Исследование генетического разнообразия и процессов видообразования эндемичного семейства рыб озера Байкал - голомянок (Comephoridae)

• Автор: Тетерина, Вероника Игоревна
• Шифр специальности: 03.00.15
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2008
• Место защиты: Иркутск
• Количество страниц: 113 с. : ил.

СОДЕРЖАНИЕ стр.

ВВЕДЕНИЕ

ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.

1.1. Краткая характеристика семейства Сотерйопбас оз.

1.2. Краткая история изучения голомянок

1.3. Геоморфологические особенности, рифтогенез и налеоклимат оз. I

1.4. Выбор маркера для молекулярногенетических исследований.

1.5. Микросателлитная ДНК

1.5.1. Основные характеристики и эволюция микросателлитных повторов.

1.5.2. Методика проведения анализа микросателлитных локусов

1.5.3. Статистические методы оценки полиморфизма микросателлитов

1.6. Использование полиморфизма митохондриальной ДНК мтДНК в
эволюционных и популяционных исследованиях
1.7. Оценка генетикодемографических параметров популяции
1.8. Методы построения филогенетических схем.
1.8.1. Модели эволюционных изменений.
1.8.2. Методы построения филогенетических схем, основанные на оценке генетических расстояний дистанционноматричные методы
1.8.3. Метод максимальной экономии.
1.8.4. Метод максимального правдоподобия.
1.8.5. Методы, основанные на байесовской статистике
ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
2.1. Сбор образцов и выделение ДНК.
2.2. Полимеразная цепная реакция ПЦР микросателлитной и мтДНК
2.3. Электрофорез микросателлитной ДНК в полиакриламидных гелях
2.4. Электрофорез ДНК в агарозных гелях
2.5. Определение нуклеотидной последовательности фрагментов мтДНК.
2.6. Обработка данных микросателлитного анализа
2.7. Обработка данных анализа мтДНК
ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ
3.1. Анализ полиморфизма микросателлитной ДНК голомянок
3.1.1. Аначиз генетического полиморфизма малой голомянки по
микросатсллитным локусам
3.1.2. Анализ генетического полиморфизма большой голомянки по
микросателлитным локусам
3.1.3.Сравнительный анализ внутривидового генетического полиморфизма
малой и большой голомянок по микросателлитным локусам.
3.2. Анализ нуклеотидных последовательностей митохондриального гена
цитохрома Ъ малой и большой голомянок.
ГЛАВА 4. ОБСУЖДЕ1ТИЕ.
ВЫВОДЫ.
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ


i ii i i ii i i I3 i ii, v i i , i. vii , . . 5. Тетерина В. И., Кирильчик . ., Суханова Л. Байкальского региона. УланУдэ Бурятский гос. i V. v . V., v В. ., . .V. Ii i i i i ii i v ii i i i vi i. . I, i. . . Тетерина В. И., Суханова I. Богданов Б. Э., Кирильчик . . Внитривидовой генетический полиморфизм малой i и большой ii голомянок Сборник материалов VIII Всероссийского популяционного семинара Популяции в пространстве и времени. Нижний Новгород, Россия 79. Тетерина В. И., Суханова Л. В., Богданов Б. Э., Аношко П. С.В. Анализ генетического полиморфизма пелагического вида рыб оз. Байкал малой голомянки i по микросателлитным локусам Генетика, , том , 7, с. Тетерина В. И., Гайкалов И. В., Суханова Л. В., Кирильчик С. В. Эволюционные исследования рыб Байкала методами молекулярной биологии основные результаты и перспективы Тезисы докладов и стендовых сообщений Четвертой Верещагинской Байкальской конференции. Иркутск. С. 23. Тетерина В. И., Суханова Л. В., Богданов Б. Э., Кирильчик С. В. Исследования темпов молекулярной дивергенции и видообразования на примере трех видов байкальских рогатковидных рыб Популяционная экология животных материалы Международной конференции Проблемы популяционной экологии животных. Томск. С. 78. Тетерина В. И., Суханова Л. В., Кирильчик С. В. Полиморфизм микросателлитной ДНК эндемичного рода рыб оз. Байкал голомянок , Экологическая генетика, , том V, 2, с. БЛАГОДАРНОСТИ . Пользуясь случаем, автор выражает искреннюю благодарность научному руководителю к. Кирильчику С. В. за внимательное и конструктивное руководство, а также к. Сухановой Л. В., к. Дзюба Е. В., к. Богданову Б. Э. за ценные консультации на всех этапах исследования. Огромную благодарность автор выражает заведующей лабораторией биологии рыб и водных млекопитающих к. Мельник Н. Г. и сотрудникам лаборатории Аношко П. Н. и Ханаеву И. В. за содействие в сборе материала. Автор выражает признательность к. Бондаренко . . и к. Воробьевой С. С. за неоценимую помощь в интерпретации полученных в данном исследовании результатов. Особую благодарность выражаю своим родителям за постоянную и всестороннюю моральную и финансовую поддержку. Работа выполнялась при финансовой поддержке гранта РФФИ, проект 9. Краткая характеристика семейства i оз. В открытой пелагиали Байкала обитает два вида рогатковидных рыб большая i ii , и малая . , голомянки. Согласно современной классификации голомянки единственные представители эндемичного рода семейства i букета видов рогатковидных рыб подотряд ii оз. Байкал. Голомянки самые многочисленные рыбы на Байкале. Биомасса большой голомянки оценивается в . Сиделева, . Численность видов не одинакова. По данным Старикова за период г. Ареалы обитания видов в значительной мере перекрываются. Малая голомянка встречается практически во всей водной толще Байкала, за исключением прибрежной зоны и обитает по большей части в слое 0 м. Большая голомянка распространена по всей глубоководной зоне Байкала, за исключением северной части Малого моря, створа Чивыркуйского залива, внутренних участков Баргузинского залива, Селенгинского мелководья и мелководья северной оконечности Байкала. Она более многочисленна в Среднем и, особенно, в Северном Байкале. В период открытой воды обитает глубже, чем малая голомянка от 0 до м Сиделева и др. Для голомянок характерны суточные вертикальные миграции, обусловленные перемещением основных кормовых объектов эпишуры и макрогектопуса. Голомянки глубоко адаптированы к пелагическому образу жизни в условиях открытого Байкала. В частности это выражено в удлиненных грудных плавниках и веретеновидной форме тела рис.