Сравнительный анализ геномов бактерий видов Burkholderia pseudomallei и B. mallei методом вычитающей гибридизации

• Автор: Фушан, Алексей Анатольевич
• Шифр специальности: 03.00.03
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2005
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 171 с.

1. Эпидемиология мелиоидоза

2. Бактерии вида В. i, как этиологические агенты мелиоидоза

2.1 Классификация и филогенез

2.2. Экологические особенности вида.

2.3. Краткая характеристика молекулярных основ патогенеза при мелиоидозе

2.4. Популяционное разнообразие В. i.

2.5. Особенности организации генетического аппарата В. i в сравнении с В. i.

2.6. Факторы вирулентности В. i

2.6.1 Механизмы устойчивости к активным формам кислорода.

2.6.2 Системы секреции.

2.6.3 Экзополисахариды.

2.6.4 Соединения, обладающие цитопатическим аффектом.
2.6.5 Флагеллы, пили.
2.6.6 Адгвзины.
2.6.7 Устойчивость к антимикробным препаратам
3. Диагностика мелиоидоза.
3.1. Исследования серологического статуса
3.2. Бактериологические методы исследований.
3.3. Иммуногистохимические методы.
3.4. Биохимические тесты
3.5. Полимеразная цепная реакция
3.6. Комбинированные методы исследований
3.7. Методы молекулярного тилирования бактерий вида В. i.
Заключение.
ГЛАВА II. РЕЗУЛЬТАТЫ И ИХ ОБСУЖДЕНИЕ
Введение


Эти бактерии также содержатся, хотя и в гораздо меньшем количестве, чем представители биотипа Ага, в природных резервуарах Таиланда, северной Австралии и других эндемичных регионов ,,,2. Филогенетически близким к В. В. i 0. Представители этого вида являются этиологическими агентами зоонозов лошадей, ослов и мулов 7,6,0. С тех пор, как этих однокопытных перестали повсеместно использовать в качестве транспортной силы, случаи заболевания, известного как сап, среди людей резко сократились 0. В настоящее время единичные спорадические случаи заболевания регистрируются в странах дальнего и ближнего Востока, Северной Африке, юговосточной Европе и у лабораторного персонала, непосредственно контактирующего с возбудителем ,3,3. Однако, сап попрежнему остается серьезным и часто фатальным ветеринарным заболеванием 6,3. Представители видов В. В. i имеют схожие антигенные и генетические характеристики ,,9. Так, их рРНК гены идентичны, а различия в структуре рРНК генов составляют несколько пар нуклеотидов ,3. Оантигсны ,,,8. По данным сравнительного анализа консервативных генов некоторые исследователи считают В. В. i . Однако, последние исследования демонстрируют и существенные отличия этих микроорганизмов друг от друга на генетическом уровне. Например, найдены существенные различия в распределении кластера секреторных генов 3 типа 2. Сравнение геномов В. ЛТСС 4 и В. К3 показало, что совокупные различия их геномов составляют около 9. Болес того, представители вида II. В. i и от непатогенного В. Таким образом, если В. В. i и имели общего предшественника, то время независимой эволюции этих видов бактерий достаточно велико, чтобы накопить такие существенные структурные различия. В. i, грамотрицательные подвижные бациллы, являются почвенными сапрофитами, населяющими ризосферу и водные резервуары северовосточного Таиланда, северной Австралии и других областей земного шара с тропическим и субтропическим климатом ,,3,3. В естественных условиях среды обитания эти микроорганизмы способны существовать в двух формах, находящихся в динамичном равновесии друг с другом в свободноживущей форме и в форме биопленки 1. На настоящий момент не известно, какие внешние сигналы модулируют переход из одной формы существования в другую 1. Биопленка обеспечивает большую устойчивость бактерий к неблагоприятным факторам внешней среды ,. Также, в биопленке может происходить интенсивный обмен генетической информацией между отдельными членами популяции . Находясь в неподвижной форме бактерии могут становиться питательным субстратом для , в большом количестве населяющих ризосферу ,0,1. В. рзеиВотаг1 в естественных условиях среды обитания . Важным звеном в рециркуляции В. Ш в природе являются животные . Носителями бацилл В. Иег могут быть крысы, мышевидные грызуны, кролики, коровы, собаки, кошки и кенгуру. В животных бактерии попадают вместе с контамннированными кормами и водой. Инфицированные животные выделяют бациллы с мокротой, гноем, мочой и фекалиями. В результате, происходит заражение новых территорий. Неизвестно, могут ли членистоногие и перепончатокрылые паразиты обеспечивать передачу В. Зотае1 среди животных . К факторам среды обитания, способным оказывать влияние на численность природных субпопуляций В. Оптимальной температурой роста бактерий В. С . С этим связано то, что В. Бактерии способны сохранять жизнеспособность до месяцев в почве и дистиллированной воде в лабораторных условиях 3,7. Ряд исследователей отмечают, что микроорганизмы не способны расти при температуре окружающей среды ниже С . Тем не менее, бациллы В. Ш сохраняют свою жизнеспособность в течение длительных промежутков времени при температуре С 7. Некоторые штаммы В. Ш способны выживать более чем 0 дней при температуре окружающей среды 5 С 2. Следствием такой жизнестойкости, является способность микроорганизма к длительному персисгированию в природных резервуарах неэндемичных регионов с относительно холодным климатом . Хотя с определенностью установлено, что структура почвы и удаленность от поверхностного слоя также способны влиять на численность популяции бактерий В.