Персистенция патогенных микоплазм и ее молекулярно-генетические механизмы

• Автор: Зигангирова, Наиля Ахатовна
• Шифр специальности: 03.00.07, 03.00.15
• Научная степень: Докторская
• Год защиты: 2001
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 205 с. : ил

ОГЛАВЛЕНИЕ
ВВЕДЕНИЕ.

ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.

Глава 1. Роль микоплазм в инфекционном патологии

человека.

1.1. Молекулярнобиологические особенности микоплазм

1.2. Факторы патогенности микоплазм.

Глава 2. Механизмы персистенции микоплазм

2.1. Биологические особенности микоплазм, способствующие персистенции

2.2. Взаимодействие микоплазм с иммунной

системой макроорганизма.

2.3. Генетически детерминированная
антигенная изменчивость.
СОБСТВЕННЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ.
Глава 3. Материалы и методы
Глава 4. Создание методической базы для изучения дифференциальной активности генов у
патогенных микоплазм.
4.1. Создание модели респираторного микоплазмоза
у экспериментальных животных для изучения острой и персистентной инфекции.
4.2. Разработка модельных систем для изучения молекулярногенетических механизмов персистенции М.i.
4.3. Разработка методов для выявления дифференциальной экспрессии
генов микоплазм.
Глава 5. Идентификация генов М.i., дифференциально экспрессирующихся на различных стадиях перехода микоплазм в псрсистирующее состояние
5.1. Анализ активности генов М.рпеитоп те при разных формах инфекционного процесса методом молекулярного портрета
5.2. Ген, кодирующий синтез фактора патогенности
и основной антигенной детерминанты
5.3. Ген рибосомной РНК.
5.4. Ген, кодирующий синтез фермента участвующего
в процессах метилирования ДНК.
5.5. Ген, кодирущий фермент I
фосфотрансферазной системы
5.6. Ген, кодирующий синтез липопротеина
5.7. Ген, кодирующий синтез нейраминидазы.
5.8. Гсн, кодирующий белокшаперон
Глава 6. Изучение организации и экспрессии гена,
детерминирующего синтез белка адгезии Р
6.1. Экспрессия гена, кодирующего синтез белка Р1,
при острой форме инфекции
6.2. Экспрессия гена, кодирующего синтез белка Р1,
при персистентной инфекции
6.3. Выявление белка, связывающегося с ДНК М.рпеитотае и ответственного за подавление экспрессии гена, кодирующего синтез белка Р1, при персистентной инфекции
6.4. Картирование мест связывания белка с ДНК М.рпеитотае
6.5. Действие факторов биологической и физикохимической природы на экспрессию гена, кодирующего
синтез белка Р1.
Глава 7. Разработка молекулярногенетических методов
выявления персистирующих микоплазм
7.1. Применение ПЦР для диагностики острой и хронической формы респираторного микоплазмоза
7.2. Диагностика урогенитальных микоплазмозов
7.3. Сравнительная оценка микробиологического, иммунологическою и молекулярнобиологического методов диагностики урогенитальных микоплазмозов.
Глава 8. Изучение патогенеза хронических
микоплазмозов с помощью молекулярнобиологических методов
Глава 9. Разработка молекулярногенетических методов для определения антибиотикорезистентных штаммов микоплазм
9.1. Выявление генов устойчивости к тетрациклину у клинических изолятов микоплазм и изучение закономерностей их наследования.
9.2. Изучение генетических механизмов устойчивости к эритромицину у клинических изолятов уреаплазм
и разработка методов их выявления
Глава . Обсуждение результатов.
ВЫВОДЫ.
СПИСОК ЦИТИРОВАННОЙ ЛИТЕРАТУРЫ


Представители этого класса очень широко распространены в природе как паразиты человека, млекопитающих, птиц, рептилий, рыб, насекомых и растений что свидетельствует в пользу успешности этой группы микроорганизмов в эволюционном отношении 8. К настоящему времени охарактеризовано более 0 видов микоплазм, что однако, по общему мнению микоплазмологов, составляет лишь меньшую часть всех существующих в природе микоплазм, а вероятность открытия новых видов определяется лишь желанием и возможностями исследователей 0 . Сравнительный анализ геномов некоторых микоплазм и других бактерий дал возможность на генетическом уровне подтвердить гипотезу о том, что микоплазмы являются эволюционной ветвью грамположительных бактерий, образовавшейся в результате редукции генома. Вследствие этого процесса микоплазмы утратили значительную часть бактериальной хромосомы, но сохранили гены, необходимые для поддержания жизнеспособности , 8. Определение полной нуклеотидной последовательности геномов некоторых микоплазм, . М.рпеитотае, . Таблица I. Некот. Неидент. Такая рациональная структура генома, иллюстрирующая крайнюю степень экономии генетического материала, привела к полной зависимости микоплазм от внешних источников питательных веществ, таких как предшественники аминокислот, нуклеотиды, жирные кислоты и стеролы. Это в свою очередь вызвало необходимость адаптации к паразитическому способу существования 8. Действительно, микоплазмы являются мембранными или в некоторых случаях . Микоплазмы, тем не менее, удается культивировать и в условиях i vi , но в обогащенных, содержащих сыворотку крови средах. При этом культивировать в лабораторных условиях . Описаны лишь единичные случаи выделения . Таким образом, наблюдаемая у микоплазм критическая редукция генома может быть оправдана лишь в условиях паразитического способа существования. Определение полной нуклеотидной последовательности у . М.i позволило провести сравнительный анализ структуры генома этих двух видов микоплазм , 8. Геном . Он представляет собой наименьший из известных в настоящее время бактериальных геномов Табл. Исследование дополнительной генетической информации, содержащейся в геноме М. Так, все открытые рамки считывания . М.i. Геном этих 2х микоплазм можно разделить на 6 сегментов, при этом расположение ортологических генов в пределах сегментов строго консервативно, а порядок распределения сегментов в двух сравниваемых геномах отличается. Предполагается, что эти различия возникли в результате транслокации без изменения ориентации фрагментов относительно направления транскрипции, совпадающей в обоих геномах с направлением репликации . Дополнительные 6 тыс. Наиболее ярким примером этой группы генов могут служить гены, кодирующие синтез липопротеинов. Так, у . Таблица 2. Основные свойства геномов некоторых микроорганизмов. Свойства . М. i М. Сравнительный анализ геномов двух видов микоплазм выявил сходство в структуре и количестве генов, вовлеченных в обеспечение базисных процессов жизнедеятельности клетки таких, как репликация ДНК, транскрипция, трансляция, регуляция генной экспрессии, транспорт белков и накопление энергии. Это свидетельствует о том, что в эволюции микоплазм произошла редукция генома до крайне допустимых минимальных его размеров, дальнейшее сокращение числа генов может быть неблагоприятным для клетки. Па диаграммах рис. М.i и . На оси ординат указано абсолютное число генов, а цифра над столбиком означает отношение этих генов к общему числу идентифицированных генов у этих микроорганизмов. В геноме . Все эти вещества микоплазмы получают от хозяина. Геном микоплазм содержит минимальный набор генов, обеспечивающих клеточные процессы, энергетический метаболизм, транспорт, а также очень незначительное число генов, кодирующих белки с регуляторными функциями. Иная ситуация наблюдается с генами, существенными для репликации, транскрипции и трансляции. Несмотря на то, что абсолютное число этих генов у микоплазм меньше, чем у i i , их процентное содержание в геноме выше, что свидетельствует о том, что эти гены существенны для жизнеспособности и их редукция происходила более ограниченно.