Изучение внутриклеточного транспорта белков вирусов растений, кодируемых тройным блоком генов гордеи- и помовирусов

• Автор: Шемякина, Елена Андреевна
• Шифр специальности: 03.01.03
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2011
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 155 с. : ил.

ОГЛАВЛЕНИЕ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

ВВЕДЕНИЕ

ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

Цитоскелет и мембранные структуры клеток растений

Цитоскелет растений

Микрофиламенты

Микротрубочки

Мембранные структуры клеток растений

Эндоплазматический ретикулум

Аппарат Гольджи

Динамика ЭПР и АГ
СОР II-зависимый транспорт
СОР 1-зависимый транспорт
Плазмодесмы
Роль цитоскелета и мембранных структур клетки в транспорте вирусов
растений
Транспортные белки вирусов растений
Роль цитоскелета в транспорте вирусов растений
Роль клеточных мембранных структур в транспорте вирусов растений
МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ
Взаимодействие белка ТБГ1 ВСВК с МТ
Локализация белка ТБГ1 ВСВК в присутствии белков ТБГ2 и ТБГЗ
Белок ТБГ1 доставляется белками ТБГ2 и ТБГЗ в ПД

Снижение уровня экспрессии тубулина не блокирует внутриклеточный
транспорт белка ТБГ1 ВСВК
Обработка клеток колхицином ингибирует доставку белка ТБГ1 к ПД и
образование агресом
Анализ мутантов белка ТБГ1 подтверждает взаимосвязь между ассоциацией
белка с МТ и его транспортом в ПД
Обнаружение высокомолекулярных комплексов, образуемых белком ТБГЗ
ПЛВМ, в инфицированных растениях
Мутация в центральном консервативном домене белка ТБГЗ ПЛВМ препятствует образованию высокомолекулярных комплексов и блокирует его
транспорт в периферические мембранные тельца
Включение белка ТБГЗ в состав высокомолекулярных комплексов
необходимо для его СОРИ-независимого внутриклеточного транспорта
ВЫВОДЫ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ
Названия вирусов

QBC - Q-вирус свеклы (Beet virus Q)
ВАБСВ - вирус, ассоциированный с бороздчатостью стебля винограда (Grapevine rupestris stem pitting-associated virus)
ВГТ - вирус гравировки табака (Tobacco etch virus)
ВЖС - вирус желтухи свеклы (Beet yellows virus)
BKA — вирус карликовости арахиса (Peanut stunt virus)
BKB — вирус короткоузлия винограда (Grapevine fanleaf virus)
ВКГ - вирус крапчатости гвоздики (Carnation mottle carmovirus)
BKKT - вирус кустистой карликовости томатов (Tomato bushy stunt virus)
ВКПД — вирус кольцевой пятнистости гвоздики (Carnation ringspot virus)
BKT — вирус крапчатости табака (Tobacco mottle virus)
ВМБ — вирус мозаики бамбука (Bamboo mosaic virus)
BMB - вирус мозаики вигны (Cowpea mosaic virus)
BMK - вирус мозаики костра (Brome mosaic virus)
BMJI - вирус мозаики люцерны (Alfalfa mosaic virus)
BMMP - вирус мозаики масличного рапса (Oilseed rape mosaic vims)
BMO - вирус мозаики огурца (Cucumber mosaic vims)
BMoT - вирус морщинистости турнепса (Turnip crinkle vims)
BMT - вирус мозаики турнепса (Turnip mosaic vims)
ВМЦК - вирус мозаики цветной капусты (Cauliflower mosaic virus)
ВНКБ - вирус некроза кормовых бобов (Broad bean necrosis vims)
ВНКПС - вирус некротической кольцевой пятнистости сливы (Prunus necrotic ringspot virus)
BHMKK - вирус некротической мозаики красного клевера (Red clover necrotic mosaic vims)
ВНПД — вирус некротических пятен дыни (Melon necrotic spot carmovirus)
ВНПЖС - вирус некротического пожелтения жилок свеклы (Beet necrotic yellow vein vims)
ВОЖТ - вирус осветления жилок турнепса (Turnip vein clearing vims)
BPA - вирус розеточности арахиса (Groundnut rosette vims)
BCBK - вирус скручивания верхушек картофеля (Potato mop-top vims)

Показано, что почти все белки SNARE A. thalianci экспрессируются во всех тканях. Кроме того, большинство белков SNARE локализуются на разных мембранах специфически: 6 в мембранах ЭПР, 4 — в мембранах транс-Гольджи, 2 в эндосомных мембранах, 17 в плазматической мембране, 7 в превакуолярнных и вакуольных мембранах, 2 в мембранах ТГС, превакуолярного компартмента и вакуолей и 1 в мембранах ТГС, превакуолярного компартмента и плазматической мембране. Только несколько белков SNARE были обнаружены локализующимися в нескольких типах мембран, т.е., возможно, перемещающимися между органеллами (Uemura et al., 2004). Тем не менее, неясно, что именно определяет локализацию белков SNARE в той или иной мембране. Для мембранных белков типа I показано, что их заякоривание на той или иной мембране может зависеть от длины их трансмембранного домена (Brandizzi et al., 2002). Действительно, белки SNARE дрожжей, имеющих в трансмембранном домене по 15 аминокислотных остатков, локализуются в мембранах АГ, в то время как имеющие по 19-20 — в ЭПР. Однако белки SNARE A thaliana AtSec22 и AtSYP31 имеют по 17 аминокислотных остатков в трансмембранном домене, но разную локализацию: в ЭПР и АГ соответственно (Uemura et al., 2004, Moreau et al., 2007).
Регулятором процесса узнавания мембран-мишеней везикулой являются малые клеточные ГТФазы семейства Rab. Эти белки взаимодействуют с комплексом белков, обеспечивающих первичное прикрепление везикул к мембранам-мишеням, что делает возиожным последующее взаимодействие между белками SNARE. Все ГТФазы семейства Rab имеют четкую локализацию, и их функционирование регулируется на нескольких уровнях (van Vliet et al., 2003). Эффекторы Rab разнообразны и включают различные привязывающие факторы (tethering factors), ферменты метаболизма фосфатидил-инозитола, миозины, кинезины и регуляторы сборки SNARE. Встраивание белков Rab в мембрану опосредовано двумя пренильными группами, посттрансляционно связывающимися с двумя С-концевыми цистеинами. Предварительно белки Rab