Изучение механизма распознавания в клетках растений мРНК с преждевременным стоп-кодоном

• Автор: Шварц, Антон Маркович
• Шифр специальности: 03.00.06
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2008
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 98 с. : ил.

СОДЕРЖАНИЕ

СПИСОК ИСПОЛЬЗУЕМЫХ СОКРАЩЕНИЙ

I. ВВЕДЕНИЕ.

II. ЛИТЕРАТУРНЫЙ ОБЗОР.

II. 1. Деградация мРНК с преждевременным стопкодоном

.7.1. Биологическое значение механизма .

II. 1.2. Механизм распознавания преждевременного стопкодна

II. 1.3. Уничтожение мРНК, в которой аппарат обнаружил преждевременный стопкодон.

.2. П0СТТРАНСКРИПДИПI УМОЛКАНИЕ ГЕНОВ ii ii,

.2.2. Индуцируемый РНК комплекс умолкания генов

II. 2.3. Системное умолкание генов.

II.2.4 РНКзависимое подавление транскрипции.
II. 2.5 Вирусные супрессоры У Г
.3.Взаимодействие механизмов и
III. МЕТОДЫ И МАТЕРИАЛЫ
III. 1. Реактивы.
1.2. Ферменты и наборы.
1.3. Полимеразная цепная реакция ПЦР.
1.4. Выделение и анализ плазмидной ДНК.
III. 4.1. Выделение плазмидной ДНК.
II 1.4.2. Электрофорез в агарозе.
III. 4.3. Рестрикция. Достраивание выступающих концов ДНК.
Дефосфорилирование вектора.
III. 4.4. Лигирование ДНК
1.5. Количественный анализ РНК из высечек листьев . i
7.5.7. Агроинфильтрация листьев . i
1.5.2. Выделение РНК.
III. 5.3. Нозернблот гибридизация.
III. 5.4. Изготовление одноцепочечного ДНК зонда.
III. 5.5. Получение кДНК из РНК
1.6. Получение генноинженерных конструкций.
7.6.7. Клонирование конструкций , 1, 0 и 5.
1.6.2. Клонирование конструкций , .
1.6.3. Клонирование конструкций X
III. 6.4. Создание конструкции и I.
II 1.6.5. Создание конструкции VX. и VX..
7.6.6. Клонирование конструкций 0рА и рА.
7.6.7. Создание конструкции 2, 2, 4X2 и 4X2.
1.6.8. Создание конструкции 2 и 2
VI. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЯ
VI. 1. Чужеродные нонсенсРНК деградируют в растительной клетке по
механизму ЫМЕ.
мРНК с длинными ЗНТО накапливаются с низкой эффективностью и
редко встречаются в растительных клетках.
У1.2. Деградация РНК с протяжнной ЗНТО, как и деградация нонсенс
РНК, зависит от е трансляции
У1.3. Вирусные субгеномные мРНК с протяженной ЗНТО не подвержены
ИМИ в растительной клетке
У1.4. В растениях, распознавание преждевременного стопкодона
определяется его отдаленностью от полиА хвоста мРНК.
У1.5. Связывание РАВР с аберрантой мРНК вблизи ПСК стабилизирует
матрицу.
У1.6. Белок томбусвирусов р, связывающий я1РНК не влияет на процесс
специфической деградации аберрантных мРНК в растениях
У 1.7. Деградация аберрантных мРНК не связана с образованием РНК.
VI.8. Деградация мРНК, обладающих длинной ЗНТО не вызывает
разрушение РНК сходной последовательности
V. ВЫВОДЫ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ


РНКзависимое подавление транскрипции. II. III. III. Реактивы. Ферменты и наборы. Полимеразная цепная реакция ПЦР. Выделение и анализ плазмидной ДНК. III. Выделение плазмидной ДНК. II 1. Электрофорез в агарозе. III. Рестрикция. Достраивание выступающих концов ДНК. Дефосфорилирование вектора. III. Количественный анализ РНК из высечек листьев . Агроинфильтрация листьев . Выделение РНК. III. Нозернблот гибридизация. III. Изготовление одноцепочечного ДНК зонда. III. Получение генноинженерных конструкций. Клонирование конструкций , 1, 0 и Клонирование конструкций , . III. Создание конструкции и I. II 1. Создание конструкции VX. и VX. . Клонирование конструкций 0рА и рА. Создание конструкции 2, 2, 4X2 и 4X2. VI. VI. ЫМЕ. У1. У1. У1. А хвоста мРНК. У1. У1. У 1. Деградация аберрантных мРНК не связана с образованием РНК. VI. транскрипционный промотор из вируса мозаики цветной капусты терминатор транскрипции из вируса мозаики цветной капусты Аргонавт ,, член группы белков, содержащих домены РНКсвязывающий домен и II, имеющий сходство с РНКазой И. ii , аденинуридин богатый элемент. Дайсср i, , у животных, или дайсероподобный белок ii, , у растений, мультидоменный фермент семейства РНКаз III разрезает днРНК или шпилечные структурированные РНКпредшественники, соответственно на i и i. i , эукариотический фактор терминации . , элемент расположенный после рамки трансляции , элемент, обнаружение которого после стопкодона позволяет определить этот стопкодон как преждевременный. I i i i, область внутренней посадки рибосом i i , РНК. микроРНК , нт днРНК с некомплементарными двумя 3 нуклеотидами, образующимися при нарезании клеточных шпилечных РНКпредшественников пнРНКпред. . Короткие интерферирующие РНК ii РНК, , пн днРНК с некомплементарными двумя 3 нуклеотидами, образующимися при нарезании длинных днРНК или структурированных однонитевых РНК. i i ii, супресорный белок, обладающий морфогенетическим эффектом на половые органы. i i, i, действующие i , i, которая подобно i ПС вступают в комплементарное взаимодействие с мР1 I другого локуса. V Vi или вирус карликовой кустистости томатов. 2 xii i i , 2 малый ядерный рибонуклеопротеид с молекулярной массой кДа, являющийся ауксилярным фактором. АКО 1аминоциклопропан1карбоксилат оксидазу. БОбелок оболочки вирусов ВТМ вирус табачной мозаики. ИВУГ или ВИУГ индуцируемое вирусом УГ, УГ, вызываемое реплицирующейся нуклеиновой кислотой. ИРКУГиндуцируемый РНК комплекс УГ РНКi ii x, I, РНП комплекс, содержащий Аргонавт, в котором происходит комплементарное взаимодействие одной из нитей i или i с мРНКмишенью, приводящее к ее разрушению или ингибированию ее трансляции. ИТУГиндуцирусмое трансгеном У Г, вызываемое нереплицирующейся нуклеиновой кислотой. ДНК ДНК, комплементарная матричной РНК гена. ВТМ или Vтобамовирус крестоцветных. РНКзависимая РНКполимераза РНК РНК, или , цитоплазматическая или вирусная РНКполимераза, обеспечивающая амплификацию сигнала УГ. РНКзависимое метилирование ДНК, одно из проявлений УГ в ядре, сопровождающееся метилированием цитозина ДНК в области нуклеотидной комплементарности РНКДНК. РНК вирусная субгеномная РНК. ТБ траспортный белок ВТМ. ТБГ тройной блок генов Хвируса картофеля ХВК. УГ умолкание ii генов, термин предложен биотехнологами растений для обозначения нуклеотидспецифического механизма регуляции транскриптома эукариот.