Мутационная изменчивость гена TP53 при раке молочной железы

• Автор: Денисов, Евгений Владимирович
• Шифр специальности: 03.02.07
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2010
• Место защиты: Томск
• Количество страниц: 134 с. : ил.

Содержание

Список сокращений

Введение

1 ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1 Основные этапы в изучении гена ТР53 (белка р53)

1.2 Ген ТР53, структура

1.3 Белок р

1.3.1 Структура белка р

1.3.2 Регуляция транскрипционной активности р

1.3.3 Функциональные аспекты белка р

1.3.3.1 Участие белка р53 в контроле клеточного цикла, репарации ДНК и апоптоза

1.3.3.2 Участие белка р53 в регуляции процессов аутофагии, антиоксидантной защиты и метаболизма
1.4 Вариации и нарушения в структуре гена ТР53: связь с формированием и развитием рака молочной железы
1.4.1 Полиморфизм Ех4+119С>С
1.4.2 Полиморфизм 1У83+41тз16Ьр и 1УБ6+62С>А
1.4.3 Аллельный дисбаланс в гене ТР
1.4.4 Соматические мутации в гене ТР
1.4.5 Метилирование гена ТР
2 МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ
2.1 Материалы исследования...!
2.2 Методы исследования
2.2.1 Выделение ДНК
2.2.2 Полимеразная цепная реакция
2.2.3 БИР-анализ
2.2.4 Мини- и микросателлитный анализ
2.2.5 Метил-специфическая ПЦР
2.2.6 Секвенирование
2.2.7 Статистическая обработка данных
3 РЕЗУЛЬТАТЫ И ИХ ОБСУЖДЕНИЕ
3.1 Характеристика полиморфизма гена ТР
(Ех4+119С>С, 1У86+62(3>А и 1У83+41тз16Ьр) у больных раком молочной железы
3.2 Изучение потери гетерозиготности у больных РМЖ, носителей
гетерозиготного генотипа гена ТР53 (Ех4+1190>С и
1У83+41шз16Ьр) с утратой аллелей в опухоли
3.3 Изучение метилирования гена ТР53 у гетерозиготных больных
раком молочной железы с потерей одного и сохранением
другого аллелей в опухолевой ткани
3.4 Изучение соматических мутаций гена ТР53 у гетерозиготных больных раком молочной железы с потерей одного и сохранением другого аллелей в опухолевой ткани
3.5 Двухударная модель инактивации гена ТР53 при раке молочной железы
3.6 Полиморфизм, мутации в гене ТР53 и клиническое течение рака молочной железы
3.6.1 Ех4+119С>С полиморфизм гена ТР53 и характер опухолевого роста рака молочной железы
3.6.2 Ех4+119в>С полиморфизм гена ТР53 и лимфогенное метастазирование рака молочной железы
3.6.3 Мутации в полиморфных сайтах гена ТР53 и экспрессия рецепторов к половым гормонам при раке молочной железы..
3.6.4 Соматические мутации в гене ТР53 и патогенетические характеристики опухолевого процесса
3.6.5 Мутации в гене ТР53 и наследственная отягощенность по раку молочной железы
Заключение
Выводы
Список работ, опубликованных по теме диссертации
Список литературы

Список сокращений
РМЖ — рак молочной железы
AI (от англ. allelic imbalance) - аллельный дисбаланс Ьр (от англ. base pair) - пара нуклеотидов Ех (от англ. exon) - экзон
Ех4+119G>C - замена гуанина на цитозин в 119-м нуклеотиде 4-го экзона INDEL (от англ. insertion-deletion) - вставка или делеция (в последовательности ДНК)
IVS (от англ. intervening sequence) — встроенная последовательность IVS3+41insl6bp - инсерция 16 пар нуклеотидов после 41-го нуклеотида 3-го интрона
IVS6+62G>A - замена гуанина на аденин в 62-м нуклеотиде 6-го интрона LOH (от англ. loss of heterozygosity) - потеря гетерозиготности TNM (от англ. tumor-nodus-metastasis) - классификация злокачественных опухолей, основанная на размере опухоли (tumor), степени поражения лимфатических узлов (nodus) и наличии либо отсутствии отдаленных метастазов (metastasis)
ТР53 (от англ. tumor protein 53) - ген, кодирующий белок с молекулярной массой 53кДа
VNTR (от англ. variable number tandem repeat) - вариабельное число тандемных повторов.

дством ЧердынцевойН.В: больные РМЖ с генотипом G/G характеризовались высокой злокачественностью опухоли и плохим прогнозом, тогда как носители генотипа G/C имели более, благоприятное течение заболевания (Чер-дынцева и др., 2006). Кроме того, в литературе присутствуют данные об отсутствии какой-либо ассоциации Ex4+119G>C полиморфизма с конкретными проявлениями опухолевой прогрессии (Damin et al., 2006; Hrstka et al., 2009). Противоречивость данных, вероятно, обусловленная недоучетом соматического статуса гена ТР53 в опухоли, требует дальнейшего изучения. Так, ранее была показана утрата Ех4+119G>C аллелей гена ТР53 в опухоли молочной железы.(Bonafe et al., 2003; Kyndi et al., 2006). Однако авторами получены совершенно противоречивые данные: потеря аллеля С и. сохранение аллеля G в одной работе (Bonafe et all, 2003) и преимущественная у трата аллеля G и сохранение аллеля С в другой (Kyndi et al., 2006). Механизмы наблюдаемого в: настоящее время охарактеризованы плохо. Более того, было показано, что больные РМЖ с потерей определенных аллелей по Ех4+119G>C полиморфизму гена ТР53 характеризуются плохой выживаемостью (Bonafe et al., 2003; Kyndi et al., 2006).
1.4.2 Полиморфизм IVS3+41insl6bp и IVS6+62G>A Одними из наиболее изученных полиморфных вариантов в некодирующей области является; инсерция/делеция 16 п.н. в 3-м интроне (IVS3+41insl 6bp, INDEL rs17878362) и точечная замена гуанина на аденин в . 6-м интроне (1VS6+62G>A, rsl625895). Полиморфизм в 3-м интроне, представляющий собой повтор из 16 п.н. (инсерция), впервые был идентифицирован в 1993 году группой: французских исследователей (Lazar et al., 1993). Как было установлено позже, наличие в белке р53 минорного аллеля, йнсерции 16 п.н., приводит к понижению уровня мРНК, уменьшению интенсивности апоптоза и репарации ДНК (Wu et al., 2002; Gemignani et al., 2004). Значимая роль данного полиморфизма была показана в развитии многих онкологических заболеваний (Wu et al., 2002; Gemignani et al., 2004; Chen et al., 2007;