Таксономические критерии в систематике морских аэробных протеобактерий

• Автор: Горшкова, Наталья Михайловна
• Шифр специальности: 03.00.07
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2000
• Место защиты: Владивосток
• Количество страниц: 123 с. : ил.

1.1. МОРСКИЕ АЭРОБНЫЕ ПРОТЕОБАКТЕРИИ

1.2. ИСПОЛЬЗОВАНИЕ МЕТОДОВ НУМЕРИЧЕСКОЙ ТАКСОНОМИИ

ПРИ ПЕРВИЧНОЙ КЛАССИФИКАЦИИ ПРИРОДНЫХ ИЗОЛЯТОВ

1.2.1. НУМЕРИЧЕСКАЯ ТАКСОНОМИЯ

1.2.2. ПОСТРОЕНИЕ ФЕНОНОВ

1.3. ИСПОЛЬЗОВАНИЕ ЧУВСТВИТЕЛЬНОСТИ К АНТИБИОТИКАМ

В ТАКСОНОМИИ

1.4. ХАРАКТЕРИСТИКА ВАЖНЕЙШИХ ХЕМОТАКСОНОМИЧЕСКИХ МАРКРОВ

1.4.1. КЛЕТОЧНЫЕ ФОСФОЛИПИДЫ

1.4.2. СОСТАВ КЛЕТОЧНЫХ ЖИРНЫХ КИСЛОТ

1.4.3. УГЛЕВОДСОДЕРЖАЩИЕ БИОПОЛИМЕРЫ МИКРООРГАНИЗМОВ

1.4.3.1. Капсульные полисахариды
1.4.3.2. Участие микроорганизмов в детоксикации потенциально опасных
ионов тяжлых металлов
1.4.5. ИЗОПРЕНОИДНЫЕ ХИНОНЫ
1.4.6. ПОЛИАМИНЫ ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ
ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ
1.2. ОБЪЕКТЫ ИССЛЕДОВАНИЯ
2.2. УСЛОВИЯ ВЫДЕЛЕНИЯ, КУЛЬТИВИРОВАНИЯ И КОНСЕРВАЦИИ
2.3. МЕТОДЫ ИЗУЧЕНИЯ ФИЗИОЛОГОБИОХИМИЧЕСКИХ СВОЙСТВ БАКТЕРИЙ
2.4. КЛАСТЕРНЫЙ АНАЛИЗ
2.5. ОПРЕДЕЛЕНИЕ ФОСФОЛИПИДНОГО СОСТАВА
2.6. ОПРЕДЕЛЕНИЕ СОДЕРЖАНИЯ КЛЕТОЧНЫХ ЖИРНЫХ КИСЛОТ
2.7. БЫСТРЫЙ МЕТОД ВЫДЕЛЕНИЯ ПОЛИСАХАРИДНЫХ ФРАКЦИЙ
ГЛАВА 3. ИДЕНТИФИКАЦИЯ МОРСКИХ АЭРОБНЫХ ПРОТЕОБАКТЕРИЙ С ФОРМИРОВАНИЕМ ФЕНОНОВ НА ОСНОВЕ КЛАСТЕРНОГО АНАЛИЗА
ГЛАВА 4. ЧУВСТВИТЕЛЬНОСТЬ К АНТИБИОТИКАМ БАКТЕРИЙ РОДА АЬТЕЯОМОМАЗ И РОДСТВЕННЫХ ИМ ТАКСОНОВ
ГЛАВА 5. ОСОБЕННОСТИ ФОСФОЛИПИДНОГО СОСТАВА МОРСКИХ ПРОТЕОБАКТЕРИЙ РОДОВ РЯЕиГЮАЬТЕЯОМОЕАЗ, АГГЕЯОМОШЕИ
МЛЯМОМОМЛЗ
ГЛАВА 6. ЖИРНЫЕ КИСЛОТЫ КАК ХЕМОГАКСОНОМИЧЕСКИЕ
МАРКРЫ
ГЛАВА 7. РАЗНООБРАЗИЕ СТРОЕНИЯ УГЛЕВОДСОДЕРЖАЩИХ БИОПОЛИМЕРОВ МОРСКИХ АЭРОБНЫХ ПРОТЕОБАКТЕРИЙ
7.1. Особенности углеводсодержащих биополимеров бактерий родоБ 5еи1оаНеготопа и Маппотопаз
7.2. Влияние содержания некоторых углеводов в питательной среде
на синтез полисахаридов
7.3. Структурное разнообразие углсводсодержащих биополимеров ГЛАВА 8. ТОЛЕРАНТНОСТЬ К СОЛЯМ МЕТАЛЛОВ БАКТЕРИЙ
РОДОВ РЭЕIIБОАЬТЕЯОМОНА5 И АПЕИОМОШВ
ВЫВОДЫ
СПИСОК ЦИТИРОВАННОЙ ЛИТЕРАТУРЫ


