Структурно-динамические модели биологически активных молекулярных соединений

• Автор: Ведяева, Светлана Юрьевна
• Шифр специальности: 01.04.05
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2001
• Место защиты: Саратов
• Количество страниц: 213 с.

ОГЛАВЛЕНИЕ
Введение
Глава 1. Молекулярные модели и их математическое описание
1.1. Методика использования математического аппарата тензорной алгебры в теории молекулярных колебаний
1. 2. Математическое описание колебательно-вращательной модели жесткой молекулы
1.3. Модельные гамильтонианы для ангармонической механической задачи теории колебательных спектров
1. 4. Криволинейные координаты и эффект Душинского в теории электронноколебательных спектров
1.4. 1. Нормальные координаты классической колебательной задачи
1. 4. 2. Коллективные координаты колебательно-вращательной модели многоатомной молекулы
1. 4. 3.Использование естественных колебательных координат
1.5. Учет неадиабатических эффектов в молекулярной динамике
1. 6. Метрические соотношения для естественных колебательных координат и кинематическая ангармоничность
1.6. 1. Метрические соотношения для координат типа с] (изменение длины связи между атомами)
1. 6. 2. Метрические соотношения для координаты типа /> (изменение угла связи между единичными векторами е^тле}к)
1. 6. 3. Метрические соотношения для координат типа р (изменение угла между связью и плоскостью молекулярного фрагмента)
1. 6. 4. Метрические соотношения для координат типа X (изменение угла между плоскостями молекулярных фрагментов)
1. 7. Алгоритм вычисления параметров кинематической ангармоничности
1.7. 1. Производные от метрических коэффициентов для координаты типа (растяжение связей)
1. 7. 2. Производные от метрических коэффициентов для координаты типа (изменение валентных углов)
1. 7. 3. Производная от метрических коэффициентов для координаты типа р (угол между связью и плоскостью)
1. 7. 4. Производные от определяющего вектора плоскости (рекуррентные выражения
1. 7. 5. Производные от метрических соотношений для координат типа % (угол между некомпланарными плоскостями)
Глава 2. Квантовохимические расчеты в молекулярной спектроскопии
2. 1. Расчеты колебательных спектров неэмпирическими методами
2. 1. 1. Расчеты в приближении Хартри-Фока-Рутаана
2. 1. 2. Расчеты в приближении Меллера-Плессета
2. 1.3. Расчеты в приближении метода функционала плотности
2. 2. Численный эксперимент на программном комплексе Vibration 2
2. 2. 1. Структура программы Vibration 2001 и особенности реализации
2. 2. 2. Модуль 1- MolParametrs. Анализ молекулярных параметров колебательновращательного взаимодействия, вычисленных методом ab initio
2. 2. 3. Модуль2 - KCh2001Call. Реализация алгоритмов решения прямой и обратной механической задачи теории колебаний молекул
2. 2. 4. МодульЗ - KCh2000Dat. Реализация пользовательского интерфейса
Vibration 2
2. 3. 1. Тестирование комплекса программ Vibration 2001 на примере этилена и его дейтерозамещенных
2. 3. 2. Тестирование комплекса программ Vibration 2001 на примере муравьиной
кислоты и ее дейтерозамещенных
Глава 3.Построение структурно-динамических моделей шестичленных азоцикли-ческих соединений в основном и первом возбужденном электронных состояниях
3. ГМоноазины
3. 1. 1. Структурно-динамическая модель пиридина в основном и первом
возбужденном электронных состояниях
3. 1.2. Структурно-динамическая модель N-окиси пиридина в основном и первом
возбужденном электронных состояниях
3. 2. Диазины
3.2. 1. Структурно-динамическая модель пиримидина в основном и первом возбужденном электронных состояниях
3. 2. 2. Структурно-динамическая модель пиразина в основном и первом возбужденном электронных состояниях
3. 2. 3. Структурно-динамическая модель пиридазина в основном и первом возбужденном электронных состояниях
3.3. Структурно-динамическая модель симметричного триазина в основном электронном состоянии
3. 4. Структурно-динамическая модель симметричного тетразинав основном и
первом возбужденном электронных состояниях
Глава 4. Построение структурно-динамических моделей биологически активных
молекулярных соединений
4.1.Структурно-динамическая модель Р-хлорвинилдихлорарсина - C2H2ASCI3 в основном электронном состоянии
4. 2. Структурно-динамические модели дибензо-п-диоксинов в основном электронном состоянии
4. 3. Структурно-динамическая модель урацила в основном и первом возбужденном электронном состоянии
Заключение
Библиографический список
Приложения

ВВЕДЕНИЕ
Наиболее полное использование потенциальных возможностей молекулярной спектроскопии, в том числе ИК-, УФ- и КР-спектроскопии, может быть достигнуто, при исследовании происхождения спектральных линий и их связи с характеристиками исследуемых соединений. Современная оптическая экспериментальная техника позволяет получить полную количественную информацию о спектральных характеристиках молекул. Теоретические же расчеты позволяют найти связь между типами взаимодействий в соединениях и определенными из эксперимента характеристиками электронного строения молекул. Обычно лишь с использованием представлений, нашедших свое обоснование в результатах теоретических расчетов и подтвержденных данными эксперимента, удается наметить новые пути синтеза соединений с заранее известными свойствами.
Современное исследование предполагает необходимость построения структурно-динамических моделей молекулярного соединения. Под структурнодинамическими моделями в физике молекул понимается набор физических параметров, позволяющих предсказать спектры молекулярных соединений до эксперимента или дать интерпретацию имеющегося эксперимента. Для колебательных спектров таковыми являются геометрические параметры соединения, набор силовых постоянных (адиабатический потенциал), набор электрооптических параметров (дипольный момент, поляризуемость, гиперполяризуемость).
К настоящему времени накоплен обширный экспериментальный материал по ИК и КР колебательным спектрам молекул. Основы теоретических методов исследования колебательных спектров разработаны в трудах отечественных исследователей: М. В Волькенштейна, М. А. Ельяшевича, Б. И. Степанова,
Л. С. Маянца, Л. А. Грибова. Большой вклад в исследование этой проблемы внесен учеными саратовской школы: Л. М. Свердловым, М. А. Ковнером, М. В. Приютовым, В. И. Березиным, Л. М. Бабковым, М. Д. Элькиным. К настоящему времени общую теорию колебательных спектров многоатомных молекул можно считать построенной. Основная проблема на данный момент