+
Действующая цена700 499 руб.
Товаров:
На сумму:

Электронная библиотека диссертаций

Доставка любой диссертации в формате PDF и WORD за 499 руб. на e-mail - 20 мин. 800 000 наименований диссертаций и авторефератов. Все авторефераты диссертаций - БЕСПЛАТНО

Расширенный поиск

Особенности эволюции различных функциональных областей альтернативно сплайсируемых генов эукариот

Особенности эволюции различных функциональных областей альтернативно сплайсируемых генов эукариот
  • Автор:

    Ермакова, Екатерина Олеговна

  • Шифр специальности:

    03.00.28

  • Научная степень:

    Кандидатская

  • Год защиты:

    2008

  • Место защиты:

    Москва

  • Количество страниц:

    103 с. : ил.

  • Стоимость:

    700 р.

    250 руб.

до окончания действия скидки
00
00
00
00
+
Наш сайт выгодно отличается тем что при покупке, кроме PDF версии Вы в подарок получаете работу преобразованную в WORD - документ и это предоставляет качественно другие возможности при работе с документом
Страницы оглавления работы
"1.1 Альтернативный сплайсинг общее введение 1.2 Функции альтернативного сплайсинга в клетке


ОГЛАВЛЕНИЕ
ВВЕДЕНИЕ

1 ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1 Альтернативный сплайсинг общее введение

1.2 Функции альтернативного сплайсинга в клетке

1.2.1 Альтернативный сплайсинг и регуляция

1.2.2 Функциональность альтернативного сплайсинга

1.2.2.1 РАСТ регулируемый

антипродуктивный альтернативный сплайсинг и трансляция

1.2.3 Альтернативный сплайсинг и структура белка

1.3 Парные альтернативные сайты сплайсинга в геноме человека


1.4 Эволюция альтернативно сплайсируемых областей
1.4.1 Метод молекулярной эволюции
1.4.2 Молекулярная эволюция эукариотических геномов
1.4.3 Образование и дальнейшая эволюция альтернативно сплайсируемых областей
2 МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
2.1 Данные
2.1.1 Аннотация альтернативного сплайсинга
2.1.2 Поиск ортологичных генов и геномные выравнивания
2.2 Алгоритмы
2.2.1 Оценка количества нуклеотидных замен. Метод Ины
2.2.2 Асимметрия мутаций нуклеотидов
2.2.3 Точность оценки эволюционных параметров
2.2.4 Веса сайтов
2.3 Программное обеспечение
2.3.1 и идентификация ортологичных сайтов сплайсинга
2.3.2 I предсказание функциональности сплайсированных мРНК
2.3.3 построение логодиаграмм
2.3.4 статистика
2.3.5 Авторское программное обеспечение
3 ПЕРЕКРЫВАЮЩИЕСЯ ДОНОРНЫЕ САЙТЫ СПЛАЙСИНГА В ГЕНОМЕ ЧЕЛОВЕКА
3.1 Определения
3.2 Результаты
3.3 Обсуждение
4 НУКЛЕОТИДНЫЕ ЗАМЕНЫ В АЛЬТЕРНАТИВНЫХ И
ПОСТОЯННЫХ БЕЛОККОДИРУЮЩИХ УЧАСТКАХ ГЕНОВ
4.1 Определения
4.2 Результаты
4.3 Обсуждение
ВЫВОДЫ
БЛАГОДАРНОСТИ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ


