Молекулярно-генетическое изучение клинических штаммов Mycobacterium Tuberculosis

• Автор: Иванов, Иван Юрьевич
• Шифр специальности: 03.00.07
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2004
• Место защиты: Оболенск
• Количество страниц: 105 с. : ил.

ОГЛАВЛЕНИЕ

Список сокращений

ВВЕДЕНИЕ.

Глава I. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1.Эпидемическая ситуация по заболеваемости

туберкулзом за рубежом и в России.

1.2. Молекулярногенетические методы применяемые

при исследованиях эпидемиологии туберкулза.

СОБСТВЕННЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ Глава 2. МАТЕРИ АЛЫ И МЕТОДЫ

2.1. Бактериальные штаммы.

2.2. Микробиологические методы

2.2.1. Бактериоскопический метод
2.2.2. Культуральный метод
2.2.3. Рост на среде с салициловокислым натрием
2.3. Биохимические методы.
.1. Ниациновый тест.
2.3.2. Определение каталазной активности
2 Определение термостабильности каталазы
2.4. Определение чувствительности к противоту беркулзным
препаратам методом абсолютных концентраций на плотных средах.
2.5. Молекулярногенетические методы типирования.
2.5.1. Метод ЯРЫМ
2.5.2. Метод 1Ш.РРСК
2.5.3. Метод сполиготипирования.
2.5.4. Метод V
2.5.5 Статистические методы.
Глава 3. РЕЗУЛЬТАТЫ.
3.1. Характеристика штаммов М. i, выделенных из образцов мокроты, полученных от заключнных
больных ту беркулзом в тюрьме г. Серпу хова Московская область.
3.2. Характеристика штаммов М. i, выделенных из образцов мокроты, полученных от заключнных
больных туберкулезом в тюрьме пос. Озерки Тульская область
3.3. Характеристика штаммов М. i, выделенных из образцов мокроты, полученных от населения
больного туберкулзом г. Тула.
3.4. Характеристика штаммов М. i, выделенных из образцов мокроты, полученных от населения
больного туберкулзом г. Калуга.
3.5. Характеристика штаммов М. i, выделенных из образцов мокроты, полученных от населения
больного ту беркулзом г. Нижний Новгород.
3.6. Характеристика штаммов М. i 1 семейства I
Глава 4. ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ.
4.1. Сравнительный анализ частоты встречаемости штаммов М. i разных генотипов, полученных от больных заключнных
тюрем г. Серпухов н пос. Озерки Тульская область
4.2. Сравнительный анализ частоты встречаемости штаммов М. i разных генотипов, полученных от больных Тулы и заключнных
тюрьмы пос. Озерки.
4.3. Сравнительный анализ частоты встречаемости штаммов М. i разных генотипов, полученных от больных Тулы, Калуги и
Нижнего Новгорода
4.4. Сравнительный анализ частоты встречаемости штаммов М. i разных генотипов, полученных от больных Дзержинского и
Павловского районов Нижнего Новгорода8Э
ЕЫЗОДЫ.
Список литерату


буфер, содержащий 0,3 , ЗМ I. i0228x22. стрептомицин. V vi метод дифференцирования штаммов по вариабельному число парных повторов. ВВЕДЕНИЕ. Туберкулз остатся одним из наиболее распространнных и опасных заболеваний человека. Возбудителем туберкулза инфицировано около трети 2 млрд. Тяжлое положение, связанное с ростом заболеваемости туберкулзом, наблюдается в последние годы и в России. По данным литературы, заболеваемость им возросла с в г. ООО населения и ситуация продолжает ухудшаться ,6. В сложившейся ситуации для эффективного осуществления эпидемического анализа необходимы данные по идентификации и дифференциации клинических штаммов М. Они позволяют быстро установить источник инфекции, пути передачи возбудителя инфекции и ареал его распространения . К настоящему времени по рекомендации ВОЗ за рубежом на основании результатов, полученных с применением молекулярногенетических методов типирования клинических штаммов микобактерий, создатся база данных, содержащих результаты I6 и сполиготипирования 1. На данный момент опубликовано большое количество работ по молекулярногенетическому типированию штаммов М. В то же время в России такие работы только начинаются. Данные по молекулярногенетическому типированию штаммов Л, i получены лишь для некоторых регионов РФ 7, , 8. Кроме этих исследований было проведено совместное исследование Центральным НИИ туберкулза РАМН с I , . .. России . Для такой большой по территории и численности населения страны как Россия этого явно недостаточно. Таким образом, молекулярногенетические исследования штаммов М i в России находятся на начальных этапах развития. Цель исследования. Определить спектр клинических штаммов i i, циркулирующих среди больных туберкулзом в средней полосе Европейской части России. Охарактеризовать штаммы М. I, и V. Определить генетические различия между штаммами М. Тулы, Калуги, Нижнего Новгорода и от заключнных больных тюрем г. Серпухова Московская область и пос. Озерки Тульская область. Создать коллекцию клинических штаммов М. Научная новизна. С помощью современных методов выявлен спектр штаммов М. Тула, Калуга, Нижний Новгород и среди заключнных больных в тюрьмах г. Серпухова и пос. Озерки. Охарактеризован новый генотип клинических штаммов М. I. Показано его широкое распространение среди больных, проживающих на изученных территориях. Выяснено, что среди изолятов генотипа I преобладают штаммы, устойчивые к лекарственным препаратам. Выявлена низкая степень кластеризации штаммов М. Это свидетельствует о том, что в исследованных группах больных имеет место реактивация эндогенной инфекции. Практическое значение работы. Сформирована коллекция, состоящая из 7 штаммов М. Создана компьютерная база данных, содержащая информацию о микробиологических свойствах, лекарственной устойчивости и принадлежности штаммов М. Получен акт от декабря г. Федерального государственного унитарного предприятия Государственный научный центр прикладной микробиологии Минздрава Российской Федерации. Генотипирование штаммов М. Федерального государственного унитарного предприятия Государственный научный центр прикладной микробиологии Минздрава Российской Федерации. Среди больных туберкулзом городов Тулы, Калуги, Нижнего Новгорода и среди заключнных больных г. Серпухова и пос. Озерки преобладают штаммы М. и I. Штаммы генотипа I обладают следующими характеристиками сполиготип , I профиль содержит характерный нарор из рестрикционных фрагментов молекулярной массой от до 0 пар нуклеотидных оснований, и локусы А, В, С, , Е и содержат по 2 тандемных повтора. Лекарственной устойчивостью к пяти , I, I, , ЕМВ противотуберкулзным препаратам первого ряда обладают ,0 клинических штаммов охарактеризованного генотипа I. Множественную лекарственную устойчивость проявляют ,0 клинических штаммов этого генотипа.