Компьютерное моделирование структур активных центров моноаминоксидаз А и Б и поиск новых ингибиторов моноаминоксидазы А

• Автор: Тихонова, Ольга Валентиновна
• Шифр специальности: 03.00.04
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2001
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 114 с.

СПИСОКСОКРАЩЕНИЙ

АА анилия 5аланина

ВИЧ вирус иммунодефицита человека

КЭА карбобснзокситгиламнн

КЭДА карбобекзокснэтиддиамни

МАО моноамимоксидаза

МФГП мсшлфснилтетрягнлропирндин

ФАД фдавннздсниндинуклеотил

I i I

iv i i сравнительный анализ

молекулярных полей

I iv iii Ii i сравнительный анализ
индексов молекулярного сходства

i база данных белков
iiv сумма квалхнов ошибок предсказания
iiv ivi ii количественная взаимосвязь
структураактивность
3 ii трехмерный
iiv ii ii количественная взаимосвязь
структураметаболизм
iiv ii ii количественная взаимосвя зь
с груктурас койстна
i среднеквадратичное смешение
семикарбазидчувс I вительная амннокендаза
ОГЛЛВ.1ЕНЕ
Введение


Охарактеризовать структуры активных центров МАО Л и МЛО Б метолом ЯАЯ с СоМРА с использованием трех рядов ингибиторов, отличающихся механизмом действия и относящихся к разным химическим классам веществ 2 Разработать метод моделирования полости активного центра фермента с неизвестной трехмерной структурой н построить модели активных центров МАО А и К. Впервые фермент, осуществляющий дезаминирование субстратов, был выделен и охарактеризован Хэйр в году. Она обнаружила его в тканевом экстракте кролика и назвала этот фермент тираиинокендазой. Следующие аминоксидазы были описаны разными авторами в году, и названы алифатической аминоксидатой и адрсналиноксидатой. В том же году Блашко с сотрудниками показали, что все эти три фермента являются одним и тем же белком и ввели для них название аминоксилаза. Позже это название было изменено на моноаминоксиаазу ЕС I 4. ЕС 1. Аминоксидазы широко распространены в живых организмах Они обнаружены у прокариот и эукариот. У бактерий например ii i это периплазматичсский фермент, содержащий в качестве кофакторов хинон н двухвалетгтную медь . Из нитевидных грибов i были выделены две различные аминоксидазы. Одна из них идентична медьсодержатей аминоксидазе с 6гидроксидофахиноном в качестве кофактора н активном цеггре. Другая является флавопротенном кДа. Предполагают, что этот фермент, названный МАО . ФАДсодержаших ферментов МАО А и МАО Б ii Сингер и др. Хотя существует мнение, что молекулярные свойства МАО слишком сильно отличаются от МАО А и Б, чтобы рассматривать ее в качестве эволюционного предшественника МАО млекопитающих Веселовский и др . Кроме того в печени форели была обнаружена чоноаминокемдаза. МАО. Экспрессированная в 7 клетках МАО форели одинаково эффективно окисляла диагностические субстраты для МАО А и Ь и была менее чувствительна к характерным селективным ингибиторам этих ферментов Такие свойства МАО форели могут указывать на то, что она является новым типом фермента . В настоящее время у млекопитающих обнаружено три типа аминоксидаз моноаминоксидозы типа А и Ь и сем и карбазидчувствительная аминоксилаза i . Сквайерс, . Уже точно установлено, что МАО А и Б млекопитающих являются разными ферментами, которые кодируются различными генами, находящимися в коротком плече Ххромосомы. Гены МАО А и Б состоят из экзонов и нитронов и имеют идентичную экзонинтронную организацию i . Транслированные с кДК последовагелыюсги МЛО Л и МЛО Б, оказались разных размеров. МАО Л содержит 7 аминокислотных остатков . Да,а МАО Б 0 аминокислотных остатков ,8 кДа , . Эти белки отличаю гея по субст ратной специфичности и чувствительности к различным ингибиторам Северина. Чувствительность этого фермента к ингибированию ссмнкарбозидом, предполагает наличие в активном центре кофактора с реактивной карбонильной группой пкридоксвльфосфат, пнроллохнполин хннон, 6гидроксидофа Этот фермент является медьзавиенмым ферментом , i, . Возможно, кроме дезаминирования эндогенных полиаминов, этот фермент выполняет функцию, сходную с микросомальными ферментами печени, мегаболизирующмми лекарс ва i . Моноахшноксидазы типа А и Б млекопитающих являются интегральными белками внешней мембраны митохондрий. Встраивание МАО Б в мембрану лроисходтп но АТФзависимому механизму . Известно, что МАО связывается с мембраной Сконцевым доменом, который содержит гидрофобную область, примыкающую к положительно заряженным аминокислотам. В мембране МАО существует в виде димера, во для проявления активности т vi достаточно наличия одной субъединицы , . Моноамннокендзза довольно широко представлена во многих тканях нервной системы и периферических органов. В одних тканях присутствуют обе формы МАО. Например, человеческая плацента содержит в основном МАО А и незначительное количество МАО Б, лимфоциты и тромбоциты только МАО Б табл I . Содержание МАО А и Б может варьировать также в тканях одной системы. Так распределение МАО в тканях нервной системы показано в таблице 2. Иммуногистохимичсскис исследования показали, что МАО А н основном локализуется в катехолэргических нейронах, тогда как МАО Б в ссротонннэрпшсских К . Таблица 1. Распределение МЛО в организме человека. Веку, . Таблица 2. Концентрации МАО типа А и 1 пмольмг белка в мембранном препарате из различных участков мозга Сс.