Выделение штаммов вируса гриппа А от диких птиц Чановской озерной системы и изучение молекулярно-генетических, антигенных и патогенных свойств этих штаммов

• Автор: Разумова, Юлия Владимировна
• Шифр специальности: 03.00.06
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2007
• Место защиты: Кольцово
• Количество страниц: 140 с. : ил.

СОДЕРЖАНИЕ

СПИСОК ИСПОЛЬЗОВАННЫХ СОКРАЩЕНИЙ.

ВВЕДЕНИЕ б

ГЛАВА 1.ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ .

1.1. Общие сведения о вирусе гриппа А

1.1.1. Таксономическая принадлежность,

классификация, номенклатура

1.1.2. Строение вириона

1.1.3. Структурнофункциональная организация генома

и вирусспецифические белки .

1.1.4. Цикл репродукции вируса .

1.1.5. Генетическая изменчивость вируса
1.2. Экология вируса гриппа А
1.2.1 Циркуляция вируса гриппа А в популяции людей
1.2.2 Циркуляция вируса гриппа А среди млекопитающих
1.2.3 Циркуляция вируса гриппа А среди птиц.
1.2.6 Межвидовая трансмиссия вируса гриппа А.
1.3. Циркуляция вируса гриппа А среди диких птиц .
1.3.1. Географические районы, в которых была
выявлена циркуляция вируса гриппа А среди диких птиц
1.3.2. Распространенность вируса гриппа А среди
диких птиц .
1.3.3. Циркуляция вариантов вируса гриппа А с подтипами гемагглютинина Н5 и Н7 среди диких птиц
1.3.4. Роль сезонных миграций водноболотных птиц в географическом распространении вируса гриппа А
1.3.5. Ключевые аспекты мониторинга и изучения вариантов вируса гриппа А, циркулирующих в популяциях диких птиц
ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
2.1. Сбор клоакальных мазков птиц
2.2. Выделение изолятов вируса гриппа А
СОДЕРЖАНИЕ
2.3. Реакция гемагглютинации .
2.4. Реакция торможения гемагглютинации
2.5. Определение патогенности штамма вируса гриппа А
2.6. Выделение геномных РНК вируса гриппа А .
2.7. Реакция обратной транскрипции .
2.8. Полимеразная цепная реакция.
2.9. Определение нуклеотидной последовательности ДНК
2 Анализ нуклеотидных последовательностей .
ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ
3.1. Выделение штаммов вируса гриппа А от диких птиц Чановской озерной системы .
3.2. Филогенетический анализ выделенных штаммов вируса гриппа А
3.2.1. Филогенетический анализ штаммов подтипа Н2
3.2.2. Филогенетический анализ штаммов подтипа ИЗ
3.2.3. Филогенетический анализ штаммов подтипа Н4
3.2.4. Филогенетический анализ штамма подтипа Н5 .
3.2.5. Сопоставление результатов филогенетического анализа с данными о миграциях птиц .
3.3. Изучение генетических, антигенных и патогенных свойств выделенного штамма вируса гриппа А подтипа Н5
3.3.1. Изучение генетических связей выделенного штамма с высокопатогенным генотипом 2 серотипа Н5Ы1 вируса гриппа А
СОДЕРЖАНИЕ
3.3.2. Анализ выведенной аминокислотной последовательности НА1 субъединицы гемагглютинина выделенного штамма .
3.3.3. Изучение патогенности выделенного штамма для птиц .
3.3.4. Изучение антигенной схожести выделенного
штамма с другими штаммами вируса гриппа А подтипа Н5
ЗАКЛЮЧЕНИЕ .
ВЫВОДЫ .
СПИСОК ИСПОЛЬЗОВАННЫХ ИСТОЧНИКОВ


Впервые выявлена циркуляция вируса гриппа А среди диких птиц на территории Чановской озерной системы. Получены данные о зараженности диких птиц рода речные утки , добытых на данной территории в период с последней декады августа по первую декаду сентября в и гг. От диких птиц, добытых на территории Чановской озерной системы, выделено оригинальных штаммов вируса гриппа А. Эти штаммы депонированы в коллекцию вирусов при ФГУН ГНЦ ВБ Вектор Роспотребнадзора. Государственную коллекцию вирусов РФ при Институте вирусологии им. Д. И. Ивановского. Выделенные штаммы могут быть использованы в диагностических целях в качестве антигенов и создания на их основе диагностических сывороток. Определены нуклеотидные последовательности гена НА всех выделенных в настоящей работе штаммов, а также генов РВ2, РВ1, , , М, штамма А 9. Установленные нуклеотидные последовательности гена НА депонированы в электронную международную базу данных нуклеотидные последовательности генов РВ2, РВ1, , , М, штамма 9ОЗ приведены в паспорте депонирования этого штамма в Коллекцию вирусов при ФГУН ГНЦ ВБ Вектор. Впервые определены филогенетические связи между вариантами вируса гриппа А, циркулировавшими в популяциях диких птиц на территории Чановской системы озер и в популяциях диких птиц других географических регионов. Полученные з настоящей работе данные о зараженности вирусом гриппа А диких птиц на Чановской озерной системы и данные филогенетического анализа штаммов вируса гриппа, выделенных от птиц на этой территории, могут быть использованы для прогнозирования эпизоотической ситуации по гриппу птиц. Проведено изучение генетических, антигенных и патогенных свойств штамма 9. Чановской озерной системы в период с последней декады августа по первую декаду сентября в гг. Н2, НЗ, Н4 и 53 вируса гриппа А, с преобладанием сероварианта НЗ, причем инфекция вирусом гриппа А в указанный период года охватывала популяции этих птиц в году и популяции этих птиц в . Варианты вируса гриппа А, циркулировавшие среди диких уток Чановской озерной системы в гг. А, циркулировавшим в среди диких уток в Европе и Южной Азии в гг. Ни по одному из генов он не относится к высокопатогенному генотипу Ъ серотипа Н5Ш. А, вызвавшему крупные эпизоотии гриппа в странах ЮгоВосточной Азии в гг. У1Р 0. Евразии в гг. Н5Ы1 генотипа г. Краснообск, г. Новосибирск, . Пятая межрегиональная научнопрактическая конференция с международны Актуальные проблемы здоровья населения Сибири гигиенические и эпидемиологические аспекты, Омск, . По материалам диссертации опубликовано три статьи из которых две в рецензируемом научном журнале. Во всех статьях соискатель является первым автором. Выражаю глубокую признательность следующим сотрудникам Института систематики и экологии животных СО РАН А. К. Юрлову и . . Друзяке за помощь при проведении исследования и ценные консультации. ГЛАВА 1. Таксономическая принадлежность, классификация, номенклатура. Вирус гриппа рода А Ivi А, далее вирус гриппа А, ВГ А принадлежит к семейству ортомиксовирусов xvii. Это оболочечный вирус с нуклеокапсидом спиральной симметрии. Штаммы вируса гриппа А классифицируют на подтипы на основании антигенных свойств двух поверхностных гликопротеинов вирусной частицы гемагглютинина НА и нейраминидазы . К настоящему моменту известны подтипов НА Н1Н и 9ти подтипов 1 9 вируса гриппа А i . . . , i . Антигенное описание подтипов НА и дается после в скобках. Например ivi 52. 6 51 , . Строение вириона. Липидный компонент оболочки вируса имеет клеточное происхождение. На поверности липидной оболочки присутствуют 2 вида шипиков диаметром нм , образованных гликопротеинами гемагглютинином НА и нейраминидазой , . Шипики 1го вида состоят из 3х молекул НА, которые организованы в палочкообразную структуру.