Показано, что в альтернативных кодирующих участках генома нуклеотидные замены фиксируются чаще, чем в постоянных, и давление отбора ослаблено как па уровне мРНК, так и на уровне белка. Отдельно исследовано поведение нуклеотидных замен в концевых и внутренних участках гена. Показано, что внутренние альтернативные участки генов дрозофилы находятся под положительным отбором, а в альтернативных участках генов человека, соответствующих Сконцу белка, отрицательный отбор слабее иили положительный отбор сильнее, чем в других альтернативных участках. Недавно были исследованы перекрывающиеся донорные сайты со сдвигом сайта на три нуклеотида и консенсусом ОУЪЮУТМ 2, см. При выборе альтернативы в таком сайте не происходит сдвига рамки считывания, однако мотив СУМСУТМ далк от консенсуса, а левый сайт оказывается нарушенным. Поэтому в данной работе рассмотрены перекрывающиеся донорные сайты и других типов. Пары сайтов со сдвигом на четыре нуклеотида ОУЮУ наиболее близки к консенсусу, но сдвигают рамку считывания. Хотя этот мотив оказался наиболее распространнным 3, 4, ранее он не рассматривался подробно. В данной работе рассматриваются перекрывающиеся альтернативные донорные сайты сплайсинга, находящиеся на расстоянии от 3 до 6 нуклеотидов, и потенциальные сайты сплайсинга т. Показано, что пары со сдвигом сайта на 4 нуклеотида встречаются гораздо чаще прочих, несмотря на то, что они сдвигают рамку считывания. При рассмотрении сохранности потенциальных и активных сайтов сплайсинга в геномах мыши и собаки показано, что потенциальные донорные сайты сплайсинга в интронах сохраняются реже, чем потенциальные донорные сайты сплайсинга в экзонах, исключая потенциальные сайты, находящиеся в нитроне на расстоянии 4 нуклеотида от активного сайта, т. Основные т. Пары сайтов, оставляющие рамку считывания неизменной, сохраняются чаще, чем сдвигающие е. Наконец, показано, что в альтернативно сплайсируемых пар одна из изоформ транслируется, в то время как другая как правило, минорная нет. Такие нетранслируемые изоформы, повидимому, являются мишенью нонсенсмотивированной деградации НМД, i , п могут играть существенную роль в регуляции экспрессии генов. Таким образом, различные методы сравнительной геномики подтверждают, что экспрессия альтернативно сплайсируемых участков генов является объектом тонкой регуляции, а их нуклеотидные последовательности подвержены направленному отбору. Задачи, рассмотренные, в данной работе, существенны в контексте глобальной проблемы определения экспрессии гена в том числе, экзонинтронной структуры, альтернативного сплайсинга, взаимодействий с регуляторными молекулярными комплексами по его нуклеотидной последовательности. Разнообразны как представители одного вида, так и клетки в составе одного и того же организма. Более того, это разнообразие с течением времени изменяется клетка рождается, реагирует на внешние условия и умирает, организм растт и развивается, вид эволюционирует. Альтернативный сплайсинг активно участвует в создании разнообразия эукариотических живых организмов как в пространстве, так и во времени. Альтернативный сплайсинг позволяет получать из одного гена несколько функциональных продуктов. Они могут присутствовать одновременно в одной клетке или быть тканеспецифичными пространственное разделение, могут участвовать в разных этапах развития клетки или организма в целом временное разделение. Также альтернативные участки генов служат экспериментальным полем эволюции. Эволюция на уровне фенотипа предопределяется изменениями в последовательности ДНК организма. Под молекулярной эволюцией далее мы будем подразумевать эволюцию последовательности ДНК. Более всею нас будут интересовать точечные мутации в последовательностях генов. Точечные мутации и альтернативный сплайсинг тесно взаимодействуют точечные мутации могут разрушить сайт сплайсинга или создать новый, могут повлиять на регуляцию альтернативного сплайсинга, например, сделать постоянный сайт сплайсинга альтернативным или наоборот, а вовлечнность того или иного участка гена в альтернативный сплайсинг может повлиять на свободу его эволюции.

Рекомендуемые диссертации данного раздела

Название работыАвторДата защиты
Фронтальная устойчивость вертикальной позы человека Денискина, Наталья Владимировна 2009
Кинетическое моделирование центрального метаболизма Escherichia coli Песков, Кирилл Витальевич 2009
Обоснование и разработка системы информационного обеспечения наук о жизни Борисова, Людмила Федоровна 1998
Время генерации: 0.666, запросов: 966