Исследование ассоциации ряда генов-кандидатов с диабетической полинейропатией при сахарном диабете типа 1

• Автор: Спицина, Екатерина Валентиновна
• Шифр специальности: 03.00.03
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2008
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 117 с. : ил.

ОГЛАВЛЕНИЕ
СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ ОГЛАВЛЕНИЕ ВВЕДЕНИЕ Актуальность проблемы Цели и задачи работы Научная новизна работы Практическая ценность рабо ты 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1. Полиморфные маркеры

1.1.1. Типы полиморфизмов и методы их исследования

1.1.2. Использование полиморфных маркеров в исследовании генетики многофакторных заболеваний
1.2. Общие представления об этиологии, классификации, эпидемиологии и патогенезе сахарного диабета типа 1 СДтипа

1.2.1. Этиология СД типа

1.2.2. Классификация СД типа

1.2.3. Эпидемиология СД типа

1.2.4. Патогенез СД типа

1.3. Хронические сосудистые осложнения СДтипа 1 диабетические ангиоиатии

1.3.1. Роль гипергликемии в развитии диабетических микроангиопагий
1.3.2. Роль генетических факторов в развитии диабетических ангиопатий
1.4. Диабетическая нейропатия
1.4.1. Классификация диабетической нейропатии
1.4.2. Патогенез диабетической полинейропатии
1.4.3. Метаболические шфушения при диабетической полинейропатии
1.4.4. Сосудистые повреждения при диабетической полинейропатии
1.4.5. Роль генетических факторов риска развития диабетической полинейропатии
1.5. Характеристика исследованных в работе генов и полиморфных маркеров
1.5.1. Ген белкасупрессора раковых опухолей ТР
1.5.2. Ген ЫОсинтстазы клеток эндотелия ЛОХЗ
1.5.3. Ген псроксидазы глутатиона 3 ОРХЗ
1.5.4. Гсн 3субъединицы белка 3
1.5.5. Ген, кодирующий переносчик ЛТФЛДФ типа 1 1
1.5.6. Ген, кодирующий хеликазу мтДНК
1.5.7. Ген, кодирующий ДНКполимеразу гамма 1 1
1.5.8. Г ен, кодирующий полиАДФрибозилполимеразу 1
2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
2.1. Реактивы и ферменты
2.2. Буферные растворы
2.3. Формирование групп обследованных
2.4. Выделение геномной ДИК человека методом фенолхлороформной
экстракции
2.5. Амплификация ДНК
2.6. Расщепление продуктов ПЦР рестриктазами
2.7. Электрофоретическое разделение ДНК
2.8. Статистическая обработка результатов
2.8.1. Сравнение выборок по частотам аллелей и генотипов. Точный критерий Фишера
2.8.2. Оценка относительного риска. i. Доверительный интервал
2.9. Общая характеристика исследованных групп
3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ИХ ОБСУЖДЕНИЕ
3.1. Исследование ассоциации полиморфных маркеров геновкандидагов е ДПН при СД типа
3.1.1. Исследование ассоциации полиморфных маркеров С4СС и гена ГР с ДПН при СД типа 1.
3.1.2. Исследование ассоциации полиморфного маркера Т6С гена 3 с ДПН при СД типа I.
3.1.3. Исследование ассоциации полиморфною маркера гена X3 с ДПН при СД типа 1.
3.1.4. Исследование ассоциации полиморфного маркера С5Т гена 3 с ДПН при СДтипа I.
3.1.5. Исследование ассоциации полиморфного маркера гена с ДПН при СДтипа I.
3.1.6. Исследование ассоциации полиморфного маркера 5 гена 1 с ДПН при СД типа 1.
3.1.7. Исследование ассоциации полиморфного маркера Т5С гена РОЮ с ДПН при СД типа 1.
3.1.8. Исследование ассоциации полиморфных маркеров УаЧо и ЬеиРИе гена ЛОРЯТ с ДПН при СДтипа 1.
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
ВВЕДЕНИЕ
Актуальность


