Диазотрофы содовых солончаков

• Автор: Сорокин, Иван Дмитриевич
• Шифр специальности: 03.00.07
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2008
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 97 с. : ил.

Оглавление
ВВЕДШИЕ.4

1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.8

1.1. Общие сведения о почвах содового засоления.8

1.2. Значение биологической фиксации атмосферного азота.

1.3. Общие сведения об азотфиксации.

1.4. Влияние солей и щелочности на активность азотфиксации АА в природных местообитаниях

1.5. Влияние ионов натрия на А А чистых культур.

1.6. Галотолерантные и галофильные свободноживущие диазотрофы из

засоленных почв.

1.7. Азотфиксирующие бактерии соленых водоемов

1.8. Микробные сообщества содовых озер и сведения о гапоалкалофильных диазотрофах.
1.9. Механизмы адаптации бактерий к галоалкалофильным условиям.
1 Гены нитрогеназного комплекса.
1 Применение методов молекулярной экологии для изучения диазотрофии
2. ОБЪЕКТЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ
2.1. Объекты исследования.
2.2. Определение химических параметров почвенных образцов.
2.3. Измерение потенциальной АА ацетиленовым методом
2.4. Получение накопительных и чистых культур галоалкалофильных
диазотрофов.
2.5. Фенотипическая характеристикачистых культур.т.
2.6. Эксперименты с клеточными суспензиями
2.7. Молекулярнобиологические методы.
2.8. Аналитические метода.
3. РЕЗУЛЬТАТЫ.
3.1. Потенциальная АА содовых солончаков различных регионов.
3.2. Влияние различных факторов на потенциальную АА природной диазотрофной популяции содовых солончаков
3.3. Получение диазотрофных накопительных культур из образцов содовых солончаков .
3.4. Определение состава диазотрофных накопительных культур
3.5. Выделение чистых культур анаэробных диазотрофных галоалкало
филов из накопительных культур.
3.6. Идентификация диазотрофов из содовых солончаков
3.7. Характеристика чистых культур диазотрофных алкалофилов
3.7.1. Отношение к кислороду и сероводороду
3.7.2. Продукты брожения и метаболический профиль
3.7.3. Влияние и солей на рост.
3.7.4. Диазотрофная активность и влияние на нее и солей
3.7.5. Описание новых таксонов диазотрофных галоалкалофилов, выделенных из содовых солончаков
3.8. Детекция тНв чистых и накопительных культурах диазотрофов из
содовых солончаков и у референтных культур
3.8.1. Чистые культуры
3.8.2. Клонирование фрагмента гена тН в микроаэрофильных накопительных культурах из содовых солончаков
Список литературы


С помощью культуральных и молекулярных методов установлено преобладание в диазотрофных накопительных культурах, выделенных при , грамположительных бактерий с низким ГЦ, относящихся к бациллам и сульфидогенным клостридиям. Из содовых солончаков Центральной Азии и Египта выделены чистых культур галоалкалофильных азотфиксирующих бацилл РНК групп 1 и 6, в которых АФ не была известна. На основании физиологических и филогенетических признаков восемь изолятов описывается как новый род и новый вид i iix, два изолята классифицированы как новый вид ii ii и один изолят как новый вид i iii. Все выделенные чистые культуры являются облигатными бродильщиками, рост и АФ активность которых возможны только в щелочных условиях с оптимумом 9. АФ активность клеток подавлялась уже умеренными концентрациями солей натрия 2 М . Практическая значимость. Полученные данные свидетельствуют о том, что, при наличии благоприятных условий увлажнение и частичное рассоление содовые солончаки могут осуществлять одну из важнейших функций плодородных поте фиксацию атмосферного азота. Апробация, работы. Материалы диссертации доложены и обсуждены на следующих конференциях Всероссийская молодежная школаконференция Актуальные аспекты современной микробиологии , Москва, Россия III Международная молодежная школаконференция Актуальные аспекты современной микробиологии , Москва, Россия Ii vi, Ii i ii ii, , Севилья, Испания. Публикации. Основные материалы, обсуждаемые в диссертации, содержатся в 2 статьях и 3 тезисах конференций. Объем и структура диссертации. Диссертация состоит из введения, описания методов и объектов, экспериментальной части, выводов и списка литературы. Текст включает страниц, таблиц, рисунка список литературы включает 8 наименований, из них на русском и 5 на английском языке. Место проведения работы и сотрудничество. Микробиологическая часть работы выполнялась в Институте микробиологии им. С.Н. Виноградского РАН под руководством к. И.К. Кравченко. Молекулярнобиологическая часть работы выполнена в Центре Биоинженерия РАН при содействии к. Е.С. Булыгиной. Образцы содовых солончаков были собраны как в ходе собственной экспедиции в Кулундинскую степь, так и предоставлены д. Д.Ю. Сорокиным. Молекулярный анализ гена i был выполнен в сотрудничестве с к. Е.С. Булыгиной и асп. Е.В. Задориной, сиквенсанализ генов с к. Т.В. Колгановой. Филогенетический анализ был выполнен к. Т.П. Туроиой, ДНКДНК гибридизация к. А.М. Лысенко, анализ жирных кислот д. Г.А. Осиповым. Автор выражает глубокую благодарность всем упомянутым участникам данной работы. Сорокин И. Д., Кравченко И. К. Оценка потенциальной азотфиксирующей активности в почвах содового засоления Агрохимия. С. . I. . i, I. К. v, Т. . v, Т. V. v, Е. . i . . i i iii . i iI v ii . I. . i, I. . v, . V. , Т. V i . .,v . . i i ixi i i i. . . I. . i, I. . v, . . v, Т. V. v, . . i . . i i iix . ii i i i . I ii v iii . I. Сорокин И. Д., Дорошенко . ., Кравченко И. К. Азотфиксация в содовых солончаках. В сборнике Тезисы Всероссийской молодежной школыконференции Актуальные аспекты современной микробиологии. Москва Макс Пресс, . Сорокин И. Д. Диазотрофныс галоалкалофилы содовых солончаков. В сборнике III Международная молодежная школаконференция Актуальные аспекты современной микробиологии. Тсзисы. МоскваМакс Прссс. СЛ. i I. ., v I. К., . V., i . . i . . i ixi i i. Ii vi, Ii i ii ii, vi, i, v1 . .