Выявление толерантности бактерий родов и к ионам потенциально опасных металлов. Научная новизна н теоретическая значимость. Впервые показано также, что чувствительность к антибиотикам может служить наджным дополнительным таксономическим критерием для дифференцировки фенотипически сходных морских аэробных нротеобактерий. Практическая значимость. Подученные результаты представляют интерес при разработке тестов полифазной таксономии, для Коллекций культур микроорганизмов, а также для выяснения экологических свойств и биотехнологического потенциала изученных бактерий. Использование методов н ум ери ческой таксономии позволяет идентифицировать морские аэробные протеобакгерии до уровня рода. Фенотипически сходные бактерии родов , , i различаются по чувствительности к антибиотикам, которая может использоваться как дополнительный таксономический критерий. Состав клеточных фосфолипидов характеристичен для каждого рода морских протеобактсрий. Клеточные жирные кислоты являются одним из наджных хемотаксономичсских маркров грамотрицательных аэробных нротеобактерий. Полисахариды морских аэробных прогеобактерий отличаются структурным разнообразием даже среди штаммов одного вида. Их использование в систематике морских аэробных протеобакгерии офаничено. Апробация работы. Всесоюзной конференции по химии и биохимии углеводов Тбилиси, Ii i . Viv, i, . Ii . Ii i ii I7 , i, . Ii i ii I8 ix, , . Публикации. Материалы диссертации изложены в печатных работах, опубликованных в журналах Микробиология, Биоорганичсская химия, Ii i i, . Автор выражает глубокую признательность своему руководителю д. Е.П. Ивановой. Автор благодарит академика Г. Б. Елякова, чл. РАН В. А. Стоника, зав. ТИБОХ ДВО РАН д. В.В. Михайлова за всестороннюю поддержку исследований. Автор благодарит также своих соавторов сотрудников лаборатории микробиологии, лаборатории химии углеводов к. I. Назаренко, к. Р.П. Горшкову, к. В.А. Зубкова, к. И.Н. Красикову, лаборатории химии ферментов к. И.Ю. Бакунину, к. В.В. Сову, сотрудников лаборатории сравнительной биохимии Института биологии моря ДВО РАН д. В.И. Светашсва, к. М.В. Высоцкого, к. Н.В. Жукову, а также зарубежных коллег. ГЛАВА 1. Морские грамотрицательные гетеротрофные аэробные бактерии с полярным жгутикованием представляют собой многообразную группу бактерий, происходящую от общего предка, которая охватывает микроорганизмы с различными свойствами. Эта таксономическая группа составляет отдельную филогенетическую линию отдела i класса i , , . Последний в свою очередь состоит из нескольких основных рРНК подклассов а, , 7 и 8 , x, . Интересующие нас аэробные микроорганизмы входят в уподкласс класса i включающий несколько таксонов морских бактерий семейство и роды , , i, Iii, i, i и ii рис. Далее следует краткое таксономическое описание некоторых родов морских аэробных протеобактерий с полярным жгутикованием, представители которых явились предметом настоящего исследования. Род , , . Грамотрицательные прямые палочковидные клетки 0,,3 мкм в диаметре и мкм в длину. Подвижные с помощью одного полярного неочехлнного жгутика. Vii i 5 i . Таксономическая структура класса ii. Дснлро рамма построена на основании iii анализов. К7 был выбран как . Цифры показывают значения анализов, подтверждающих топологию дендрограммы. Масштаб 0. Не обладают люминесценцией и не образуют пигменты. Строгие аэробы. Хсмоорганогетеротрофы с дыхательным типом метаболизма. Оксидазоположительны. Оптимальная температура роста в пределах С, не растут при 4 С. Не обладают способностью к денитрификации. Не имеют агринин дегидролазы. Не аккумулируют полиРоксибутират. Не требуют для роста дополнительных органических факторов. Растут на средах, содержащих морскую воду или ионы натрия. Род состоит из единственного валидно описанного вида ii. Характеристика вида соответствует описанию рода и включает следующие свойства. Бактерии продуцируют амилазу, желатиназу, липазу, не продуцируют хитиназу. Фенотипически . Бактерии утилизируют из органических соединений i . Содержание ГЦ в ДНК ,9,4 моль . Типовой штамм . АТСС 6. Род i, i, i .