Молекулярно-генетическая характеристика спиномозжечковой атаксии SCA1 в Якутии

• Автор: Брахфогель, Ирина Феликсовна
• Шифр специальности: 03.00.15
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2000
• Место защиты: Якутск
• Количество страниц: 135 с. : ил

СОДЕРЖАНИЕ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

ВВЕДЕНИЕ

Глава 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1. История изучения и классификации наследственных мозжечковых атаксий

1.2. Молекулярногенетические исследования спиномозжечковых атаксий

1.3. Болезни тринуклеотидной экспансии проблема

нестабильных аллелей

1.4. Исследования НМД в Якутии

Глава 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ

2.1. Пациенты

2.2. Генеалогические исследования
2.3. Молекулярногенетические исследования
2.3.1. Экстракция ДНК
2.3.2. Амплификация ДНК
2.3.2.1. Определение концентрации образца ДНК
2.3.2.2. Приготовление реакционной смеси для полимеразной
цепной реакции ПЦР
2.3.2.3. Постановка ПЦР
2.3.3. Анализ продуктов ПЦР
2.3.4.Определение размера САСпоследовательности
2.4. Статистический анализ
Глава 3. РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЙ
3.1. Полиморфизм аллелей гена ЭСА1 в якутской популяции
3.2. География распространения мутантного гена БСА1 в Якутии
3.3. Пол передающего родителя и нестабильность гена БСА1
3.4. Региональные особенности нестабильности гена БСА1
3.5. Факторы, определяющие нестабильность гена БСА1
3.5.1. Корреляционный анализ характеристик нестабильности
3.5.2. Регрессионный анализ коррелирующих признаков нестабильности мутантного гена
3.5.3. Детальный анализ зависимости размера патологического аллеля в П от возраста отца к моменту рождения ребенка
3.5.4. Факторный анализ характеристик нестабильности гена БСА1
3.5.5. Однофакторный дисперсионный анализ АЫОУА
факторов нестабильности
Глава 4. ОБСУЖДЕНИЕ
4.1. Распространение мутантного гена ЭСА1 на территории Якутии
4.2. Аллельный полиморфизм гена ЭСА1 в якутской популяции
4.3. Нестабильность гена ЭСА1 и факторы ее модификации
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
ВЫВОДЫ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ


С внедрением в практику генетических методов диагностики НМА идентифицированы десятки семей с данной патологией и выявление новых носителей мутации увеличивается с каждым годом. Сложность ситуации усугубляется тем, что основная часть пациентов проживает в сельской местности, где отсутствует возможность проведения своевременной пренатальной диагностики заболевания. Необходимость осуществления таких мероприятий, особенно в досимптомный период, не вызывает сомнений. Однако эффективность принимаемых мер во многом зависит от направлений принятой стратегии профилактики, для создания которой большое значение имеет изучение популяционногенетических особенностей накопления мутации и ее молекулярногенетическая характеристика. Следует отметить, что работы, посвященные изучению генетики БСА1 в Якутии, крайне немногочисленны и носят больше клиникогенетический характер. Такие исследования помогут приблизиться к пониманию механизмов нестабильности тандемных триплетов, лежащей в основе многих дегенеративных заболеваний нервной системы, а своевременное определение носителей мутантного гена позволит вести речь об эффективной профилактике заболевания. Молекулярногенетическое исследование мутации гена БСА1 в Якутии имеет большое значение для уточнения распространенности заболевания и выявления факторов, способствующих увеличению числа носителей мутантного гена. I типа и оценка факторов, влияющих на нестабильность этого гена в якутской популяции. Выявить семьи со случаями БСА1 в якутской популяции. Описать аллельный полиморфизм гена БСА1. Дать характеристику распространения нормальных и мутантных вариантов гена ЭСА1 в различных субпопуляциях Якутии. Изучить влияние пола родителя на нестабильность патологических аллелей в различных очагах накопления мутации исследуемого гена. Оценить модифицирующие факторы, влияющие на нестабильность гена ЭСА1 в поколениях. Впервые изучена популяционная структура распространения мутации гена ЭСА1 в Якутии и охарактеризованы особенности его молекулярного полиморфизма. Показано существование обособленных субпопуляций с различными частотами патологических аллелей гена ЭСА1 в пределах одной этнической группы. Анализ распространения мутации в Якутии использован для решения спорных моментов в истории расселения якутов на территории их современного проживания. Впервые проведен сравнительный анализ нестабильности гена БСА1 в субпопуляциях различных географических регионов Якутии. Дана оценка факторов, влияющих на нестабильность мутантного гена. Установлено влияние молодого возраста отцов на нестабильность тракта тринуклеотидных повторов у потомства. Молекулярногенетическое исследование 8СА1 в различных субпопуляции Якутии позволяет уточнить распространенность заболевания, с учетом как больных с клинической картиной, так и асимптоматичных носителей мутации. Полученные результаты позволяют органам практического здравоохранения прогнозировать количество и примерные сроки появления новых случаев заболевания, а также организовать пренатальную диагностику этого тяжелой патологии с поздним проявлением. Большое число носителей мутантного гена БСА1 в одной этнической группе является большой редкостью и служит хорошей моделью изучения феномена экспансии числа тринуклеотидных повторов. Результаты по исследованию особенностей динамической мутации при ЭСА1 и факторов ее модификации могут быть применимы при изучении других нозологий, обусловленных тринуклеотидной экспансией. Структура распространения мутации гена БСА1 в якутской популяции включает в себя совокупность относительно обособленных субпопуляций, различающихся по частотам аллелей. Группа носителей мутации гена ЭСА1, проживающая в ЛеноАлданском междуречье, является наиболее многочисленной и разнообразной по аллельному составу, что позволяет предполагать, что именно этот район является местом первого распространения данной мутации в Якутии. Нестабильность патологических аллелей гена БСА1 имеет дифференцированный характер в зависимости от возраста и размера САСпоследовательности мужчиныносителя. Размер патологического аллеля ребенка детерминируется количеством САвповторов отца и его возрастом к моменту рождения данного потомка.