Роль протеализина в бактериальной инвазии

• Автор: Цаплина, Ольга Анатольевна
• Шифр специальности: 03.03.04
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2011
• Место защиты: Санкт-Петербург
• Количество страниц: 132 с. : ил.

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

Белки и структуры бактерий:

ActA - поверхностный белок-эффектор Listeria monocytogene, активирующий комплекс Агр2/3
ЕСР32/гримелизин - актип-специфическая протеаза Serratia grimesii с молекулярной массой 32 кДа

EspC - сериновая протеаза энтеропатогенных E. coli (ЕРЕС)

EspH, G - белки эффекторы ЕРЕС, управляющие структурой актинового цитоскелета для образования пьедестала
IcsA (VirG) - поверхностный белок Shigella flexner, ответственный за полимеризацию актина при внутриклеточном движении бактерии IcsP - сериновая протеаза, контролирующая распределение поверхностного белка Sh. flexneri IcsA
InlA, В - группа белков интерналинов L. monocytogenes, отвечающая за связывание с Е-кадгерином человека

1ра - группа белков эффекторов Sh. flexneri (invasion plasmid antigens),

образующая аппарат секреции

Ipg - группа белков эффекторов Sh. flexneri

LRR - домены белков, богатые лейцином (leucine-rich repeats)
PagN - поверхностный белок бактерий Salmonella enterica, отвечающий за адгезию бактерий
Pet - сериновая протеаза энтероаггрегативных E. coli (EAEC)
Shi А — гемолизин, токсин Serratia marcescens
ShlB — белок S. marcescens, необходимый для секреции ShlA и его активации Sip - группа белков эффекторов Salmonella (,Salmonella invasion proteins)
Sop - группа белков эффекторов Salmonella {Salmonella outer proteins)
SopA - старое название белка IcsP Sh. flexneri
SopE /Е2 -белки эффекторы Salmonella, имитирующие GEF и активирующие Rho-ГТФазы
Spa — группа белков Sh. flexneri, составляющих T3SS

SptP -белок эффектор Salmonella
SpvB - АДФ-рибозилтрансфераза Salmonella
Tir - транслоцируемый в клетки эукариот рецептор интимина ЕРЕС TT3S — аппарат секреции типа III (type three secretion system)
VirA -цистеиновая протсаза Sh. flexneri, отвечающая за разборку микротрубочек YadA -белок эффетор Yersinia, отвечающий за бактериальную адгезию YopE — белок эффектор Yersinia, нарушающий структуру актинового цитоскелета в клетке-хозяине Белки клеток эукариот:
ММП - матриксные металлопротеазы АР-1 - ядерный фактор транскрипции
Агр 2/3 — белковый комплекс, инициирующий нуклеацию актина (actin-related proteins)
с/EBP р -фактор транскрипции
CD44 - рецептором гиалуроновой кислоты
Cdc42 - ГТФаза Rho семейства
FAK - киназа фокальной адгезии, актин-связывающий белок F-актин - фибриллярный акгин
GAP — фактор, ускоряющий гидролиз ГТФ в малых ГТФазах (GTPase-activating protein)
GEF - фактор, ускоряющий диссоциацию ГДФ из комплекса ГДФ-ГТФаза, что стимулирует связывание Г'ГФ (guanine nucleotide exchange factors)
G-актин - глобулярный актин
МАРК - (mitogen-acivated protein kinase) митоген активируемая протеинкиназа NF-кр - универсальный фактор транскрипции, контролирующий экспрессию генов иммунного ответа, апоптоза и клеточного цикла (nuclear factor kappa-light-chain-enhancer of activated В cells)
N-WASP - актин-связывающий белок, принадлежащий семейству WASP (Neural Wiskott-Aldrich syndrome protein)
PAR-2 - активируемый протеазами рецептор воспалительного ответа

PI3 киназа - фосфатидилинозитол-3-киназа
PIP - фосфатидилинозитол-5-фосфат
PIP2 - фосфатидилинозитол-4 ,5-бифосфат
Рук2 - тирозин киназа
Rac — ГТФаза семейства Rho
Rho - семейство ГТФаз
Src — тирозин-киназа
WASP - большое семейство актин-связывающих белков (Wiskott-Aldrich syndrome protein)
WAVE — белок семейства WASP Среды и реактивы:
DMEM (Dulbecco s modified Eagle s niedium) - минимальная среда для монослойного культивирования клеток различного типа DTT - дитиотриетол (dithiothreitol)
FITC - флуоресцентный краситель (fluorescein isothiocyanate)
LB - питательная среда для бактерий (Luria broth)
PVDF-мембрана - мембрана, используемая для переноса белков (polyvinylidenc fluoride)
SDS - додецил сульфат натрия (sodium dodecyl sulfate)

активирует транскрипцию факторов АР-1, C/EBPß, and NF-кВ (Kida et al., 2007). Является ли серализин фактором патогенности, неизвестно.
Наиболее хорошо изученным фактором патогенности является гемолизин, который вызывает гемолиз эритроцитов человека и животных (Schiebel, Braun, 1987), высвобождение медиаторов воспаления гистамина и лейкотриенов из лейкоцитов (König et al., 1987). Гемолитическая активность S. marcescens определяется двумя белками, shlA и shlB. Оба белка синтезируются с сигнальными пептидами, которые отщепляются в процессе созревания. Гемолизин после секреции из S. marcescens остается связанным с бактериальной клеткой, в отличие от большинства бактериальных гемолизинов, которые секретируются во внеклеточную среду и распространяются независимо от клеток (König et al., 1987). Цитотоксичность S. marcescens проявляется только при условии тесного контакта патогенных бактерий с клеткой-хозяином. Производство гемолизина в ряде бактерий, в том числе и S. marcescens, связано с метаболизмом железа в бактериальной клетке, поэтому предполагают, что основной его функцией является высвобождение гемо-железа из эритроцитов (Poole et al., 1988).
ShlA является собственно гемолизином, a ShlB — белок, необходимый для секреции ShlA в культуральную среду. ShlA синтезируется в неактивной форме и, в отсутствие ShlB, остается в периплазме. При этом ShlB участвует не только в секреции ShlA через внешнюю мембрану, но и в активации. Под действием ShlB, расположенным в бактериальной мембране, происходит необратимая модификация N-концевого участка ShlA. Модификация может происходить в результате действия самого ShlB или ассоциированных с ним белков. После модификации N-концевой участок ShlA приобретает способность встраиваться в гидрофобную мембрану эритроцитов, образуя пору. Затем начинается сворачивание С-концевой части ShlA в мембране эритроцита. При образовании норы ShlA глубоко встраивается в мембрану эритроцита и становится недоступным для расщепления протеазами. ShlA имеет сильную тенденцию к