Специфичность узнавания генов-мишеней транскрипционными факторами семейства NF-kB

• Автор: Британова, Людмила Валерьевна
• Шифр специальности: 03.00.03
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2009
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 87 с. : ил.

Оглавление стр.

Введение.
Обзор литературы. Классический и альтернативный кВ пути роль в иммунитете и факторы, определяющие специфичность действия

1. Структурные особенности ИРкВ и ТкВ белков

2. Функциональная роль белков кВ семейства

3. Сигнальные каскады, ведущие к активации кВ.

3.1. Классический МРкВ путь и его роль во врожденном

иммунитете .

3.2. Стнмулзависимая индукция киназной активности

комплекса 1КК

3.3. Альтернативный кВ путь и его роль в адаптивном

иммунитете.
3.4. Стимулы, акгивирующие альтернативный ЫРкВ путь
4. Специфичность действия факторов КТкВ семейства
4.1. Временной контроль активности кВ.
4.2. Контроль на уровне первичной последовательности сайта
связывания.
4.3. Кофакторы транскрипции.
4.4. Ковалентные посттрансляционные модификации
факторов семейства ЫРкВ
4.5. Структура хроматина как фактор, модулирующий
активность ЫРкВ
Материалы и методы исследования
Клеточные культуры, трансфекция и получение суммарных
лизатов.
Плазмиды
Гсльретардадня.
Люцифсразный тест
Отбор высокоаффинных сайтов связывания из библиотеки случайных последовательностей i i.
Результаты и обсуждение
1. Экспрессия полноразмерных гетсродимерных факторов
и в эукариотических клетках
2. Установление оптимального консенсуса связывания
фактора i vi
2.1. Статистический анализ результатов двух независимых
экспериментов
2.2. Консенсус сайта связывания фактора I по
суммарным данным двух независимых экспериментов
3. Сравнимая аффинность узавания сайтов связывания
фактора комплексами и
4. Отсутствие связывания полноразмерных
гетеродимерных комплексов с опубликованным
сайтом из промотора гена схсПЗ мыши.
5. Потенциальные регуляторные цисэлсменты в промоторе гена хемокина X мишени альтернативного
пути
5.1. Два потенциальных зависимых цисэлсмснта в
промоторе гена хемокина X.
5.2. Распознавание сайта Ь4 транскрипционным фактором .
6. Активность потенциальных регуляторных цисэлемеитов
3 и Ь4 в контексте промотора i viv
Заключение.
Выводы.
Список литературы


Оглавление стр. Введение. Обзор литературы. Сигнальные каскады, ведущие к активации кВ. Временной контроль активности кВ. Кофакторы транскрипции. Гсльретардадня. Отбор высокоаффинных сайтов связывания из библиотеки случайных последовательностей i i. из промотора гена схсПЗ мыши. X. Распознавание сайта Ь4 транскрипционным фактором . Заключение. Выводы. Индуцируемые транскрипционные факторы ответственны за изменение профиля экспрессии генов, приводящее к оптимальному по силе и продолжительности клеточному ответу. Одним из ключевых факторов такого рода является ОТкВ, участвующий в регуляции множества физиологических реакций. Сложная роль факторов РЛРкВ в иммунитете часто описывается в рамках двух сигнальных путей, т. В различного субъедииичного состава и которые активируют различные наборы генов. Классический или канонический сигнальный путь активируется разнообразными рецепторами врожденного и адаптивного иммунитета, включая Топодобные рецепторы, антигенные рецепторы лимфоцитов и рецепторы провоспалительных цитокинов, и ведет к транскрипционной активации и продукции цитокинов, хемокинов, адгезионных молекул и ряда ферментов, участвующих в воспалительных реакциях. Альтернативный ЫРкВ путь, прежде всего, активируется рецепторами, принадлежащими супсрсемейству ТЫРЯ. Лиганды к ряду рецепторов ТОРН семейства способны активировать оба сигнальных каскада, однако именно альтернативный кВ путь в первую очередь отвечает за развитие и поддержание структуры лимфоидных органов и за ответ приобретенного иммунитета. Трудно переоценить важность получения научных знаний в данной области дя медицины, так как система кВ задействована абсолютно во всех процессах, связанных с активацией иммунитета как врожденного, так и приобретенного. Кроме того, ЫРкВ является важнейшим антиапоитотическим фактором клеток млекопитающих, что обуславливает интенсивное изучение системы ЫРкВ в онкологическом контексте. Альтернативный ЫРкВ путь был открыт недавно и еще не изучен подробно, в частности, на данный момент не известно, что определяет специфичность его действия, т. ДНКпоследователыюсгей димерами ЫРкВ разного субъсдиничного состава. Ключевыми исполнительными транскрипционными факторами в классическом и альтернативном сигнальных ЫРкВ каскадах являются гетеродимерные комплексы Кс1АУр и Ке1Вр, соответственно, причем для последнего не описан консенсус сайта связывания. Поэтому актуально определение консенсусной последовательности связывания транскрипционного фактора Ис1Вр и ее сравнение с таковой для комплекса Яе1Лр. Кроме того, генымишени альтернативного ЫРкВ пути выявлены в основном исходя из анализа генетических моделей, и молекулярные аспекты регуляции их транскрипции практически не известны. Следовательно, необходимо изучение структуры регуляторных областей таких генов, в частности, гена хемокина СХСГ, также известного как ВЬС.