Анализ транскрипции суффикса-короткого ретроэлемента из генома D. Melanogaster

• Автор: Кретова, Ольга Валерьевна
• Шифр специальности: 03.00.03
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2006
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 82 с. : ил.

1. ОБЩАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА РАБОТЫ

1.1. Актуальность проблемы

1.2. Задачи исследования

1.3. Научная новизна результатов исследования

1.4. Практическая ценность

1.5. Апробация работы

2. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

ВВЕДЕНИЕ


ГЛАВА I. ГЛАВА II. Места интеграции в геноме ГЛАВА III. Штаммы . ПААГэлектрофорез и электроблоттинг для анализа i 3. Существует две точки зрения на роль мобильных элементов в геномах эукариот. Одна из них предполагает, что они являются геномными паразитами и клетка вынуждена защищаться от них и их нежелательной экспрессии. Согласно другой, мобильные элементы привносят в геном повторяющиеся последовательности, необходимые для образования гетерохроматиновых областей, а также различные регуляторные последовательности, находящиеся в их составе, такие как промоторы, инсуляторы и другие, которые клетка использует для регуляции своих генов. Обе точки зрения подкреплены фактами. С одной стороны, накопление мобильных элементов может причинить вред хозяйской клетке, а с другой стороны они могут использоваться клеткой для регуляции работы генов и служить материалом и фактором эволюции. В геноме дрозофилы обнаружено более десяти семейств I и только один короткий ретроэлемент I суффикс. Поэтому исследование свойств суффикса, в частности, его транскрипции и возможного происхождения, представляет большой интерес. Ранее по поводу происхождения коротких ретроэлементов в разных геномах было высказано два предположения. Согласно первому из них, ДНКинтермедиаты обратной транскрипции содержащих ретроэлементов, использующих в качестве праймера тРНК, были внедрены в 3 концевые области I i . Вторая гипотеза, подкрепленная некоторыми экспериментальными данными, предполагает, что при обратной трапскрипции РНК I обратная транскриптаза перепрыгивает на тРНК или на 5 РНК матрицы i , . Но полной ясности в этом вопросе пока нет. Транскрипция мобильных элементов часто осуществляется в двух противоположных направлениях или изза присутствия внутренних смысловых и антисмысловых промоторов, как в случае с элементом iii i , , или в результате инсерции мобильного элемента в различных ориентациях так, что его транскрипция попадает под контроль какогото внешнего промотора. Тем самым появляется возможность образования дсРНК и, следовательно, запуска РНКинтерференции. Сама РНКинтерференция, регулирующая экспрессию многих генов, тоже может регулироваться, что впервые обнаружено в ходе настоящей работы. Недавно обнаружено, что паттерн экспрессии i меняется как в развитии, так и во время физиологических процессов Не , . Это согласуется с нашими данными о регуляции РНКинтерференции.