены ВОО и в цитируемом эпизоде 6 из погибли , у шимпанзе наблюдали сыпь, но генерализации заболевания не происходило у игрунков iix . Таблица 3. Белые мыши 8 дней Интроаназально Вялость, адинамия, потеря веса, дистрофия 0 . Вялость, адинамия, потеря веса 4 . Внутрибрюшинно Вялость, адинамия, потеря веса, дистрофия 0 . Под кожу стопы Отек стопы вялость, адинамия, дистрофия 0 . Под кожу стопы Отек стопы, вялость адинамия . Белые крысы Взрослые Интроназально Нет 0 . Внутривенно Нет 0 . На скарифицированную кожу Нет 0 . Морские свинки Взрослые г.