+
Действующая цена700 499 руб.
Товаров:
На сумму:

Электронная библиотека диссертаций

Доставка любой диссертации в формате PDF и WORD за 499 руб. на e-mail - 20 мин. 800 000 наименований диссертаций и авторефератов. Все авторефераты диссертаций - БЕСПЛАТНО

Расширенный поиск

Изучение взаимодействия р50-мажорного белка мРНП - с РНК

Изучение взаимодействия р50-мажорного белка мРНП - с РНК
  • Автор:

    Скабкин, Максим Александрович

  • Шифр специальности:

    03.00.03

  • Научная степень:

    Кандидатская

  • Год защиты:

    2003

  • Место защиты:

    Пущино-на-Оке

  • Количество страниц:

    133 с. : ил.

  • Стоимость:

    700 р.

    250 руб.

до окончания действия скидки
00
00
00
00
+
Наш сайт выгодно отличается тем что при покупке, кроме PDF версии Вы в подарок получаете работу преобразованную в WORD - документ и это предоставляет качественно другие возможности при работе с документом
Страницы оглавления работы
"МАЖОРНЫЕ БЕЛКИ ЯДЕРНЫХ И ЦИТОПЛАЗМАТИЧЕСКИХ мРНП I. Гетерогенные ядерные рибонуклеопротендные частицы гяРНП.


ВВЕДЕНИЕ

ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

МАЖОРНЫЕ БЕЛКИ ЯДЕРНЫХ И ЦИТОПЛАЗМАТИЧЕСКИХ мРНП

СТРОЕНИЕ И ФУНКЦИОНИРОВАНИЕ

I. Гетерогенные ядерные рибонуклеопротендные частицы гяРНП.

1. История открытия гяРНП.

2. Белки гяРНП

2.1. Общие характеристики белков гяРНП

2.2. Домены белков гяРНП.

2.2.1. РНКсвязывающий домен .

2.2.2. КНдомен


2.2.3. Вспомогательные домены xii i
2.3. Коровые белки гяРНП.
2.3.1. АВ группа белков гяРНП.
2.3.2. Группа С белков гяРНП.
2.4. Прочие не коровые белки гяРНП.
3. Упаковка гяРНК и структура гяРНП
4. Транспорт мРНК из ядра в цитоплазму.
II Цитоплазматические матричные
рибонуклеопротендные частицы мРНП
1. История открытия цитоплазматических мРНП
2. Основные характеристики мРНП
3. Мажорные белки цитоплазматических мРНП
3.1. ПолиАсвязывающий белок РАВР
3.1.1. Структура РАВР и его связывание с мРНК
3.1.2. Функции РАВР
3.2. Мажорный белок цитоплазматических мРНП р
и его гомологи с доменами холодового шока белки
3.2.1. Обнаружение р и других членов семейства
белков с доменами холодового шока
3.2.2. Строение р
3.2.3. Структура генов р и его гомологов у позвоночных.
3.2.4. Взаимодействие р с РНК
3.2.5. р в биогенезе и функционировании мРНК.
3.2.6. Изменение концентрации р в клетке и ее компартментах
4. Структурная организация цитоплазматических мРНП.
ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ
МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
1. Выделение рекомбинантного р из ii i
2. Получение фрагментов р
3. Выделение плазмидной ДНК из ii i
4. Рестрикция плазмиды.
5. Аналитический электрофорез нуклеиновых кислот в геле агарозы
6. Получение транскриптов РНК i vi.
7. Электрофорез РНК в полиакриламидном геле в присутствии мочевины.
8. Препаративное выделение РНК из полиакриламидного геля.
9. Проведение полимеразной цепной реакции ПЦР
. Мечение ДНК Р по 5 концу
. Электрофорез белков в полиакриламидном геле в присутствии
. Сборка комплексов мРНК с р и их анализ
центрифугированием в градиенте концентрации сахарозы
. Центрифугирование комплексов мРНКс р
в градиенте плотности
. Определение четвертичной структуры р
в комплексе с мРНК методом сшивки глутаровым альдегидом.
. Исследование взаимодействия белка с РНК
методом замедления подвижности РНК в геле i .
. Определение относительных контактов доменов р с мРНК
методом ультрафиолетовых сшивок белка с 2Рмеченной РНК
. Исследование распределения белка р
во фракциях градиента методом
. Отжиг комплементарных цепей
нуклеиновых кислот в присутствии р
. Исследование обмена комплементарных цепей
РНК в присутствии р и его фрагментов
РЕЗУЛЬТАТЫ
1. Исследование комплексов р с мРНК.
1.1. Седиментационная характеристика комплексов р с мРНК
1.2. Плотностное распределение комплексов р с мРНК в градиенте .
1.3. Комплексы р с мРНК нестабильны, и белок
легко переходит с одной молекулы мРНК на другую.
1.4. При низких соотношениях рмРНК белок связывается с мРНК как мономер, в то время как при высоких
соотношениях р образует на мРНК мультимеры
1.5. При низких соотношениях рмРНК белок связывается с мРНК двумя РНКсвязывающими доменами, в то время как при высоких значениях этого соотношения белок взаимодействует с мРНК преимущественно концевой
частью молекулы с доменом холодового шока.
2. Влияние р на вторичную структуру РНК.
2.1. р ускоряет отжиг взаимокомплементарных цепей РНК.
2.2. р ускоряет обмен комплементарных цепей в молекулах
РНК и приводит к образованию наиболее протяженных дуплексов.
2.3. р вызывает плавление или, наоборот, отжиг
РНК в зависимости от соотношения рРНК
2.4. р ускоряет отжиг комплементарных цепей ДНК.
2.5. Фосфорилирование i vi белка р казеинкиназой И снижает
его ДНКотжигающую активность, но не влияет на отжиг РНК
ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ.
1. р основной структурообразующий белок
цитоплазматических мРНП эукариотических клеток.
2. р шаперон нуклеиновых кислот
ВЫВОДЫ.
БЛАГОДАРНОСТИ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ


