Синтез хромогенных субстратов и ингибитора глутамилэндопептидаз с использованием субтилизина

• Автор: Мильготина, Екатерина Иосифовна
• Шифр специальности: 02.00.10
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2001
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 135 с.

СОДЕРЖАНИЕ
СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ
1. GLU,ASP-СПЕЦИФИЧНЫЕ ЭНДОПЕПТИДАЗЫ
(литературный обзор)
1.1.Место глутамилэндопептидаз в классификации ферментов (введение) 8 1.2.0сновные физико-химические свойства
1.3.Влияние ионов и ингибиторов
1.3.1. Влияние катионов металлов
1.3.2.Влияние анионов буферных растворов
1.3.3. Влияние ингибиторов
1.4.Субстратная специфичность
1.4.1.Гидролиз низкомолекулярных пептидных
субстратов, катализируемый глутамилэндопептидазами
1.4.2.Гидролиз белковых субстратов,
катализируемый глутамилэндопептидазами
1.5.Функциональная организация глутамилспецифичных эндопептидаз
1.5.1.Анализ первичной структуры
1.5.2.Пространственная структура глутамилэндопептидаз
1.5.2.1 .Пространственная структура глутамилэндопептидазы из Streptomyces griseus
1.5.2.2. Компьютерное моделирование пространственных
структур глутамилэндлпептидаз
1.5.2.2.1. Модель глутамилэндопептидазы из Bacillus licheniformis
1.5.2.2.2.Модель глутамилэндопептидазы из Bacillus subtilis
1.5.2.2.3.Модель глутамилэндопептидазы из Staphylococcus aureus,
шт. V8
1.6.Применение глутамилспецифичных эндопептидаз
1.6.1. Применение глутамилэндопептидаз для гидролиза
пептидных последовательностей
1.6.2.Использование глутамилспецифичных эндопептидаз в
качестве катализаторов реакций образования пептидных связей

1.6.3.Использование концепции субстратов-миметиков в ферментативном пептидном синтезе
Заключение
2. ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ
2.1.Синтез субстратов глутамилэндопептидаз
2.1.1.Выбор метода синтеза
2.1.2.Синтез п-нитроанилидов пептидов, содержащих С-концевые остатки глутаминовой или аспарагиновой кислот
2.1.3.Гидролиз пептидил-п-нитроанилидов, катализируемый субтилизином
2.1.4. Гидролиз хромогенных субстратов глутамилэндопептидазами
из Bacillus intermedius и Bacillus licheniformis
2.1.5.Субстратная специфичность мутантных форм глутамилспецифичных эндопептидаз из Bacillus intermedius
и Bacillus licheniformis
2.2.Синтез пептидоальдегида - ингибитора глутамилспецифичных эндопептидаз
2.2.1.Выбор структуры ингибитора и пути его синтеза
2.2.2.Синтез H-Glual=sem
2.2.2.1. Синтез Z- Glu ( O'Bu )ol
2.2.2.2. Окисление Z-Glu(0‘Bu)ol
2.2.2.3. Получение H- Glual=sem 8
2.2.3.Ферментативный синтез Z-Ala-Ala-Leu-Glual=N-NH-CO-NH2
2.3.Ингибирование глутамилэндопептидаз из Bacillus intermedius
и Bacillus licheniformis
2.3.1. Определение константы ингибирования
2.3.2. Определение типа ингибирования 8
ВЫВОДЫ
З.ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ
3.1.Материалы и методы
3.2.Синтез исходных соединений
3.2.1.Boc-AspfO‘Bu)-OH

3.2.2.Boc-Asp(0‘Bu)-pNA
3.2.3. CF3COOH A sp-pNA
3.2.4.Boc-Glu(0‘Bu)-Glu-pNA
3.2.5. Glu-Glu-pNA
3.2.6.Приготовление хромового ангидрида (СгОз)
3.2.7.Приготовление комплекса Ру СгОз
3.2.8. Приготовление Pd-черни
3.2.9.Приготовление аммиачного раствора серебра
З.З.Синтез хромогенных субстратов
3.3.1.Химический синтез пептидил-п-нитроанилидов
3.3.1.1.Z-Ala-A la-Pro-Glu-pNA
3.3.1.2. Z-A la-Ala-Glu-Glu-pNA
3.3.2. Ферментативный синтез п-нитроанилидов
N-ацилтетратпептидов
3.3.2.1. Сорбция субтшизина- 72 на носителе
3.3.2.2. Построение типичных кинетических кривых
ферментативного синтеза пептидил-п-нитроанилидов
3.3.2.3. Z-A la-A la-Leu-A sp-pNA
3.3.2.4. Z-A la-A la-Leu-Glu-pNA
3.3.2.5. Z-A la-A la-Phe-A sp-pNA
3.3.2.6. Z-A la-A la-Phe-Glu-pNA
3.3.2.7.Z-Ala-Ala-Phe-Glu-pNA (аналитический опыт;
карбоксильный компонент Z-A la-A la-Phe- ОН)
3.3.2.8.Z-Ala-Glu-pNA (аналитический опыт)
3.3.2.9. Z-A la-A la-Glu-pNA (аналитический опыт)
3.4.Синтез пептидил-а-аминоальдегида
3.4.1.Z-Glu(0‘Bu)-0NSu
3.4.2.Z-Glu(OBzl)ol
3.4.3.Z-Glu(OtBu)ol
3.4.4.Z-Glu(0'Bu)al
3.4.5. Z-GlufO'Bulal^sem

Рис. 4. Компьютерная модель активного центра и 8гучастка ВВОЗЕ
Рис. 5. Стереоизображение В8-08Е в области участка 8| и оксианионной впадины
Рис. 6. Стереоизображение участков 8: и 8|' активного центра /8-Сі81-. с моделированным субстратом Сіїи-і’Ііе