Филогенетический анализ, геномное разнообразие и сохранение леопарда : Panthera pardus

• Автор: Уфыркина, Ольга Владимировна
• Шифр специальности: 03.00.15
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2002
• Место защиты: Владивосток
• Количество страниц: 180 с. : ил

ОГЛАВЛЕНИЕ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

ВВЕДЕНИЕ.

ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.

1.1 Необходимость генетического анализа в сохранении и восстановлении биологических видов.
1.2 Использование филогенетического анализа в современной охране биологических видов.

1.3 Использование генетических маркеров.

1.3.1 Использование мтДНК.1

1.3.2 Использование микросателлитных локусов2

1.4 Исторические и современные аспекты проблемы вида и подвида

1.4.1 Проблемы вида.2

1.4.2 Проблемы подвида2
1.5 Филогенетические и популяционногенетические исследования семейства кошачьих, i.
1.6 Леопард .
1.6.1 Географическое распространение и морфология.3
1.6.2 Исторический и современный статусы3
1.6.3 Эволюционные аспекты3
1.6.4 Классическая таксономия леопарда3
1.6.5 Генетическая дифференциация .3
1.7 Дальневосточный, или амурский, леопард . . ii.
1.7.1 Морфология, географическое распространение и экология.4
1.7.2 Разведение и содержание дальневосточных леопардов в неволе
1.7.3 Международная Программа по сохранению дальневосточного леопарда в природе4
ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ.
2.1 Образцы.
2.2 Методы
2.2.1 Выделение ДНК.5
2.2.2 Митохондриальная ДНК5
Выбор участков мтДНК5 б
Создание специфичных праймеров5 б
Условия амплификации и секвенирование мтДНК.5
2.2.3 Микросателлитныс локусы 5
Выбор и использование микросателлитных локусов.5
Условия амплификации микросатеяпитных яокусов5
2.2.4 Анализ 5
Анализ мтДНК 5
Анализ микросателлитных яокусов.
ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ
3.1 Филогенетический анализ и генетическое обоснование для выделения подвидов
3.1.1 Филогенетический анализ данных мтДНК.6
3.1.2 Филогенетический анализ данных микросателлитных локусов6
3.1.3 Географическая дифференциация7 О
3.1.4 Филогенетический анализ популяций
3.1.5 Подвидовые диагностические признаки7
3.1.6 Обсуждение.7
3.2 Геномное разнообразие.
3.2.1 Разнообразие мтДНК.8
3.2.2 Разнообразие микросателлитных локусов8
3.2.3 Обсуждение.
3.3 Происхождение и историческое распространение леопарда.
3.3.1 Оценка времени происхождения современных линий.
3.3.2 Пути заселения леопардом современных мест обитания Обсуждение 9
3.4 Генетический анализ популяций Дальневосточного леопарда, Р. р. опетаИь
3.4.1 Анализ мтДНК особей Р. р. опепшИя из неволи1
3.4.2 Филогенетический анализ популяций Р. р. ойепшИБ1
3.4.3 Генетическое разнообразие популяций Р. р. опеп1аИ.1
3.4.4 Сравни тельный анализ родства популяции леопарда.1
3.4.5 Сравнение генетического разнообразия популяции Р. р. опетаИк с разнообразием в популяциях других видов кошачьих.1
3.4.6 Обсуждение.1 Н
3.4.7 Рекомендации для Программы сохранения и восстановления дальневосточного леопарда в природе.1
ВЫВОДЫ.
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ


, . Компромисс, повидимому, заключается в объединении трех подходов и сохранении процессов жизни в целом, что требует, в свою очередь, идентификации различных единиц охраны, определяемых филогенетическим подходом, сохранения их среды обитания, определяемого экологическим подходом, и сохранения и поддержания их естественных процессов, таких как постоянная адаптация к изменяющимся условиям окружающей среды и появление новых форм жизни эволюционный подход. Молекулярногенетические методологии и филогенетический подход лежат в основе, как минимум, двух из этих направлений. Первый вопрос концентрируется вокруг определения единиц охраны, т. , i, . В основе определения единиц охраны лежит видовая и подвидовая таксономическая классификация, основанная, в идеале, на соответствии множественных морфологических и генетических маркеров и выявляемая филогенетическим анализом. Таксономия, базирующаяся только на морфологических признаках, может привести к двум ошибкам в определении потенциальных единиц охраны 1 признанию значимости групп, не имеющих значительной генетической дифференциации, и 2 объединению в один таксон значительно дивергентных форм vi, . Современный филогенетический анализ, основанный на филогенетическом совпадении множественных генетических маркеров, позволяет определить не только уникальность изучаемого сохраняемого объекта что является основой планов сохранения и восстановления, но и установить его точный таксономический статус среди таксономической иерархии подобных объектов. Одним из ярких примеров филогенетического подхода в биологии сохранения может служить лисица Дарвина. До недавнего времени лисица Дарвина, x vi, обитающая в Чили, рассматривалась как подвид более распространенной серой лисицы, x i. Недавний филогенетический анализ на основе мтДНК маркеров установил не только уникальность лисицы Дарвина как вида, но и то, что этот вид является наиболее предковым, обособленным видом . Дарвина в ряд исчезающих видов, требующих немедленных охранительных мер. Другим примером может служить недавний филогенетический анализ, установивший уникальность малоизвестной редкой формы кошки с острова Борнео, i i, и ее лишь отдаленное родство с Азиатским золотистым котом, i iii . Филогенетический подход был также применен для установления таксономического статуса редкого горного андского кота, i i, и других мелких кошачьих Центральной и Южной Америки это дало стимул и основу для будущих мер по охране этих животных . Молекулярнофилогенетический подход позволил разрешить таксономические отношения среди медвежьих, включая гигантскую панду, а также продемонстрировал важность генетического анализа в сохранении и управлении популяциями бурого медведя, i , i . i, . Филогеографический подход применялся для изучения многих других видов, находящихся на грани исчезновения, включая орангутанга, i . ii vi , , гаттерии . Одним из достижений использования молекулярногенетических маркеров и филогенетического анализа явилось признание естественных гибридов и важность их охраны. Гибридизация становится одним из наиболее важных аспектов рассмотрения в политике сохранения некоторых видов i , . Особенно это касается видов семейства собачьих, где межвидовая гибридизация является естественным процессом. И хотя для некоторых исчезающих видов естественная гибридизация до сих пор рассматривается как главная угроза генетической целостности например, для таких как, эфиопский волк, i ii i . i i . i , являющийся естественным гибридом серого волка, С. . . i, , уже вовлечены в программы по сохранению и реинтродукции на СевероАмериканском континенте , .