Обычно белки гяРНП содержат одну или несколько копий так называемого РНКсвязывающего домена ii i, а в некоторых случаях КНдомена К i, обычно располагающихся в концевой части молекулы белка и отвечающих за связывание с РНК. Помимо этих основных доменов в молекулах белков гяРНП могут присутствовать вспомогательные домены. Вспомогательные домены иногда также обладают сродством к РНК, но, прежде всего, они участвуют в белокбелковых взаимодействиях. В качестве вспомогательных доменов в белках гяРНП чаще всего обнаруживается глицинбогатый домен домен . Следует заметить, что подобная модульная структурная организация характерна не только для белков гяРНП, но и вообще для РНКсвязывающих белков , ii , . Таблица 1. А1В2 9. РНК экспорт мРНК биогенез теломер упаковка мРНК i, I . I 8,,8 2х да сплайсинг мРНК локализация мРНК упаковка мРНК i, . I2 5. РНК стабилизация мРНК упаковка мРНК i . РНК рекомбинация биогенез теломер транскрипция ii . Б1Е2 РСВР 7. Зх да стабилизация мРНК трансляция ii . Зх нет данных сплайсинг мРНК i . НН 6. Зх нет данных сплайсинг мРНК полиадснилирование . РНК полиаденилирование трансляция . Зх КН да транскрипция трансляция биогенез теломер ii . РНК стабилизация мРНК i . М 7,,2 Зх 3 нет данных сплайсинг мРНК ответ на тепловой шок i . РНК онкогенез . I2 по 7,4 Зх нет данных сплайсинг мРНК . Зх нет данных обнаруживается при аутоиммуных реакциях . Этот домен обнаружен у нескольких сотен белков, взаимодействующих с РНК. Он состоит из 0 аминокислотных остатков а. Характерной чертой , по которой его легко выявляют в различных белках, является присутствие двух консенсусных последовательностей из 8 и 6 аминокислотных остатков, названных РНП1 VX и РНП2 V, соответственно . Как можно видеть, эти консенсусные последовательности богаты ароматическими аминокислотами. Наличие в какомлибо белке этих двух мотивов или хотя бы консенсуса РНП1 позволяет с большой вероятностью утверждать, что белок содержит и может связываться с РНК . Пространственная структура была определена методом рентгеноструктурного анализа РСА i . ЯМР . Зтяжи примыкают друг к другу и располагаются в центре листа. Исследование комплексов с РНК методом ЯМР . РСА i . РНПконсенсусах, в неспецифическом связывании с РНК. Боковые группы этих остатков вступают в стэкинг взаимодействие с основаниями РНК, а кроме того, некоторые аминокислотные остатки консенсусной последовательности образуют с РНК водородные связи. Помимо аминокислотных остатков, находящихся в тяжах, во взаимодействии с РНК активно участвуют также остатки, расположенные в петлях, соединяющих отдельные тяжи, и прежде всего, в 3ей петле между 2 и рЗтяжами , , , а также остатки на Сконце , . Предполагается, что именно эти участки сообщают доменам у различных белков специфичность по отношению к РНК i Vi, . Аминокислотные остатки, участвующие во взаимодействии с РНК, образуют достаточно плоскую поверхность, связавшись с которой, РНК остается легко доступной для взаимодействия с другими РНК и белками. Это особенно важно для мультикомпонентных комплексов, участвующих в процессинге гяРНК , ii , . За последние несколько лет появились интересные данные, свидетельствующие о значительных конформационных перестройках как в РНК, так и в некоторых участках , при их взаимодействии, а также в участках белка, расположенных за пределами i Vi, , . При связывании с РНК белков с несколькими копиями , происходит существенное изменение конформации промежуточных участков белка, соединяющих . Например, достаточно неструктурированный линкер, соединяющий два в нуклеолине белке, участвующем в процессинге рибосомальной РНК или в x белке, участвующем в сплайсинге гяРНК, при связывании с соответствующей РНК переходит в упорядоченную спиральную конформацию . Подобные переходы из свободной, подвижной конформации в жесткую, упорядоченную при связывании с РНК также наблюдаются в петлях, соединяющих различные тяжи в i . Путем изменения структуры линкерного участка отдельные могут влиять друг на друга и принимать согласованную конформацию, необходимую для эффективного функционирования.

Рекомендуемые диссертации данного раздела

Название работыАвторДата защиты
Функциональные свойства белков, кодируемых ретротранспозоном L1 генома человека Пискарева, Ольга Александровна 2004
Изучение молекулярной эволюции ортопоксвирусов Бабкин, Игорь Викторович 2008
Изучение транскрипционного фактора TRF2 у Drosophila melanogaster Копытова, Дарья Владимировна 2005
Время генерации: 0.832, запросов: 966