Изучение экспрессии генов, участвующих в системном контроле деления клеток и дифференцировки у высших растений, на модели спонтанного опухолеобразования у инбредных линий редиса (Raphanus sativus var. Radicula Pers.)

• Автор: Додуева, Ирина Евгеньевна
• Шифр специальности: 03.00.15
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2007
• Место защиты: Санкт-Петербург
• Количество страниц: 176 с. : ил.

ОГЛАВЛЕНИЕ

Глава 1. ВВЕДЕНИЕ

Глава 2. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.

2.1. Генетический контроль клеточного цикла у растений.

Циклинзависимые протеинкиназы .

..

Другие группы растений.

Циклнны

Циклины класса .

Циклины класса Л.

Циклины класса В.

Другие классы циклинов.
Регуляция активности комплексов СЖциклин киназой I
и фосфатазой
Регуляция активности комплексов циклин белками САК и I.
Белок .
Транскрипционные факторы 2.
Вышележащие пути регуляции клеточного цикла у растений.
Регуляция экспрессии генов клеточного цикла Лубсемейством
транскрипционных факторов
Участие М4киназного каскада в регуляции клеточного цикла у растений.
Фитогормональная регуляция клеточного цикла
2.2. Регуляция развития меристем.
Гены X класса 1.
Гены X класса II
Взаимодействие транскрипционных факторов Xс другими белками.
Регуляция экспрессии генов X различными семействами.
транскрипционных факторов
Фитогормональная регуляция экспрессии генов X.
Взаимодействие генов и .
Подсемейство генов X ген
Мишени транскрипционного фактора .
Регуляция экспрессии гена IV.
Подсемейство генов X гены X2, X5, X8 и X9.
Подсемейство генов
Подсемейство генов I
Фитогормональная регуляция развития меристем.
2.3. Опухоли высших растений как модель в генетике развития
2.3.1. Опухоли растений, индуцированные бактериями.
Опухоли растений, индуцированные представителями рода i
Онкогены i i .
Онкогены i i
Опухоли, индуцированные галлообразующими бактериями
2.3.2. Опухоли растений, вызванные вирусами, простейшими, грибами,.
нематодами и насекомыми
Опухоли растений, индуцированные вирусами
Опухоли растений, индуцированные простейшими.
Опухоли растений, индуцированные грибами.
Опухоли растений, индуцированные нематодами
Опухоли растений, индуцированные насекомыми
2.3.3. Генетические опухоли растений.
Спонтанное опухолеобразование у межвидовых гибридов
Спонтанное опухолеобразование у трансгенных растений ii.
с супрессией гена
Опухолеобразующие мутанты ii i.
Спонтанное опухолеобразование у инбредных линий
Общие механизмы индукции опухолеобразования у растений.
Глава 3. МАТЕРИАЛ И МЕТОДЫ.
3.1. Материал
3.2. Методы
3.2.1. Полевые методы
3.2.2. Метод асептической культуры изолированных органов растений i vi.
3.2.3. Молекулярногенетические методы исследования.
Выделение тотальной растительной ДНК.
Фракционирование ДНК методом электрофореза в агарозном геле.
Полимеразная цепная реакция ПЦР.
Выделение ПЦРфрагментов из агарозного геля.
Клонирование ПЦРфрагментов.
Трансформация бактерий
Выделение плазмидной ДНК бактерий.
Выделение тотальной РНК растений.
ДНКазная обработка РНК.
Электорофорез РНК в агарозном геле.
ОТПЦР.
Глава 4. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ.
4.1. Изучение особенностей регенерации на средах с цитокининами
у инбредных линий редиса
4.2. Клонирование и секвеннрование ПЦРфрагментов, полученных
при амплификации геномной ДНК редиса с праймерами к генам
3, 1
4.3. Изучение экспрессии генов 3, и
у инбредных линий редиса
4.3.1. Изучение экспрессии гена 3.
Экспрессия гена 3 у растений редиса i viv.
Экспрессия гена 3 у растснийрегенерантов редиса i vi.
4.3.2. Изучение экспрессии гена .
Экспрессия гена у растений редиса i viv .
Экспрессия гена у растенийрегенерантов редиса i vi
4.3.1. Изучение экспрессии гена
4.4. Обсуждение
Глава 5. ЗАКЛЮЧЕНИЕ
ВЫВОДЫ.
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ


