Механизмы клеточной устойчивости к ингибитору трансляции микроцину С и родственным соединениям

• Автор: Тихонов, Антон Алексеевич
• Шифр специальности: 03.01.03
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2012
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 94 с. : ил.

Оглавление

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ:

ОБЩАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА РАБОТЫ

АКТУАЛЬНОСТЬ РАБОТЫ

Цели и задачи

НОВИЗНА И НАУЧНАЯ ЗНАЧИМОСТЬ РАБОТЫ

Публикации и апробация работы

ЛИТЕРАТУРНЫЙ ОБЗОР

Введение

Аминоацил-тРИК-синтетазы

УзнаваниетРНК

Специфичность реакции аминоацилирования и механизмы редактирования 13 Трансамидирование при синтезе глутаминил- и аспарагинил-тРНК
Альтернативные функции ARS
Природные ингибиторы ARS
Мупироцин
Перспективные природные антибиотики—ингибиторы ARS
Другие природные игнибиторы ARS
Антибактериальные агенты, полученные в результате химической модификации природных ингибиторов ARS
Икофунгипен — аналог циспентацина
Ингибиторы ARS, полученные в результате скрининга химических веществ 27 AN-2690
REP8839
фенилтиокарбамид-сульфонамиды
Природные ингибиторы — аналоги аминоацил-аденилатов
Аскамицин
Фосмидозин
Альбомицин
АГРОЦИН
микроцин с
Синтез микроцин а с
Проникновение микроцина С в чувствительные клетки
Механизм действия микроцина с
Механизмы устойчивости к микроцину С
Регуляция микроциновых генов
Г омологи микроциновых оперонов
Синтетические ингибиторы — аналоги аминоацил-аденилатов
Синтетические аналоги микроцина С
МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
РЕЗУЛЬТАТЫ РАБОТЫ

Продукция MccF обеспечивает устойчивость клеток к микроцину С
MCCF ВОССТАНАВЛИВАЕТ АКТИВНОСТЬ ASPRS В БЕСКЛЕТОЧНЫХ ЭКСТРАКТАХ
ОБРАБОТАННЫХ МИКРОЦИНОМ
MCCF ЯВЛЯЕТСЯ СЕРИНОВОЙ ПЕПТИДАЗОЙ
MCCF ГИДРОЛИЗУЕТ АМИДНУЮ СВЯЗЬ МЕЖДУ ПЕПТИДНОЙ И
НУКЛЕОТИДНОЙ ЧАСТЯМИ МСС
Инкубация MccF с DSA и ESA приводит к образованию
ВЫСОКОТОКСИЧНОГО СУЛЬФАМОИЛ-АДЕНОЗИНА
LDCA НЕ СПОСОБЕН ИНАКТИВИРОВАТЬ МИКРОЦИН С и
АМИНОАЦИЛ-СУЛЬФАМОИЛ-АДЕНОЗИНЫ
Общая структура MccF
Каталитическая петля определяет специфичность MccF
К АДЕНИЛИРОВАННЫМ СУБСТРАТАМ
Структурно-функциональные исследования MccF
Изменение субстратной специфичности MccF
с помощью направленного мутагенеза
Филогенетический анализ S66 семейства сериновых пептидаз
Структура гомолога MccF из В. anthracis
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
ВЫВОДЫ
ПУБЛИКАЦИИ В ЖУРНАЛАХ:
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ:

Список сокращений:
АТФ - аденозин-трифосфорная кислота
АМФ - аденозинмонофосфорная кислота
ДНК - дезоксирибонуклеиновая кислота
тРНК - транспортная рибонуклеиновая кислота
мРНК - матричная рибонуклеиновая кислота
1РТС - изопропилтиогалактоза
РМ8Р - фенилметилсульфомилфлюорид
ПЦР - полимеразная цепная реакция
ТФУ - трифторуксусная кислота
ТХУ - трихлорускусная кислота
Кл - константа ингибирования
Кб - константа связывания
Кт - константа михаэлиса
Кса1 - константа скорости реакции
Кда - килодальтон
ИК50 - концентрация полумаксимального ингибирования МИК - минимальная концентрация, подавляющая рост клеток МИК50 - минимальная концентрация, подавляющая рост 50% клеток МИК90 - минимальная концентрация, подавляющая рост 90% клеток

тссА
тсс промотер

тссР І г
сс _]
Рис. 10. (А) Химические структуры зрелой и процессированной формы МсС, аспартил-АМФ,
ПуНСГОХАХ-ЯА, аа8А, СВ-432. В структурах ІХІВТОКАХ-ЗА и аа5А Я — боковая цепь аминокислоты. (Б) Схема строения кластера микроциновых генов. Черными стрелками обозначены промотеры; шпилька обозначает предполагаемый сигнал терминации транскрипции.