Изменение метилирования промоторных областей семи генов хромосомы 3 человека в эпителиальных опухолях

• Автор: Ходырев, Дмитрий Сергеевич
• Шифр специальности: 03.00.03
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2009
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 137 с. : ил.

СОДЕРЖАНИЕ

Список сокращений

ВВЕДЕНИЕ.

1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1. Онкогены и генысупрсссоры опухолевого роста. у

1.2. Современные ПОДХОДЫ К поиску НОВЫХ ОНКОЗНаЧИМЫХ генов

1.2.1. Анализ аллельных делений

1.2.2. Участки хромосомы, подавляющие рост опухоли

1.2.3. Вычитающая гибридизация как способ очбора онкогенов и геновсунрессоров опухолевого роста.

1.2.4. Применение микропанелей для поиска онкозначимых

1.3 Эпигенетическая регуляция экспрессии генов в опухоли.

1.3.1 Метилирование ДНК
1.3.2. СрОостровки в геноме человека
1.3.3. Гипомсгилированис генома опухолей.
1.3.4. Гиперметилирование СрОостровков в геноме опухолей
1.3.5. Эпигенетические механизмы инактивации генов.
1.3.6. МикроРНК человека и канцерогенез
1.4. Подходы к анализу метилирования промоторных районов генов в эпителиальных опухолях
1.5. Гены на коротком плече хромосомы 3, предположительно связанные с онкогенезом.
1.5.1. Ген ЯШТУ1 3р.3
1.5.2. Ген ЖШЗВ 3р.3.
1.5.3. Ген МЯЬеш 2 3рр.3.
1.5.4. Ген ЯНОЛАЯНЛ 3р..
1.5.5. Ген иБР4 Зр.
1.5.6. Ген СРХ1 3р.
1.5.7. Ген Л5 Зр.2
2. МАТЕРИАЛЫ И М ЕТОДЫ.
2.1. Сбор материала
2.2. Выделение геномной ДНК из ткани.
2.3. Анализ метилирования ДНК с применением метил чувствительных рестриктаз МЧРА
2.4. Бисульфитная конверсия ДНК
2.5. Бисульфитное секвснирование.
2.6. Метилспсцифичная полимеразная цепная реакция МСПЦР
2.7. Статистическая обработка результатов
3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ
3.1 Гиперметилирование иромоторного района гена ЛЛРЛ в опухолях разных локализаций, связь с прогрессией рака.
3.2 Два Срвостровка гена БЕМЛЗВ метилирование в опухолях разных локализаций и связь с прогрессией рака.
3.3. Метилирование промоторного района гена КАКЬеЮ2 в опухолях
разных локализаций, связь с прогрессией рака.
3.4. Анализ метилирования иромоторного района гена КПОААЯНА в опухолях разных локализаций, связь с прогрессией рака
3.5. Анализ метилирования промоторного района гена и8Р4 в
опухолях разных локализаций, связь с прогрессией рака
3.6. Анализ метилирования промоторного района гена СРХ1 в
опухолях разных локализаций, связь с прогрессией рака Ю
3.7. Изменение метилирования 3х участков протяженного СрСостровка в промоторном районе гена ЛТК1ЯА в опухолях разных локализаций,
связь с прогрессией рака.
3.8. Предпосылки для разработки новых диагностических и прогностических онкомаркеров.
ВЫВОДЫ.
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ


Так, хромосомные транслокации приводят к тому, что протоонкоген попадает под контроль действующего промотора и начинает работать непрерывно, не позволяя клетке выйти из цикла делений туе, или направляя непрерывные сигналы от мембраны в ядро , или стимулируя синтез ростовых факторов, посылающих той же клетке сигналы к делению аутокринная стимуляция Копнан, . Воздействие канцерогенными веществами и облучением вызывает мутации в различных генах, в том числе и в протоонкогенах. К белковым продуктам протоонкогенов относятся факторы роста например, i, рецепторные и нерецепторные тирозинкиназы, цитоплазматические сериновые киназы, ассоциированные с мембраной белки активируемые связыванием ГТФ, факторы транскрипции и другие регуляторы Татосян, , . Продукты многих протоонкогенов участвуют в передаче сигналов через мембрану и внутри клетки, что осуществляется через каскад процессов фосфорилирования. Важно, что многие протоонкогены включены в разнообразные сигнальные пути и их пересечения Vi i, . Отсюда становится понятной частая встречаемость нарушений в протоонкогенах в самых разных новообразованиях, их мутации позволяют за один шаг преодолеть несколько важных этапов опухолевой прогрессии и придать неопластической клетке сразу несколько необходимых свойств. К настоящему времени картирован и клонирован целый ряд генов, вовлеченных в канцерогенез и выполняющих функцию геновсупрессоров наиболее известные из них приведены в табл. Особенностями гсновсупрсссоров и их роли в канцерогенезе является, вопервых, тот фаю, что для проявления этих генов необходима гомозиготность для осуществления их функции. Вовторых они подавляют активность онкогенов и отправляют клетку в апоптоз или подавляют пролиферацию, вызванную онкогеном. Втрстьих, мутации в генахсупрсссорах встречаются при эпителиальном раке чаще, чем в онкогенах. Вчетвертых, канцерогенез у человека, как правило, включает подавление геновсупрессоров. Впятых, роль геновсупрессоров в возникновении гемобластозов существенно меньше таковой в карциномах . Абелев, . Генысупрессоры опухолевого роста, по их месту в системе функционирования эукариотической клетки, можно разделить на две большие группы i Vi, . Классические принимают непосредственное участие в процессе деления клеток, контролируя их вступление в ту или иную фазу клеточного цикла. Эти гены получили название геновхранителей клеточного цикла . Они могут участвовать в защите ткани от пролиферации посредством апоптоза на разных стадиях малигнизации v V, . Важную роль в подавлении роста опухолей играют и , обеспечивающие межклеточные контакты и взаимодействия . ii i, . Таблица 1. Примеры геновсупрессоров опухолевого роста. I Контролирует вход в фазу, регулируя активность фактора транскрипции 2 Копнин, . Р Транскрипционный фактор регулирует клеточный цикл, рост и дифференцировку клеток апоптоз i . IV1 рЗ Фактор транскрипции связываясь с р, активирует транскрипцию рреспонсивных генов . АРС 5 Транскрипционная регуляция клеточного цикла и адгезии iv . Рак толстой и прямой кишки, поджелудочной железы, Нотта . 1 1 егативная регуляция белков регуляция азной акгивности . . 2 2 Регуляция клеточного роста и пролиферации слеток, регуляция тирозинкиназной активности i . V 3 Регуляция клеточного цикла . 2 брЗ. З Регулирование 1 активности ii . 1 . . 2 1 Учасгис в передаче . Рак толстой и прямой кишок, поджелудочной железы , рак шейки матки Киселев, i . 4 2 . Участие в передаче X3. . Серинтреонин киназа . Е кадхерии . 1 I7 Регуляция транскрипции и репарации ДНК . Опухоли яичников и молочной железы . . Наследствен ный рак молочной железы М1га1ет е1 а1. 2 Репарация двойных разрывов ДНК . Опухоли яичников и молочной железы i . I 3 гомолог репарация ошибок 1 Гринадлежит семейству АТФаз . МАР2К4 . Регуляция дифференцировки клеток, апоптоз , . 1 .