Доставка любой диссертации в формате PDF и WORD за 499 руб. на e-mail - 20 мин. 800 000 наименований диссертаций и авторефератов. Все авторефераты диссертаций - БЕСПЛАТНО
Сулацкая, Анна Игоревна
03.01.03
Кандидатская
2013
Санкт-Петербург
109 с. : ил.
Стоимость:
499 руб.
СОДЕРЖАНИЕ
ВВЕДЕНИЕ
Актуальность исследования
Цели и задачи исследования
Основные положения, выносимые на защиту
Научная новизна исследований
Теоретическое и практическое значение работы
ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
1.1. Современные представления о фолдинге белков. Амилоидные
фибриллы
1.1.1. Фолдинг белков
1.1.2. Возможные пути возникновения белковых агрегатов
1.1.3. Амилоидные фибриллы in vivo
1.1.4. Амилоидные фибриллы in vitro
1.1.5. Структурный полиморфизм амилоидных фибрилл
1.2. Флуоресцентный зонд тиофлавин Т - структура, фотофизические
свойства, взаимодействие с амилоидными фибриллами
1.2.1.Строение молекулы тиофлавина Т. Результаты квантовохимических расчетов молекулы красителя в основном и возбужденном состояниях
1.2.2. Спектральные свойства тиофлавниа Т в растворителях с
различной полярностью и вязкостью
1.2.3. Природа «коротковолновых» полос флуоресценции и возбуждения флуоресценции ТИТ. Модели связывания ТИТ с
амилоидными фибриллами
1.2.4. Определение параметров связывания ThT с амилоидными фибриллами и спектральных свойств связанного с фибриллами
красителя
ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
2.1. Препараты
2.2. Подготовка образцов
2.3. Измерение спектров поглощения
2.4. Определение истинных спектров поглощения растворов со
значительным светорассеянием
2.5 Измерение спектров флуоресценции
2.6 Регистрация и анализ кривых затухания флуоресценции
2.7 Электронная микроскопия
2.8 Равновесный микродиализ
ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ
3.1. Спектральные свойства ТЬТ и механизм связывания красителя с амилоидными фибриллами
3.1.1 .Объяснение существования коротковолновых спектров флуоресценции и возбуждения флуоресценции красителя в водном растворе
3.1.2. Причины возрастания квантового выхода флуоресценции ТЬТ при его встраивании в амилоидные фибриллы Флуоресцентные свойства ТЬТ в растворителях с различной вязкостью и температурой
3.1.3. Модель встраивания ТЬТ в амилоидные фибриллы
3.2. Структурные параметры связывания ТЬТ с амилоидными фибриллами
и фотофизические характеристики связанного красителя
3.2.1. Методика определения параметров связывания ТЬТ с амилоидными фибриллами
3.2.2. Получение амилоидных фибрилл и их визуализация
3.2.3. Определение спектров поглощения ТЬТ, связанного с амилоидными фибриллами
3.2.4. Определение параметров связывания ТЬТ с амилоидными фибриллами
3.2.5. Взаимодействие ТЬТ с ацетилхолинэстеразой
3.2.6. Универсальность предложенного подхода и возможность его использования для определения параметров связывания
поглощающих лигандов с рецепторами
3.2.7. Определение коэффициентов молярной экстинкции ТЬТ,
связанного с амилоидными фибриллами
3.2.8. Корректировка зарегистрированной интенсивности
флуоресценции связанного с фибриллами ТЬТ
3.2.9. Определение квантового выхода флуоресценции ТЬТ,
связанного с амилоидными фибриллами
3.3 Протокол определения параметров связывания ТЬТ с амилоидными фибриллами и фотофизических характеристик связанного красителя
3.1.1 .Определение числа мест связывания (я,) и констант связывания
(К/,,) ТЬТ с амилоидными фибриллами
3.1.2.Определение коэффициентов молярной экстинкции ТЬТ,
связанного с фибриллами (єЬі)
3.1.3. Определение квантового выхода ТЬТ, связанного с фибриллами
(Яь,)
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
ВЫВОДЫ
СПИСОК ЦИТИРУЕМОЙ ЛИТЕРАТУРЫ
з..-:
. |Е(5|) 4 Г
тшшЬ'
ПСГ^,)
Рис. 1.9. Схема, иллюстрирующая процессы поглощения и флуоресценции ТЬТ в полярных растворителях [82]. Стрелками показано поглощение (1), флуоресценция из /.^-состояния (2), торсионная релаксация из ЬЕ в Т1СТ-состояние (3) и безызлучательный переход из Т1СТ в основное состояние (4). Ей N — равновесные и неравновесные состояния. Вертикальные стрелки соответствуют процессам поглощения и флуоресценции ТЬТ. 50 и 5/* - энергетические уровни, соответствующие основному и возбужденному состояниям красителя. И Ж/ -энергии стабилизации молекулы ТЬТ в основном и возбужденном состоянии, обусловленные взаимодействием положительно заряженных фрагментов красителя и молекул полярного растворителя. Флуоресценция соответствует переходу из частично- равновесного возбужденного состояния в частично-равновесному основное состояние. Толщина стрелок характеризует вероятность перехода.
Название работы | Автор | Дата защиты |
---|---|---|
Структура полноразмерного L1-выступа бактериальной рибосомы. Влияние изменений поверхности контакта рибосомного белка L1 Thermus thermophilus с РНК на его РНК-связывающие свойства | Сарских, Алена Витальевна | 2014 |
Новая стратегия использования генов антимикробных пептидов из яда членистоногих в качестве генотерапевтических агентов | Лазарев, Василий Николаевич | 2010 |
Генетически кодируемые флуоресцентные инструменты для исследования живых систем | Чудаков, Дмитрий Михайлович | 2011 |