Генетическая структура и молекулярная филогеография народов Кавказа

• Автор: Кутуев, Ильдус Альбертович
• Шифр специальности: 03.02.07
• Научная степень: Докторская
• Год защиты: 2010
• Место защиты: Уфа
• Количество страниц: 305 с. : ил.

СОДЕРЖАНИЕ
Введение

Г лава 1. Обзор литературы

1.1. Митохондриальная ДНК

1.1.1. Особенности структуры и наследования мтДНК

1.1.2. Скорость накопления мутаций в мтДНК

1.1.3. Филогенетический анализ мтДНК и медианные сети

1.1.4. Изучение ранней эволюции человека

1.1.5. Заселение Евразии по данным мтДНК

1.1.6. Филогения и номенклатура мтДНК

1.2. У-хромосома

1.2.1 У-хромосома как объект генетического изучения
1.2.2. Особенности структуры У-хромосомы
1.2.3. Применение У-хромосомы в популяционно-генетических исследованиях
1.2.4. Маркеры У-хромосомы
1.2.5. Изучение истории человечества с использованием У-хромосомы
1.2.6. Классификация гаплогрупп У-хромосомы
1.3. Полиморфизм аутосомных А1и-инсерций
1.4. Этническая история Кавказа
1.4.1. Заселение Кавказа по данным археологии и антропологии
1.4.2. Этногенез народов Кавказа
1.4.3. Популяционно-генетические исследования народов Кавказа
Глава 2. Материалы и методы

2.1. Материалы исследования
2.2. Методы исследования
2.2.1. Выделение геномной ДНК
2.2.2. Анализ митохондриальной ДНК
2.2.3. Анализ Y хромосомы
2.2.4. Генотипирование Alu-инсерций
2.2.5. Статистические методы
Глава 3. Результаты исследований
3.1. Полиморфизм мтДНК в популяциях Кавказа
3.1.1. Структура и разнообразие митохондриальных генофондов популяций Кавказа
3.1.2. Филогеография западноевразийских гаплогрупп мтДНК
3.1.4. Филогеография восточноевразийских и африканских гаплогрупп мтДНК
3.1.5. Генетические взаимоотношения между популяциями Кавказа
3.1.6. Генетические взаимоотношения между популяциями Кавказа и популяциями соседних регионов
3.2. Полиморфизм Y хромосомы в популяциях Кавказа
3.2.1. Анализ гаплогрупп Y хромосомы в популяциях Кавказа
3.2.2. Филогеография гаплогруппы J
3.2.3. Филогеография гаплогруппы G
3.2.4. Филогеография гаплогруппы R
3.2.5. Филогеография гаплогруппы
3.2.6. Филогеография гаплогруппы Е
3.2.7. Филогеография гаплогруппы L
3.2.8. Филогеография восточноевразийских гаплогрупп

3.2.9. Генетические взаимоотношения между популяциями Кавказа
3.2.10. Генетические взаимоотношения популяций Кавказа и популяций
соседних регионов
3.3. Полиморфизм Alu инсерций в популяциях Кавказа
Заключение
Выводы
Список литературы

представлен он- в целом с достаточно низкими частотами- [ТоггопнеСаК, 2001; АсЫНЕеС а1., 2007;. ВеЬаг е£ аГ., 2008а]. Из этого можно; заключить, что носители:предковых по отношению.к гаплогруппе V хромосом;продвигались-вдоль.Средиземноморья*в направлении:восток-запад с территории Передней; Азии на' Иберийский; полуостров: Не исключено; что- вместе с ними в миграции принимали: участие носители предковых вариантов; современных гаплогрупп, распространившихся* из Франко-Кантабрийской рефугии. Что касается: Кавказа, вопрос о том, играл ли данный регион* роль коридора при-распространении переднеазиатских:. гаплогрупп: наг север, либо
специфические особенности рельефа-, служили скорее: препятствием, будет рассмотрен в, настоящем исследовании.. Так или иначе, типичные переднеазиатские гаплогруппы мтДНК встречаются в Европе: обычно в следовых количествах [АЬи-Атего*е1 а]., 2008; Ма1уагсЬик. е1 а1., 2008Ь].
Другой распространенной в Западной Евразии;ветвью>■ макрогруппы Ш является и. В отличие от Н, филогеография отдельных субклейдов-данной; гаплогруппы была, относительно хорошо; разработана на момент изучения: популяций различных регионов мира. Выше уже было отмечено, что гаплогруппа Ша-характерна: для> Западной .Европы, а ветвь-Ш, несмотря на различия в распространении отдельных субклейдов;, имеет южноазиатское происхождение. Скорее всего; для:всего кластера П, исходя.из паттернов его распространения, можно-предполагать переднеазиатское происхождение. За исключением клейдов и5 и 178 (а также гаплогруппы К, являющейся ветвью 138), остальные ветви демонстрируют преимующественно передне- и южноазиатское распространение; Кроме того, для данных регионов характерно наибольшее разнообразие; и время коалесценции применимо к данным гагоюгруппам. Так, гаплогруппа ДЛ и ее субклейды Ша и ШЬ имеют наибольшее распространение на Среднем Востоке и Кавказе [ТатЬе1э е1 а1., 2000; (^ш^апа-Мига Щ а1., 2004], в то время как в Восточной Европе они практически не встречаются [Ма1уагсЬик Щ а1., 2002; АсЫШ е! а!., 2007;