Их экспрессия носит циклический характер, что характерно для генов клеточного цикла. Для некоторых отмечена строгая тканеспецифичность экспрессии например, экспрессируется только в корнях, 3 в опухолях, индуцированных агробактериями и в каллусах . Возможно, разные принимают участие в контроле деления и определения судьбы клеток в разных тканях. Протеинкиназная активность и субстратная специфичность зависит от каталитических субъединиц циклинов. У эукариот имеется несколько групп циклинов, которые контролируют клеточный цикл на разных стадиях. Точная функция некоторых из них до сих пор не установлена. У животных обнаружено классов циклинов классы А и Т . Первые циклины растений были открыты в г. . , В, С, , , , , , Р, Т и циклинов растений . . . Циклины растений в пределах каждого класса демонстрируют высокий процент гомологии и одинаковый характер экспрессии, что позволяет предположить их функциональное сходство . У разных видов однодольных и двудольных, а также голосеменных было выявлено более 0 циклиновых генов . Так в геноме арабидопсиса обнаружено генов, кодирующих циклины десяти разных классов . i . . iv обнаружено гена, кодирующих циклины . Циклиновые гены растений более разнообразны, чем циклиновые гены животных, что, вероятно, связано с особенностями развития растений. Например, в геноме человека присутствуют два гена циклинов класса А и три гена циклинов класса . Некоторые классы циклинов уникальны для растений. Пять классов циклинов, обнаруженных у растений, встречаются у всех эукариот, четыре класса циклинов имеются только у растений, один класс циклины обнаружен у растений и простейших, но отсутствует у животных . и Гциклинов растений и позвоночных . В то же время циклины арабидопсиса и человека демонстрируют значительные различия и были отнесены к разным группам. Анализ показал отсутствие у растений ортологов циклинов классов Е, и , характерных для животных. Функция значительной части циклинов и циклинподобных белков растений не выяснена, но экспрессия их генов меняется в зависимости от фазы клеточного цикла, что позволяет предположить участие данных генов в контроле деления клеток . Схема строения молекул циклинов разных классов представлена на рис. Молекулы всех циклинов содержат консервативный участок длиной примерно 0 аминокислот, который включает в себя концевой и Сконцевой домены. концевой домен длиной около 0 аминокислот присутствует у всех циклинов и содержит сайт связывания с . Сконцевой домен менее консервативен и отсутствует у некоторых циклинов например, циклинов арабидопсиса разных классов лишены Сконцсвого домена . Значение Сконцевого домена молекул циклинов неизвестно определенную функциональную значимость его подтверждает наличие Сконцевого домена у А, В и . Также в молекулах многих циклинов например, практически всех А и бокс i x, который участвует в протеолизе циклинов через убиквитинзависимый путь V . Помимо бокса, ряд циклинов, например, циклины, содержит так называемый мотив специфическую последовательность, обогащенную остатками пролина Р, глутаминовой кислоты Е, серина и треонина Т, который служит мишенью для убиквитинзависимого протеолиза и является маркером нестабильных белков . Нестабильность циклинов важна для обеспечения их функции, которая предусматривает быстрое прекращение активности СЖциклиновых комплексов в определенные моменты клеточного цикла. Мутации, приводящие к повышению стабильности молекул циклинов, приводили к нарушению нормально хода клеточного цикла и аномалиям развития i . При анализе экспрессии генов циклинов и циклинподобных белков в разных тканях арабидопсиса . .