Сравнительный анализ структуры дрожжевых сообществ в березняках Европейской части России и Западной Сибири

• Автор: Юрков, Андрей Михайлович
• Шифр специальности: 03.00.07
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2005
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 168 с. : ил.

ОГЛАВЛЕНИЕ
ф Введение

Обзор литературы

Экологогеографическое направление в почвенной

микробиологии

Вертикальноярусный подход

Географические закономерности распространения дрожжей

Широтнозональные закономерности

Региональные различия дрожжевого населения

Географическое распространение разновидностей i

Внутривидовая генетическая вариабельность дрожжей и ее связь с географическим распространением
I x

i i
Диморфные грибы рода i
Аскомицетовые дрожжи, выделенные из молочного производства
Дрожжи родов i
Сравнительный анализ диких и культурных дрож
ф жей рода v
Объекты и методы исследования
Объекты и регионы исследования
Методы посева, учета и идентификации
Фенотипическая идентификация
Приготовление сред на ассимиляцию ароматических соединений и алдаровых кислот
Ф Тесты на скрещивание
Генетическая идентификация
Выделение ДНК
Амплификация фрагментов ДНК
ф Проведение рестрикционного анализа
Кариотипирование
ПЦР с неспецифичными праймерами
Обработка изображений гелей
Генетическая идентификация
Определение нуклеотидных последовательностей
Таксономическая структура дрожжевого населения березняков
Фенотипическая структура дрожжевых сообществ
Общая численность
Разнообразие дрожжей
Таксономическая структура
Доминирующие виды
Различия в относительном обилии стенобионтных
и индикаторных видов
Ординация дрожжевого населения березняков .
Популяционногенетическое исследование дрожжей
Аскомицетовые дрожжи
Базидиомицетовые дрожжи
ii
i
Фенотипический вид
Анаморфные базидиомицетовые дрожжи рода

Филобазидиевые криптококки
i .
Дрожжи фенотипического вида
i
Дрожжи фенотипического вида
i
Тремелловые криптококки
i
Дрожжи фенотипического вида
ii
,
,
,
,
Исследование структуры дрожжевых сообществ на основании данных молекулярной идентификации
Некоторые таксономические исследования
Виды близкие к i
Асиимиляционные спектры недавно описанных Тремелловых криптококков
Физиологический спектр дрожжей вида
vii
Сравнение физиологических свойств видов .vii, . и .i Сравнение физиологических свойств видов . и .ii
Первое выделение дрожжей
x в Западной Сибири
Идентификация дрожжей . Идентификация несовершенных аскомицетовых дрожжей i .
Заключение
Список литературы


Одним из таких новых подходов в изучении географического распространения микроорганизмов стал вертикальноярусный подход, сформировавшийся на кафедре биологии почв МГУ Чернов, . Вертикальноярусный подход к изучению структуры микробных сообществ заключается в одновременном исследовании микробных комплексов в пределах всех ярусов биогеоценоза надземном филлоплана древесных и травянистых растений, наземном опад, подстилка, моховой и лишайниковый покров, почвенном включая все генетические горизонты. Основанием подобного подхода является соображение о том, что растительные сообщества, благодаря своей вертикальноярусной организации, определяют в целом пространственную организацию микробных сообществ в биогеоценозе. Вертикальноярусный подход сформировался на кафедре биологии почв при исследовании закономерностей распределения почвенных дрожжей. Систематические исследования, начатые И. П.Бабьевой и И. С.Решетовой в конце х гг. Бабьева, . Об этом говорили такие свойства многих видов, как интенсивная пигментация колоний, формирование активно отстреливающихся баллистоспор, ярко выраженная сахаролитическая стратегия, проявляющаяся в активной ассимиляции простых сахаров и отсутствии мощной гидролитической ферментной системы. Такие виды, часто преобладающие в дрожжевом населении почвы, явно попадали в почву с растительным опадом Бабьева, . Поэтому уже в начале х годов были предприняты первые попытки выйти за пределы собственно почвенных исследований и, одновременно с почвой, изучать дрожжевое население различных частей растений и растительные остатки для получения более глубоких представлений о закономерностях формирования природных сообществ дрожжевых грибов Бабьева и др. Эти исследования положили начало циклу работ по сравнительному изучению распространения дрожжей, рассматриваемых в масштабе целых биогеоценозов, включая почву и надземные растительные субстраты пространственносукцессионные ряды. С этих позиций были изучены биогеоценозы всех зон от тундры до пустыни Бабьева, . Вертикальноярусный подход был применен для изучения не только дрожжевых грибов, но и других групп микроорганизмов. С позиций этого подхода проводились сравнительногеографические исследования бактериальных сообществ Лысак, Добровольская, Черняковская и др. Головченко и др. Добровольская и др. Это же направление прослеживается в работах, посвященных изучению актиномицетных комплексов в биогеоценозах различных природных зон Зенова, Зенова, Звягинцев, Зенова и др. Мирчинк, Бабьева, . Стратиграфический анализ микробных сообществ в разных типах биомов позволил выявить ряд закономерностей в пространственной организации микробных комплексов Бабьева, а Звягинцев и др. С позиций вертикальноярусного подхода удалось установить также ряд закономерностей в географическом распределении микробных сообществ, рассматриваемых в масштабе всего биогеоценоза. Наиболее изученными в этом плане оказались дрожжевые грибы Чернов, . Дрожжевые грибы являются удобным объектом для сравнительногеографических исследований. Дрожжи сравнительно легко выделять и учитывать на твердых средах. Кроме того, они образуют экологически компактную группу микроорганизмов, со сравнительно устоявшейся таксономией. Все это способствовало тому, что дрожжи стали одной из наиболее изученных групп микроорганизмов в плане особенностей их географического распространения. Дрожжевые грибы типичные сахаролитики, и самые первые исследования дрожжей ограничивались теми видами, которые вызывали брожение при приготовлении пива и вина. Однако уже в конце XIX в. Естественно, возник вопрос об источниках их попадания в бродящие субстраты. Первые работы, в том числе выполненные классиками зимологии Э. Хансеном и А. Клекером, были, в основном, посвящены именно этой теме поиску природных источников винных дрожжей. Внимание было обращено на почву, как возможный источник диких дрожжей. Долгое время сведения о нахождении в почве дрожжей были отрывочными. Однако по мере накопления данных стали складываться представления о дрожжах, как о таких же обитателях почв, как бактерии и мицелиальные грибы.