Молекулярно-генетическое исследование наследственной предрасположенности к раку желудка

• Автор: Цуканов, Алексей Сергеевич
• Шифр специальности: 03.00.15
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2008
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 84 с. : 18 ил.

СОДЕРЖАНИЕ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

ВВЕДЕНИЕ.

ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

Глава 1. РАК ЖЕЛУДКА.

1.1 Заболеваемость раком желудка в России и в мире.

1.2 Классификации рака желудка.

1.3 Семейный рак желудка.

Глава 2. ГЕНЫ СП7, 1, 2 СУПРЕССОРЫ ОПУХОЛЕВОГО

2.1 Структура и функции гена 1

2.1.1 Наследственные мутации в гене II1

2.1.2 Полиморфизмы в гене 1.
2.2 Гены 1 и I .
Глава 3. ДРУГИЕ ГЕНЫ, ОТВЕТСТВЕННЫЕ ЗА НАСЛЕДСТВЕННУЮ
ПРЕДРАСПОЛОЖЕННОСТЬ К РАКУ ЖЕЛУДКА
МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
1.Пациент ы
2. Анализ первичной структуры генов предрасположенности к раку желудка.
2.1. Выделение ДНК.
2.2. ПЦР полимеразная цепная реакция
2.3. Оценка качества ПЦР
2.4а. Образование гетеродуплексных фрагментов ДНК.
2 Денатурация фрагментов ДНК при использовании метода .
2.5. Электрофорез
2.6. Окраска геля
2.7. Секвенирование
2.8. Анализ промоторного участка гена I.
2.9 Анализ микросателлитных маркеров в области гена I1
3. Анализ значения некоторых вариантов в генах I, 1 и 2
4. Статистическая обработка результатов
РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ
1. Исследование пробандов с семейным раком желудка на наличие мутаций в гене 1
2. Исследование пробандов с семейным раком желудка на наличие мутаций в генах 1 и 2
3. Изучение полиморфизмов 0СА и СТ на выборке спорадических и семейных больных РЖ и в контрольной выборке
4. Гаплотипированис гена I по микросателлитным маркерам.
ВЫВОДЫ.
ПРАКТИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ


Вероятность обнаружения мутации может быть повышена при использовании определенных критериев отбора семей i . Примерно у семей с РЖ встречаются случаи рака толстой кишки ivi . Семьи с раком желудка могут соответствовать критериям синдрома наследственного неиолипозного рака толстой кишки. Данное заболевание, как правило, связано с наследуемыми мутациями в генах 1 и I2. Мутации в этих генах обнаруживают в семьях с РЖ и с раком толстой кишки, не отвечающих критериям наследственного неиолипозного рака толстой кишки, а также в семьях с РЖ без случаев рака толстой кишки i . Частоты мутаций в генах предрасположенности к раку желудка различны в выборках из разных популяций. В России указанные гены при семейном раке желудка ранее не были исследованы. Восполнение этого пробела позволит внести существенный вклад в изучение особенностей мутационных процессов в разных популяциях. Кроме того, число исследований ряда генов предрасположенности на одной и той же выборке семейного рака желудка в настоящее время не велико. Проведение такого исследования позволит оценить вклад разных генов в семейную предрасположенность к раку желудка, значение чего усиливает существование популяционных особенностей. Мутации даже в нескольких известных генах в совокупности объясняют только часть случаев семейного РЖ. Поиски дополнительных генов предрасположенности к РЖ до настоящего времени не дали результатов. В пользу этого говорят данные о функциональном значении некоторых из них, в частности, в гене СОЯ 1л Ь. Такие варианты могут быть ассоциированы и с риском спорадического РЖ. Определение характеристик вариаций в генах, связанных с возникновением рака желудка важно не только с фундаментальной точки зрения, но и для решения практических медикогенетических задач. Основной причиной высокой смертности больных раком желудка является позднее выявление болезни. Изучение молекулярногенетических причин предрасположенности к раку желудка будет создавать новые возможности для медикогенстического консультирования и профилактики при этом заболевании. Цель исследования. Целью настоящей работы явилось исследование молекулярногенетических особенностей предрасположенности к раку желудка, основанное на анализе изменений первичной структуры генов СйН1у МЬНу МЗН2. СйН по однонуклеотидным полиморфизмам и микросателлитным маркерам. Научная новизна. Впервые изучены характеристики вариантов в генах СЭН1У МЬН МЗН2 на выборке семейного рака желудка в России. Мутации в генах МЬН1 и МЗН2 обнаружены как в семьях с только раком желудка, так и включающих наряду с раком желудка рак толстой кишки. При этом наибольшая частота мутаций наблюдалась в семьях с присутствием рака толстой кишки наряду с раком желудка. Показана ассоциация с раком желудка генотипов 0АА и ТТ в гене СЭН1. СА и СТ в гене СОН. Выявлено, что генотип ГТ связан с риском рака желудка в присутствии генотипа 0СА и не приводит к повышению риска в присутствии генотипа 0СС. С помощью гаилотипирования по микросателлитным маркерам показано отсутствие единого гаплогипа при вариантах риска по однонуклеотидпым полиморфизмам в гене СОН1 что свидетельствует в пользу влияния на риск именно данных вариантов. Научнопрактическая значимость работы. Научнопрактическая значимость результатов настоящей работы обусловлена выявлением связи вариантов первичной структуры ДНК генов СОН1, МЫ и М Выявленные мутации в генах МЫ и М2 при семейном раке желудка, в том числе их высокая частота с присутствием в семье рака толстой кишки, имеет существенное значение для практической ДНКдиагностики наследственной предрасположенности к раку желудка. Выявленная ассоциация с раком желудка генотипов по однонуклеотидпым полиморфизмам в гене СОН может служить основой для последующей разработки способа диагностики повышенного риска рака желудка. Положения. При впервые проведенном исследовании особенностей первичной структуры генов СОН1, МЫЛ и МЗН2 среди российских пробандов с семейным раком желудка у из них выявлены мутации в генах МЫП и М2, что указывает на значение этих генов в возникновении наследственной формы рака желудка.