ТбС гена 3, А гена X3, С5Т гена 3, гена , 5 гена Т5С гена , V2 и гена 1 с диабетической полинейропатией при сахарном диабете типа 1 у русских пациентов, проживающих в г. Москве. Практическая ценность работы. Выявление аллельных вариантов полиморфных маркеров различных геповкандидатов, обуславливающих повышенный генетический риск развития ДПН при СД тина 1. Полиморфные маркеры. Типы полиморфизмо и методы их исследования. В связи с расширением технических возможностей молекулярной биологии и достижениями в изучении генома человека расшифровка протяженных нуклеотидных последовательностей, картирование генов, изучение их структуры, полиморфизма, регуляции экспрессии и т. Широко применяются в современной молекулярной генетике заболеваний полиморфные маркеры т. Поиск полиморфных маркеров заболевания это перспективный подход к оценке генетической предрасположенности к мультифакториым генетическим заболеваниям. Полиморфизм представляет собой наличие нескольких аллельных вариантов гена или участка ДНК. В настоящее время найден полиморфизм в митохондриальной и ядерной ДНК, в кодирующей и не кодирующей частях последней, в ее уникальных и повторяющихся последовательностях Алтухов. Однонуклсотидныс полиморфизмы i i i. Полиморфизм типа вставкаотсутствие вставки 1 iii. Повторяющиеся последовательности ДНК делятся на высокоиовторяющисся свыше 0 иле. Первые два типа объединяют в группу так называемых рассеяных последовательностей классов I и I, разбросанных по всему геному в виде единичных мотивов. Последовательности класса I состоят из рассеянных элементов длиной мснсе 0 п. I входят мотивы размером свыше 0 п. Примером последних могут служить повторы типа 1 Крп, варьирующие по длине от 0. Другой большой группой повторяющихся последовательностей являются тандемные повторы. Они составляют в среднем около генома человека и состоят из следующих друг за другом повторяющихся нуклеотидных звеньев с некоторой общей последовательностью. Мнкро и мпнисателлитныс последовательности состоят из тандемно пошорснных копий так называемых короных от английского последовательностей длиной от двух до нескольких тысяч пар оснований. Микросателлиты это класс нуклеотидных повторов, включающих от двух до пяти звеньев с размером повторяющегося участка мотива нуклеотидов i, . Размер повторяющихся единиц в минисателлитных последовательностях может меняться от 9 до 0 нуклеотидов , . Отличительной особенностью микро минисателлнтов является наличие среди них большою количества участков, вариабельных по числу копий в кластере варьирующие по числу тандемные повторы V, vi . Индивидуальные аллели таких локусов отличаются друг от друга числом тандемно повторяющихся копий. Количество высокоизменчивых микро и минисателлитных последовательностей в геноме человека, повидимому, превышает несколько десятков тысяч они достаточно плотно и равномерно расположены в каждой из хромосом i, . Микросателлиты, обозначаемые так же или i также обладают высоким уровнем полиморфизма, исходя из числа коровых единиц. Подобно другим повторам, обычно встречаются в искодирующих часях генов, однако, изменение числа этих повторов в строну их увеличения может приводить к нарушению функции генов вплоть до полного блока экспрессии и быть причиной ряда тяжелых наследственных заболеваний i, . В зависимоси от длины повторяющегося звена . Подавляющее большинство ли и более нуклеотидных микросателлитов полиморфны. Повторяющиеся мотивы С Ап являются самыми распространенными среди дипуклеотидных повторов в геноме млекопитающих ii, . В ДНК человека предположительно насчитывается от до 0 гыс. СЛ, содержащих от до звеньев, т. Функции повторов СЛП не известны, но предполагается, что они являются горячими точками рекомбинации и содержат эихансерные участки, усиливающие экспрессию генов. Ди, тетра и пентануклеотидные мнкросателлнты отмечены только в некодирующих участках генов и в межгенных областях ДНК. В экзонах обнаружены лишь тримерные тандемные повторы. Тетрануклеотндные мотивы чипа ЛЛАТ или , обогащенные осатками аденозина.