Структурная организация соматической и ооцитной 5 s pРНК вьюна

• Автор: Серенкова, Тамара Ивановна
• Шифр специальности: 03.00.03
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 1984
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 143 c. : ил

ОГЛАВЛЕНИЕ
ВВЕДЕНИЕ

РОЛЬ ПРОСТРАНСТВЕННОЙ СТРУКТУРЫ В ФУНКЦИОНИРОВАНИИ 5Б рРНК

ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

I. ОБЩАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА СТРУКТУРЫ И ФУНКЦИОНИРОВАНИЯ 5б рРНК

1.1. Множественность 5э рРНК некоторых организмов

1.2. Конформационные изомеры 5Б рРНК.

1.3. Организация генов 5 Б рРНК эукариот

1.4. Транскрипция генов 5БрРНК. II

1.5. Комплексы бБрРНК с белками

1.6. Комплексы с белками ооцитной и соматической рРНК

1.7. Взаимодействие 5БрРНК с большими рибосомными
П. МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ ПРОСТРАНСТВЕННОЙ СТРУКТУРЫ 5Б рРНК
П.. Физические методы исследования пространственной
структуры 5 Б рРНК
П.2. Исследование пространственной структуры бБрРНК
методом химических модификаций
П.З. Ферментативные методы.
П.4. Эволюционный подход к исследованию пространственной структуры бэ рРНК
П.5. Обобщенные модели вторичной структуры 5Б рРНК
Стр.
ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ
. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ.
П. РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЙ.
РАЗДЕЛ I
I. Обнаружение и выделение из половых и соматических клеток вьюна ооцитной и соматической
5 3 рРНК.
П. Определение степени повторяемости генов
5 3 рРНК.
РАЗДЕЛ
Ш. Исследование конформационных изомеров 5Б рРНК
IV. Локализация односпиральных и дву спиральных участков в молекулах соматической и ооцитной
5 Б рЖ.
V. Определение экспонированных цитозиновых остатков
в соматической и ооцитной 5 БрРНК вьюна.
Ш. ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ
1. Сравнение характера расщепления структурноспецифическими нуклеазами соматической и ооцитной бэрРНК вьюна и бэрРНК других организмов
2. Проблема нестабильности вторичной структуры бБрРНК.
3. Модели вторичной структуры соматической и ооцитной
5 Б рРНК вьюна. Ю
4. Некоторые функциональные аспекты структурных различий между соматической и ооцитной бЭрРИК.ПО
У. ВЫВОДЫ.
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ


Эти разные формы 5 б рРНК обладают также разной биологической активностью, т. А форма связывается немного меньше, чем исходная 5б рРНК, Б форма совсем не связывается. Но после ренатурации Б формы она также начинает связываться с рибосомой, но меньше, чем А форма. Дальнейшие исследования показали, что конформационные переходы могут осуществляться за счет изменения не только третичной, но и вторичной структуры, т. рРНК. Грдан и сотр. Мирзабеков и Гриффин 0 сравнивали продукты ограниченного гидролиза РНКазами и панкреатической денатурированной и нативной форм 5 рРНК Е i . Были получены различные места расщеплений у нативной и . При этом происходит перераспределение около 8 пар оснований 0. Исследовали продукты ограниченного гидролиза разных конформеров 5 рРНК печени крысы РНКазами и из яда кобры 5. Места расщеплений этими РНКазами у разных конформеров различаются, но это не приводит к принципиальному изменению схемы спаривания оснований. Предполагается, что конформационные изменения затрагивают нестабильные элементы вторичной структуры. Гены 5 рРНК представлены в геноме эукариот большим количеством копий. У разных видов дрозофилы, например, имеетсяот 0 до 0 копий 1, у X i , X. Такое большое количество 5 генов у разных организмов локализуется в геноме поразному. У некоторых низших эукариот дрожжи и ii ii 5 гены находятся в одном кластере с рибосомными генами, но имеют противоположное направление транскрипции 3. У большинства животных, в том числе у всех высших дрозофила, ксенопус, 5 гены собраны в геноме в отдельные от рДНК кластеры, состоящие из тандемно расположенных повторяющихся единиц. При этом у дрозофилы имеется один общий кластер, состоящий из 0 генов. У ксенолуса 5 гены образуют кластеры, расположенные в проксимальных участках всех хромосом . гены трипаносомы в основном, входят в состав больших повторов рибосомных генов как у дрожжей, а часть активных 5 генов находится в геноме в виде кластера отдельно от других рибосомных генов как у ксенопуса . Для некоторых организмов показано наличие в геноме 5 генов нескольких типов. В клетках куриной печени экспрессируются 5 гены двух типов, транскрипты которых различаются по первичной структуре по положениям . У амфибий , и рыб 1 имеются ооцитные и соматические 5 гены, которые экспрессируются в половых клетках ооциты и соматических тканях соответственно. Форд и Браун показали, что у X. генами составляет . Ооцитные 5 гены ксенолуса, в свою очередь, разделяются на два типа главный или основной и минорный, которые находятся в геноме в разных соотношениях главный составляет , минорный . У x. У X. генов на гаплоидный геном 3. Гибридизацией i i было показано, что соматические и ооцитные 5 гены поразному локализованы в хромосомах соматические расположены на дистальном конце длинного плеча только одной 9ой хромосомы, ооцитные на многих хромосомах, включая и 9ую. В составе кластера повторяющаяся единица гена 5Б рРНК состоит из самого гена и нетранскрибируемых спейсеров разного размера, например, у дрозофилы длина спейсера равна 3 7 н. Х.аеуа от 0 до 0 н. Федорова и Браун , предложили следующую схему организации повторяющейся единицы ооцитного гена Х. Нетранскрибируемый спейсер более чем наполовину состоит из АТ пар. Районы , , относительно постоянны, район Ад гетерогенен по длине за счет того, что он состоит из разного количества копий одного и того же простого повтора длиной нуклеотидов. Помимо нормально экспрессируемых 5 генов в состав повторяющейся единицы входит еще один элемент так называемый псевдоген, который отличается от структурного гена по длине короче на пар оснований и по первичной структуре замен , 9. В минорных ооцитных генах псевдогена не обнаружено. Повторяющаяся единица соматических 5 генов X. X. i содержит от 0 до 0 пар оснований 1, они не имеют псевдогена, их спейсеры гомогенны по длине и не содержат внутренних простых повторов 3.