Создание ДНК маркеров геномов A, B и C Brassica

• Автор: Панкин, Артем Андреевич
• Шифр специальности: 03.00.23
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2009
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 145 с. : ил.

ВВЕДЕНИЕ

Глава 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.

1.1. Систематика и таксономия i i.

1.2. Геномы видов i.

1.3. Молекулярные инструменты для выявления полиморфизма, различения и идентификации геномов i
1.4. Патенты, основанные на использовании ДНК маркеров i и методах получения растений, устойчивых к заболеваниям
1.5. Заключение постановка задач диссертационной работы и выбор экспериментальных подходов.

Глава 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ

2.1. Растительный материал.

2.2. Методы исследования.

2.2.1. Выделение геномной ДНК из тканей растений

2.2.2. Амплификация фрагментов геномной ДНК и рестрикция
2.2.3. Электрофоретическое разделение фрагментов ДНК
2.2.4. Клонирование амшшфицированных фрагментов ДНК.
2.2.5. Определение нуклеотидной последовательности ДНК
2.2.6. Сравнительный анализ нуклеотидных последовательностей
2.2.7. Хромосомная локализация и генетическое картирование
2.2.8. Дотгибридизация.
2.2.9. Номенклатура маркеров, генов, хромосом и групп сцепления
Глава 3.
РЕЗУЛЬТАТЫ
3.1. Анализ полиморфизма геномов i.
3.1.1. Повторяющиеся последовательности
3.1.2. Микросагсллитные маркеры.
3.1.3. маркеры.
3.1.4. Последовательности генов.
3.2. Создание маркеров геномов АС.
3.2.1. Создание геномспецифичных маркеров.
3.2.2. Верификация маркеров
3.2.3. Хромосомная локализация и генетическое картирование
маркеров
3.3. Изучение филогенетических взаимоотношений видов трибы i
Глава 4. ОБСУЖДЕНИЕ.
4.1. маркеры генома В
4.1.1. Универсальный маркер генома В.
4.1.2. Хромосомспецифичные маркеры генома В.
4.2. маркеры геномов А и С.
4.3. Верификация маркеров
4.4. Использование геномспецифичных маркеров для решения селекционногенетических задач
4.4.1. Изучение филогенетических взаимоотношений видов трибы i.
4.4.2. Идентификация образцов i в генетических коллекциях.
4.4.3. Номенклатура хромосом и групп сцепления генома В
ЗАКЛЮЧЕНИЕ.
ВЫВОДЫ.
СПИСОК ЦИТИРОВАННОЙ ЛИТЕРАТУРЫ


i видов затрудняет составление представительных выборок родов и видов для надежного разрешения проблем систематики и таксономии путем описания морфологических признаков. ii . дегидрогеназы субъединица 5 для построения филогении i. i. Границы нескольких новых триб были определены с использованием молекулярных методов систематики новые грибы хорошо встраивались в установленную систему трех монофилетических групп i IIII. Все три 1руппы, как и трибы, в составе i имели монофилетическое происхождение. Филогенические взаимоотношения групп в составе i, установленные с помощью , оказались достаточным основанием для формирования новой молекулярной классификации семейства . . Рис. Филогенетические отношения между трибами семейства i установленные на основании анализа . Триба i выделена серым. По . Многочисленные исследования по молекулярной систематике подтверждают необходимость обновления традиционной классификации i i . i . . i . , . . i , . Помимо гена для молекулярнофилогенетических исследований на уровне семейства используются такие разнообразные элементы генома, как межрибосомальные транскрибируемые спейсеры локусов ядерных рибосомальных генов i i , I i . РНК . А С А, ii . ii с соавторами сопоставили данные молекулярной систематики с разнообразием морфологии трихом у видов i и показали, что данный признак надежен при определении принадлежности растения к той или иной трибе i. Например, большинство таксонов группы I имеют ветвящиеся трихомы различной формы, а растения таксонов группы II имеют простые трихомы или гладкие поверхности. Триба i. i, одна из триб в составе семейства i, включает родов и около 0 видов растений и является одной из наиболее сложных для изучения изза трипликации геномов, произошедшей на ранней стадии становления . Центр наибольшего разнообразия видов i находится в югозападной области Средиземноморья Алжир, Марокко и Испания, где произрастают около эндемичных родов. Ареал произрастания видов i простирается до Индии и Пакистана, а также в направлении Южной Африки при относительно слабой представленности в Новом Свете , , . Представители трибы отчетливо отличаются от остальных i наличием складчатых семядолей семядоли сложены вдоль корешка, простых волосков трихом иили поперечно сегментированных плодов i , , содержащих семена в одном или нескольких сегментах. Определение границ родов i представляет определенные затруднения, так как многие роды представлены единственным видом. x. . i i, . I i . В x. В. . i i. Егиг. . i, . i . , . iii i . i. . i . x , iiv . i i. ii . . i ii, i , . i. iix i. v, , С . i 21. . ii . i. Vi i, V. ii iiiix, . . Рис. Филогенетические взаимоотношения видов трибы i, установленные путем анализа полиморфизма гена . По i . На филограмме В. В. гара и . Объединение видов иодтриб ii, i и iii в группы В. i i и В. . i было впервые предложено i и путем сопоставления полиморфизма сайтов рестрикции хлоропластной ДНК с особенностями цитологического строения видов i.